More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0035 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_0035  50S ribosomal protein L20  100 
 
 
117 aa  226  8e-59  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1840  50S ribosomal protein L20  88.89 
 
 
118 aa  203  8e-52  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0494  50S ribosomal protein L20  87.18 
 
 
117 aa  203  8e-52  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0347  50S ribosomal protein L20  88.03 
 
 
118 aa  202  9e-52  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0084  ribosomal protein L20  82.05 
 
 
117 aa  197  6e-50  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  3.55513e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0242  50S ribosomal protein L20  95.15 
 
 
117 aa  196  1e-49  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0113  50S ribosomal protein L20  87.18 
 
 
117 aa  185  2e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0270  50S ribosomal protein L20  98.04 
 
 
117 aa  173  8e-43  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0295  50S ribosomal protein L20  98.04 
 
 
117 aa  173  8e-43  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0207  50S ribosomal protein L20  82.11 
 
 
118 aa  165  2e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1821  LSU ribosomal protein L20P  64.1 
 
 
117 aa  156  7e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00014178  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1313  50S ribosomal protein L20  62.93 
 
 
117 aa  149  2e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  2.42462e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1223  50S ribosomal protein L20  59.83 
 
 
117 aa  147  4e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  3.32435e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1381  ribosomal protein L20  60.68 
 
 
120 aa  147  4e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  1.61333e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1664  50S ribosomal protein L20  62.39 
 
 
118 aa  147  5e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1615  50S ribosomal protein L20  60.68 
 
 
118 aa  147  6e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  4.23443e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2658  50S ribosomal protein L20  60.68 
 
 
119 aa  146  7e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  8.86061e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0800  50S ribosomal protein L20  61.54 
 
 
119 aa  146  9e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1756  50S ribosomal protein L20  58.12 
 
 
121 aa  145  2e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  2.28708e-06  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15180  LSU ribosomal protein L20P  58.97 
 
 
117 aa  145  2e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00260509  normal  0.121577 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2170  ribosomal protein L20  58.97 
 
 
121 aa  145  2e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00052538  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2381  ribosomal protein L20  62.39 
 
 
118 aa  144  3e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.153219  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1934  50S ribosomal protein L20  62.39 
 
 
118 aa  144  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000268188  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2165  50S ribosomal protein L20  62.39 
 
 
118 aa  144  3e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000386102  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2398  ribosomal protein L20  58.12 
 
 
118 aa  144  4e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0041866  normal  0.275247 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01386  50S ribosomal protein L20  61.54 
 
 
119 aa  143  8e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2496  50S ribosomal protein L20  62.39 
 
 
118 aa  143  8e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00192283  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2029  50S ribosomal protein L20  61.54 
 
 
119 aa  143  9e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000108915  hitchhiker  2.36508e-05 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1802  50S ribosomal protein L20  62.93 
 
 
117 aa  142  1e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0021941  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0217  50S ribosomal protein L20  61.4 
 
 
120 aa  142  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  2.74969e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2802  50S ribosomal protein L20  61.54 
 
 
119 aa  142  1e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0046  ribosomal protein L20  61.95 
 
 
117 aa  142  1e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2317  50S ribosomal protein L20  61.54 
 
 
118 aa  142  1e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  4.05852e-10  normal  0.195139 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1163  ribosomal protein L20  59.65 
 
 
114 aa  142  1e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  2.42027e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4697  50S ribosomal protein L20  57.26 
 
 
118 aa  142  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  4.43116e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2468  50S ribosomal protein L20  61.54 
 
 
118 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0164678  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4404  50S ribosomal protein L20  57.26 
 
 
118 aa  141  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  3.58516e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4704  50S ribosomal protein L20  57.26 
 
 
118 aa  142  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  1.11354e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2123  50S ribosomal protein L20  60.68 
 
 
119 aa  141  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  3.59041e-07  normal  0.016896 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1970  50S ribosomal protein L20  61.54 
 
 
118 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0648376  hitchhiker  0.00701004 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3478  50S ribosomal protein L20  61.54 
 
 
118 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0800064  hitchhiker  0.00881726 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4681  50S ribosomal protein L20  57.26 
 
 
118 aa  142  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  6.54651e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0556  50S ribosomal protein L20  57.26 
 
 
118 aa  142  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  5.06915e-07  hitchhiker  1.2511e-24 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4304  50S ribosomal protein L20  57.26 
 
 
118 aa  142  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.71931e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3222  50S ribosomal protein L20  61.54 
 
 
118 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.888026 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4469  50S ribosomal protein L20  57.26 
 
 
118 aa  142  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  2.22511e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4688  50S ribosomal protein L20  57.26 
 
 
118 aa  142  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.35886e-62 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4315  50S ribosomal protein L20  57.26 
 
 
118 aa  142  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  5.69694e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4817  50S ribosomal protein L20  57.26 
 
 
118 aa  142  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  4.68944e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2025  50S ribosomal protein L20  60.68 
 
 
119 aa  140  5e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.240457  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2015  50S ribosomal protein L20  60.68 
 
 
118 aa  140  6e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000132248  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2046  50S ribosomal protein L20  60.68 
 
