More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0173 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_0173  phosphatase, Ppx/GppA family  100 
 
 
498 aa  1001    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.86777  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0402  Ppx/GppA family phosphatase  61.12 
 
 
486 aa  589  1e-167  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.719278  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0377  Ppx/GppA family phosphatase  61.12 
 
 
486 aa  588  1e-167  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1606  Ppx/GppA family phosphatase  60.92 
 
 
486 aa  586  1e-166  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0245  phosphatase  48.09 
 
 
492 aa  467  9.999999999999999e-131  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.075442  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0978  fumarate reductase  50.3 
 
 
482 aa  459  9.999999999999999e-129  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0786435  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1691  nucleoside diphosphate kinase  49.09 
 
 
482 aa  456  1e-127  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0110463  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0748  phosphatase  46.57 
 
 
482 aa  439  9.999999999999999e-123  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.527588  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0232  Ppx/GppA phosphatase  45.45 
 
 
488 aa  410  1e-113  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0661  Ppx/GppA phosphatase  39.52 
 
 
489 aa  342  9e-93  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4617  Ppx/GppA phosphatase  29.07 
 
 
502 aa  193  7e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0819  Ppx/GppA phosphatase  28.41 
 
 
500 aa  182  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0278  Ppx/GppA phosphatase  27.55 
 
 
501 aa  179  1e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00854606  normal  0.782575 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1192  Ppx/GppA phosphatase  27.76 
 
 
500 aa  171  3e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1243  Ppx/GppA phosphatase  26.92 
 
 
501 aa  169  8e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.085362 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1197  Ppx/GppA phosphatase  27.1 
 
 
502 aa  169  1e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.639933 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0972  Ppx/GppA phosphatase  29.4 
 
 
520 aa  167  5.9999999999999996e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1179  Ppx/GppA phosphatase  26.74 
 
 
507 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2578  Ppx/GppA phosphatase  30.02 
 
 
506 aa  163  6e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2046  exopolyphosphatase  24.7 
 
 
510 aa  136  9.999999999999999e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.941152  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2105  Ppx/GppA phosphatase  26.23 
 
 
497 aa  133  6.999999999999999e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000081594  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2821  Ppx/GppA phosphatase  27.6 
 
 
312 aa  130  6e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0231  Ppx/GppA phosphatase  27.03 
 
 
544 aa  127  6e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.448988 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2542  Ppx/GppA phosphatase  30.46 
 
 
533 aa  126  8.000000000000001e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.916187  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2160  Ppx/GppA phosphatase  27.38 
 
 
509 aa  126  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.7415  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2180  Ppx/GppA phosphatase  29.25 
 
 
317 aa  124  3e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1965  exopolyphosphatase  25.4 
 
 
549 aa  124  5e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.363541  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2448  Ppx/GppA phosphatase  28.62 
 
 
311 aa  123  6e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1033  Ppx/GppA phosphatase  24.94 
 
 
505 aa  122  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.35316  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0039  Ppx/GppA phosphatase  26.46 
 
 
499 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.935227  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1634  Ppx/GppA phosphatase family protein  25.5 
 
 
502 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.505763  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0244  exopolyphosphatase  31.35 
 
 
321 aa  122  1.9999999999999998e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1083  Ppx/GppA phosphatase  26.08 
 
 
570 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.376324  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2559  exopolyphosphatase, putative  26.02 
 
 
513 aa  121  3e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3848  Ppx/GppA phosphatase  28.81 
 
 
499 aa  121  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1916  Ppx/GppA phosphatase family protein  25.5 
 
 
502 aa  121  3e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.050324  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1593  Ppx/GppA phosphatase  28.76 
 
 
529 aa  120  7e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3530  Ppx/GppA phosphatase  26.11 
 
 
550 aa  119  9e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.984084 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06591  putative exopolyphosphatase  24.03 
 
 
548 aa  119  9e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0495  Ppx/GppA phosphatase  25.52 
 
 
517 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.813676 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0739  Ppx/GppA phosphatase  26.67 
 
 
506 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1857  Ppx/GppA phosphatase  25.9 
 
 
548 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2586  Ppx/GppA phosphatase  27.91 
 
 
311 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.495242  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0623  exopolyphosphatase  24.31 
 
 
545 aa  117  5e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.797716  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2990  Ppx/GppA phosphatase  25.26 
 
 
519 aa  117  6e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04821  putative exopolyphosphatase  28.21 
 
 
531 aa  117  6.9999999999999995e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.467797  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1120  Ppx/GppA phosphatase  27.72 
 
 
506 aa  116  7.999999999999999e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04581  putative exopolyphosphatase  26.09 
 
 
539 aa  115  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2951  Ppx/GppA phosphatase  29.43 
 
