More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0098 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_0098  histidinol dehydrogenase  100 
 
 
426 aa  860  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  7.36266e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1770  histidinol dehydrogenase  67.76 
 
 
428 aa  551  1e-156  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.381654  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1951  histidinol dehydrogenase  67.29 
 
 
428 aa  550  1e-155  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0222803  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1585  histidinol dehydrogenase  67.06 
 
 
428 aa  548  1e-154  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0703  histidinol dehydrogenase  56.78 
 
 
431 aa  502  1e-141  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003848  histidinol dehydrogenase  57.14 
 
 
430 aa  501  1e-140  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01831  histidinol dehydrogenase  55.5 
 
 
436 aa  492  1e-138  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1622  histidinol dehydrogenase  56.1 
 
 
434 aa  491  1e-138  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.426183 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1134  histidinol dehydrogenase  56.67 
 
 
431 aa  491  1e-137  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1212  histidinol dehydrogenase  56.57 
 
 
434 aa  490  1e-137  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2311  histidinol dehydrogenase  56.34 
 
 
434 aa  489  1e-137  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.6226  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2632  histidinol dehydrogenase  55.4 
 
 
434 aa  490  1e-137  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.597008  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1637  Histidinol dehydrogenase  56.57 
 
 
434 aa  491  1e-137  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.140746  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2159  histidinol dehydrogenase  56.1 
 
 
434 aa  488  1e-137  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01908  hypothetical protein  56.34 
 
 
434 aa  489  1e-137  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2953  histidinol dehydrogenase  56.1 
 
 
434 aa  485  1e-136  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.525891  hitchhiker  7.25252e-09 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2251  histidinol dehydrogenase  54.46 
 
 
434 aa  481  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.849877  normal  0.226426 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2298  histidinol dehydrogenase  54.46 
 
 
434 aa  481  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.219652  normal  0.0600324 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1040  histidinol dehydrogenase  55.63 
 
 
434 aa  484  1e-135  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.204161 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01922  histidinol dehydrogenase  57.7 
 
 
413 aa  481  1e-135  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2197  histidinol dehydrogenase  54.46 
 
 
434 aa  481  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2300  histidinol dehydrogenase  54.23 
 
 
434 aa  479  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0711798 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2410  histidinol dehydrogenase  54.46 
 
 
434 aa  481  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.426978  hitchhiker  0.000337345 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1744  histidinol dehydrogenase  54.93 
 
 
442 aa  478  1e-134  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0770175  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2011  histidinol dehydrogenase  54.69 
 
 
442 aa  477  1e-133  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.862973  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1615  histidinol dehydrogenase  53.52 
 
 
435 aa  478  1e-133  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.217176 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2330  histidinol dehydrogenase  54.93 
 
 
436 aa  478  1e-133  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0874985  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1656  histidinol dehydrogenase  53.97 
 
 
435 aa  472  1e-132  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.554535  normal  0.968546 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2198  histidinol dehydrogenase  54.44 
 
 
443 aa  457  1e-127  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0308106 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2228  histidinol dehydrogenase  53.05 
 
 
436 aa  452  1e-126  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156171  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2457  histidinol dehydrogenase  52.8 
 
 
442 aa  451  1e-125  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1942  histidinol dehydrogenase  53.97 
 
 
435 aa  449  1e-125  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2091  histidinol dehydrogenase  52.8 
 
 
433 aa  449  1e-125  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.538657  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0404  histidinol dehydrogenase  50.94 
 
 
437 aa  449  1e-125  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2526  histidinol dehydrogenase  50.94 
 
 
443 aa  447  1e-124  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3170  histidinol dehydrogenase  50.94 
 
 
443 aa  447  1e-124  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.992848 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1853  histidinol dehydrogenase  53.7 
 
 
433 aa  447  1e-124  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.553413  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2429  histidinol dehydrogenase  50.94 
 
 
443 aa  447  1e-124  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1799  histidinol dehydrogenase  53.24 
 
 
433 aa  444  1e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2178  histidinol dehydrogenase  53.01 
 
 
433 aa  443  1e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2542  histidinol dehydrogenase  52.21 
 
 
439 aa  440  1e-122  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.348533  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2881  histidinol dehydrogenase  52.11 
 
 
438 aa  439  1e-122  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.153344  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1617  histidinol dehydrogenase  50.93 
 
 
438 aa  436  1e-121  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01117  Histidinol dehydrogenase  51.4 
 
 
434 aa  436  1e-121  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2073  histidinol dehydrogenase  51.72 
 
 
438 aa  437  1e-121  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1719  histidinol dehydrogenase  51.05 
 
 
429 aa  438  1e-121  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1932  histidinol dehydrogenase  50.23 
 
 
433 aa  427  1e-118  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.518921 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2426  histidinol dehydrogenase  50.23 
 
 
433 aa  427  1e-118  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2179  histidinol dehydrogenase  50.23 
 
 
433 aa  426  1e-118  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2419  histidinol dehydrogenase  50.23 
 
 
433 aa  426  1e-118  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09011  putative histidinol dehydrogenase  51.28 
 