 
118 aa  140  6e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  3.87614e-09  hitchhiker  0.00333012 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28680  50S ribosomal protein L20  60.68 
 
 
118 aa  140  6e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  5.31022e-10 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2187  50S ribosomal protein L20  60.68 
 
 
118 aa  140  6e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000144083  normal  0.0378081 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1708  50S ribosomal protein L20  60.68 
 
 
118 aa  140  6e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0547661  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2327  50S ribosomal protein L20  60.68 
 
 
118 aa  140  6e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000174207  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3259  50S ribosomal protein L20  57.26 
 
 
118 aa  140  6e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  1.43022e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2151  50S ribosomal protein L20  60.68 
 
 
118 aa  140  6e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  3.37835e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1958  50S ribosomal protein L20  60.68 
 
 
118 aa  140  6e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  2.62165e-07  normal  0.497021 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2219  50S ribosomal protein L20  60.68 
 
 
118 aa  140  6e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  5.21277e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2507  50S ribosomal protein L20  60.68 
 
 
118 aa  140  6e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2302  50S ribosomal protein L20  60.68 
 
 
118 aa  140  6e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2018  50S ribosomal protein L20  60.68 
 
 
118 aa  140  6e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000148558  normal  0.0497188 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1979  50S ribosomal protein L20  60.68 
 
 
118 aa  140  8e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0347964  normal  0.0774628 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0765  50S ribosomal protein L20P  58.97 
 
 
119 aa  139  1e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.9715  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0574  50S ribosomal protein L20  59.48 
 
 
119 aa  139  1e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20450  50S ribosomal protein L20  60.68 
 
 
118 aa  139  1e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.834025  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2488  50S ribosomal protein L20  59.83 
 
 
119 aa  139  1e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  8.2554e-06  hitchhiker  7.96215e-05 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2260  50S ribosomal protein L20  60.68 
 
 
119 aa  139  1e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  5.55159e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2096  50S ribosomal protein L20  58.97 
 
 
119 aa  138  2e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1235  ribosomal protein L20  56.41 
 
 
117 aa  139  2e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  4.39682e-06  normal  0.0943757 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2017  50S ribosomal protein L20  58.97 
 
 
119 aa  139  2e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1768  50S ribosomal protein L20  59.83 
 
 
119 aa  139  2e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  2.1709e-07  normal  0.0190948 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1206  50S ribosomal protein L20  60.87 
 
 
119 aa  138  3e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000522592  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2305  50S ribosomal protein L20  60.68 
 
 
117 aa  137  5e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00881657  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1414  50S ribosomal protein L20  59.83 
 
 
117 aa  136  9e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  4.03686e-07  normal  0.489901 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2216  ribosomal protein L20  58.97 
 
 
118 aa  136  9e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000311515  normal  0.131567 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003713  LSU ribosomal protein L20p  61.54 
 
 
117 aa  135  1e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000104464  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02082  50S ribosomal protein L20  61.54 
 
 
117 aa  135  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05610  ribosomal protein L20  58.97 
 
 
119 aa  135  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  3.12556e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1997  50S ribosomal protein L20  58.12 
 
 
118 aa  135  2e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00229305  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2300  50S ribosomal protein L20  58.12 
 
 
118 aa  135  2e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  8.21818e-06  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0915  ribosomal protein L20  61.54 
 
 
119 aa  135  2e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1518  50S ribosomal protein L20  61.4 
 
 
117 aa  134  3e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0150794  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2058  50S ribosomal protein L20  58.12 
 
 
117 aa  134  3e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.524551  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0939  50S ribosomal protein L20  61.54 
 
 
117 aa  134  4e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  7.48381e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0366  50S ribosomal protein L20P  57.63 
 
 
117 aa  134  5e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  7.02723e-07  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1253  ribosomal protein L20  58.62 
 
 
116 aa  134  5e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.78638  normal  0.232233 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0710  50S ribosomal protein L20  59.13 
 
 
117 aa  134  5e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  6.70695e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1872  50S ribosomal protein L20  58.97 
 
 
117 aa  133  6e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  4.76313e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2052  50S ribosomal protein L20  57.26 
 
 
119 aa  134  6e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00996082  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1087  50S ribosomal protein L20  65.69 
 
 
119 aa  133  7e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  4.84825e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2851  50S ribosomal protein L20  60.68 
 
 
119 aa  132  1e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0110251 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3041  50S ribosomal protein L20  56.76 
 
 
116 aa  132  1e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  2.50393e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05740  LSU ribosomal protein L20P  61.54 
 
 
117 aa  132  1e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  1.2199e-07  normal  0.0122872 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1580  50S ribosomal protein L20  60.68 
 
 
119 aa  132  1e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1856  50S ribosomal protein L20  56.41 
 
 
119 aa  133  1e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  1.91565e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1382  50S ribosomal protein L20  64.71 
 
 
119 aa  133  1e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  9.8372e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25670  LSU ribosomal protein L20P  57.26 
 
 
125 aa  132  1e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.826175  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0524  ribosomal protein L20  56.41 
 
 
119 aa  132  1e-30  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  4.08752e-08  unclonable  2.74126e-08 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>