 
501 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1953  Ppx/GppA phosphatase  24.24 
 
 
491 aa  116  1.0000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2438  Ppx/GppA phosphatase  26.3 
 
 
513 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.118104  hitchhiker  0.00776176 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0782  Ppx/GppA phosphatase  26.3 
 
 
513 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0489  Ppx/GppA phosphatase  27.16 
 
 
527 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3457  Ppx/GppA phosphatase  29.43 
 
 
501 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.15102  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0981  Ppx/GppA phosphatase  26.07 
 
 
420 aa  115  2.0000000000000002e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.883585  normal  0.144641 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05131  putative exopolyphosphatase  27.25 
 
 
531 aa  114  3e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0423  exopolyphosphatase, putative  26.6 
 
 
519 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0397  Ppx/GppA phosphatase  28.85 
 
 
513 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1993  Ppx/GppA phosphatase  25.66 
 
 
519 aa  114  5e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2062  exopolyphosphatase, putative  27.04 
 
 
312 aa  113  7.000000000000001e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0457  putative exopolyphosphatase  27.37 
 
 
531 aa  113  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.337159  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2543  Ppx/GppA phosphatase  29.09 
 
 
512 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.223517  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1160  Ppx/GppA phosphatase  26.05 
 
 
550 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2114  Ppx/GppA phosphatase  28.86 
 
 
503 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.21968  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05201  putative exopolyphosphatase  26.96 
 
 
531 aa  112  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2422  Ppx/GppA phosphatase  25.08 
 
 
311 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2696  Ppx/GppA phosphatase  27.55 
 
 
512 aa  110  5e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00554576  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1739  guanosine-5'-triphosphate,3'-diphosphate diphosphatase  23.23 
 
 
532 aa  110  6e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.22047  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0743  Ppx/GppA family phosphatase  30.19 
 
 
512 aa  110  6e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1456  Ppx/GppA phosphatase  25.4 
 
 
553 aa  110  6e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.240113 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2493  Ppx/GppA phosphatase  28.09 
 
 
501 aa  110  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.170096  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1955  Ppx/GppA phosphatase  26.98 
 
 
523 aa  110  8.000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0958558 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1303  Ppx/GppA phosphatase  27 
 
 
513 aa  110  8.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1593  Ppx/GppA phosphatase  27 
 
 
513 aa  110  8.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.229117  normal  0.0470095 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0201  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  25.87 
 
 
498 aa  109  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2019  exopolyphosphatase, putative  25.74 
 
 
312 aa  109  1e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1892  Ppx/GppA phosphatase  25.11 
 
 
502 aa  109  1e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2330  Ppx/GppA phosphatase  27.52 
 
 
501 aa  109  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.529656 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1789  putative exopolyphosphatase  26.62 
 
 
544 aa  108  2e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.810374  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1628  exopolyphosphatase  27.51 
 
 
326 aa  108  2e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.497558  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0215  Ppx/GppA phosphatase  25.58 
 
 
509 aa  108  2e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4044  Ppx/GppA phosphatase family protein  27.87 
 
 
512 aa  107  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.133134  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0749  Ppx/GppA family phosphatase  29.87 
 
 
512 aa  108  3e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05121  putative exopolyphosphatase  26.16 
 
 
544 aa  107  4e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.434231 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0334  exopolyphosphatase  27.54 
 
 
307 aa  107  4e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4014  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  25.68 
 
 
498 aa  107  5e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0154  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  25.9 
 
 
500 aa  107  6e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3325  Ppx/GppA phosphatase  28.27 
 
 
498 aa  107  6e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.855451  normal  0.415748 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0498  Ppx/GppA phosphatase  26.6 
 
 
521 aa  107  6e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2570  Ppx/GppA phosphatase  24.54 
 
 
513 aa  107  7e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4116  Ppx/GppA phosphatase family protein  27.63 
 
 
511 aa  106  8e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000884686  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3752  exopolyphosphatase, Ppx/GppA phosphatase  27.87 
 
 
512 aa  106  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.319626  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0880  Ppx/GppA phosphatase  26.08 
 
 
513 aa  106  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000414352 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3904  Ppx/GppA phosphatase family protein  27.87 
 
 
512 aa  105  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.284574  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3736  exopolyphosphatase, Ppx/GppA phosphatase  27.87 
 
 
512 aa  105  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.249397  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0592  Ppx/GppA phosphatase  24.71 
 
 
519 aa  105  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4209  Ppx/GppA phosphatase family protein  27.87 
 
 
512 aa  105  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0697  Ppx/GppA phosphatase  30.23 
 
 
301 aa  105  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000153349  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4099  Ppx/GppA phosphatase family protein  27.87 
 
 
524 aa  105  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4011  Ppx/GppA phosphatase family protein  27.87 
 
 
512 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>