 
429 aa  427  1e-118  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1141  histidinol dehydrogenase  51.76 
 
 
422 aa  428  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.517537  normal  0.0197724 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2537  histidinol dehydrogenase  50.23 
 
 
433 aa  427  1e-118  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0257912 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1818  histidinol dehydrogenase  51.05 
 
 
429 aa  421  1e-117  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2877  histidinol dehydrogenase  51.57 
 
 
427 aa  424  1e-117  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.612016  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1784  histidinol dehydrogenase  51.05 
 
 
429 aa  420  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.112475  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1861  histidinol dehydrogenase  50.96 
 
 
428 aa  420  1e-116  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181634 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3890  histidinol dehydrogenase  49.07 
 
 
434 aa  416  1e-115  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.150271  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3192  histidinol dehydrogenase  49.88 
 
 
430 aa  405  1e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.405899 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13980  predicted protein  48.69 
 
 
429 aa  395  1e-109  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.332062  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1352  histidinol dehydrogenase  48.25 
 
 
431 aa  395  1e-109  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1419  histidinol dehydrogenase  48.01 
 
 
431 aa  393  1e-108  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0715  histidinol dehydrogenase  47.56 
 
 
429 aa  389  1e-107  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  3.24572e-08 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1757  histidinol dehydrogenase  45.45 
 
 
431 aa  384  1e-105  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.338237  normal  0.0340923 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00833  histidinol dehydrogenase  47.31 
 
 
431 aa  381  1e-104  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  1.04597e-05  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00797  hypothetical histidine biosynthesis trifunctional protein (Eurofung)  46.56 
 
 
867 aa  372  1e-102  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.342936  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89228  Histidine biosynthesis trifunctional protein  48.71 
 
 
867 aa  370  1e-101  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.145236  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND06120  histidinol dehydrogenase, putative  46.56 
 
 
852 aa  368  1e-101  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1207  histidinol dehydrogenase  45.62 
 
 
431 aa  364  1e-99  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1201  histidinol dehydrogenase  45.6 
 
 
431 aa  364  1e-99  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0461  histidinol dehydrogenase  47.22 
 
 
403 aa  353  4e-96  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09670  histidinol dehydrogenase  42 
 
 
439 aa  339  6e-92  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0576344  normal  0.0399309 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1103  histidinol dehydrogenase  44.39 
 
 
426 aa  334  1e-90  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  2.89644e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1687  histidinol dehydrogenase  42.72 
 
 
424 aa  332  5e-90  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0791  histidinol dehydrogenase  43.19 
 
 
424 aa  332  7e-90  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.139873  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1125  Histidinol dehydrogenase  45.92 
 
 
428 aa  330  2e-89  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.820972  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2531  histidinol dehydrogenase  43.25 
 
 
442 aa  328  2e-88  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.742259 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2149  histidinol dehydrogenase  43.25 
 
 
426 aa  327  2e-88  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.547932  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1204  histidinol dehydrogenase  46.25 
 
 
427 aa  325  8e-88  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0659  histidinol dehydrogenase  42.45 
 
 
433 aa  325  8e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2206  histidinol dehydrogenase  43.11 
 
 
416 aa  323  3e-87  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.209889 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1001  histidinol dehydrogenase  41.82 
 
 
427 aa  323  4e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0213  histidinol dehydrogenase  42.25 
 
 
424 aa  323  5e-87  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.314414 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1963  histidinol dehydrogenase  44.05 
 
 
424 aa  323  5e-87  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1876  histidinol dehydrogenase  41.23 
 
 
416 aa  320  3e-86  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.963985  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1459  histidinol dehydrogenase  43.92 
 
 
429 aa  318  1e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0843  histidinol dehydrogenase  40.66 
 
 
426 aa  318  1e-85  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.567726  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1627  histidinol dehydrogenase  42.32 
 
 
439 aa  317  2e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3507  histidinol dehydrogenase  42.42 
 
 
433 aa  317  3e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.044382  normal  0.441151 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0291  histidinol dehydrogenase  43.46 
 
 
425 aa  316  5e-85  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0634762  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3885  histidinol dehydrogenase  43.67 
 
 
429 aa  315  8e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1220  histidinol dehydrogenase  42.22 
 
 
437 aa  315  1e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.913588  normal  0.067347 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0668  histidinol dehydrogenase  42.39 
 
 
445 aa  314  2e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.180765  normal  0.612492 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2355  histidinol dehydrogenase  42.33 
 
 
430 aa  313  3e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0263809  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2175  histidinol dehydrogenase  45.11 
 
 
428 aa  313  4e-84  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0925  histidinol dehydrogenase  40.42 
 
 
426 aa  312  6e-84  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.015628  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1291  histidinol dehydrogenase  41.85 
 
 
429 aa  311  1e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1497  histidinol dehydrogenase  42.11 
 
 
429 aa  311  1e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1565  histidinol dehydrogenase  40.84 
 
 
429 aa  311  1e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1526  histidinol dehydrogenase  41.3 
 
 
429 aa  311  2e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>