More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2757 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_2757  pyrroline-5-carboxylate reductase  100 
 
 
274 aa  506  9.999999999999999e-143  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.447369  decreased coverage  0.0000025495 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6743  pyrroline-5-carboxylate reductase  50.57 
 
 
270 aa  232  6e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24470  pyrroline-5-carboxylate reductase  50 
 
 
279 aa  232  6e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0476  pyrroline-5-carboxylate reductase  50.19 
 
 
267 aa  231  1e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0247  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.49 
 
 
276 aa  228  6e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0642346  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0898  pyrroline-5-carboxylate reductase  47.13 
 
 
270 aa  224  9e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2708  pyrroline-5-carboxylate reductase  50.77 
 
 
264 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.702325  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0481  pyrroline-5-carboxylate reductase  48.65 
 
 
267 aa  218  1e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.790225  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02750  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.36 
 
 
270 aa  216  2e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5003  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.63 
 
 
264 aa  215  5e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.102233  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3276  pyrroline-5-carboxylate reductase  53.33 
 
 
274 aa  210  2e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215376  hitchhiker  0.00496059 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4590  pyrroline-5-carboxylate reductase  52.47 
 
 
276 aa  209  3e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0610  pyrroline-5-carboxylate reductase  56.07 
 
 
267 aa  210  3e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0436215 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3656  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.79 
 
 
270 aa  208  8e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.443187  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6140  pyrroline-5-carboxylate reductase  51.09 
 
 
297 aa  206  3e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.179161  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4459  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.91 
 
 
267 aa  204  1e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1084  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.23 
 
 
272 aa  204  1e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000115496  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0533  Pyrroline-5-carboxylate reductase  46.36 
 
 
264 aa  202  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0249  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.51 
 
 
264 aa  202  4e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.236328  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3266  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.63 
 
 
272 aa  201  9e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.674816  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2058  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.01 
 
 
264 aa  201  9.999999999999999e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.736428  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3496  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.78 
 
 
272 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.231373  normal  0.0164716 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0218  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.03 
 
 
274 aa  199  3e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0197  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.21 
 
 
271 aa  199  3.9999999999999996e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2901  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.44 
 
 
270 aa  199  6e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000081741  unclonable  0.000000152537 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01940  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.12 
 
 
266 aa  198  1.0000000000000001e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0955  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.68 
 
 
268 aa  197  2.0000000000000003e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00507177  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4421  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.33 
 
 
271 aa  197  2.0000000000000003e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000164624  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2828  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.4 
 
 
270 aa  194  1e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.137875  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0979  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.11 
 
 
270 aa  194  2e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000628805  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3093  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.89 
 
 
273 aa  194  2e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0431736  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4908  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.01 
 
 
275 aa  194  2e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0661401  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1412  pyrroline-5-carboxylate reductase  47.15 
 
 
275 aa  193  3e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00064101  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1478  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.6 
 
 
280 aa  193  3e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0660  pyrroline-5-carboxylate reductase  48.85 
 
 
271 aa  192  5e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1387  pyrroline-5-carboxylate reductase  47.91 
 
 
276 aa  192  7e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0351  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.75 
 
 
280 aa  192  7e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0548  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.94 
 
 
269 aa  191  8e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1755  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.97 
 
 
270 aa  191  1e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1696  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.51 
 
 
272 aa  191  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1715  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.89 
 
 
271 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000826167  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0899  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.87 
 
 
270 aa  190  2e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000196708 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0397  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.89 
 
 
270 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3315  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.46 
 
 
545 aa  189  4e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.112509  normal  0.0752896 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8353  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.57 
 
 
268 aa  189  5.999999999999999e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0480  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.21 
 
 
272 aa  187  1e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.904578 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3031  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.73 
 
 
272 aa  187  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.029709  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2713  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.11 
 
 
272 aa  186  3e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0672  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.46 
 
 
271 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000211861  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2791  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.46 
 
 
272 aa  183  3e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0493  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.26 
 
 
273 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05150  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.89 
 
 
273 aa  182  6e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59347  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3029  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.35 
 
 
272 aa  182  7e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0010709  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1474  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.25 
 
 
274 aa  182  7e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0863  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.92 
 
 
267 aa  181  9.000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2273  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.74 
 
 
285 aa  181  9.000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.642771  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1017  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.53 
 
 
282 aa  181  1e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2783  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.97 
 
 
272 aa  181  1e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2732  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.97 
 
 
272 aa  181  1e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00058851  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2995  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.97 
 
 
272 aa  181  1e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00170119  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2250  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.35 
 
 
272 aa  180  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00152908  normal  0.0119667 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2480  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.63 
 
 
274 aa  181  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1378  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.25 
 
 
274 aa  181  2e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2995  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.59 
 
 
272 aa  180  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0808412  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3383  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.15 
 
 
267 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3969  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.96 
 
 
279 aa  179  4e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2541  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.51 
 
 
270 aa  179  5.999999999999999e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3891  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.21 
 
 
279 aa  177  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0399  pyrroline-5-carboxylate reductase  52.45 
 
 
274 aa  177  1e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3883  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.21 
 
 
279 aa  177  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0990  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.59 
 
 
279 aa  177  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4207  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.21 
 
 
279 aa  176  4e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4718  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.92 
 
 
272 aa  176  5e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.533737  normal  0.734088 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5145  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.22 
 
 
272 aa  176  5e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4246  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.21 
 
 
279 aa  175  7e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4270  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.83 
 
 
279 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4968  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.84 
 
 
272 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5095  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.84 
 
 
272 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.364055  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2850  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.09 
 
 
272 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3164  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.73 
 
 
260 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4045  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.46 
 
 
279 aa  172  5e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4359  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.46 
 
 
279 aa  172  5e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4160  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.46 
 
 
279 aa  172  5e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3055  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.82 
 
 
274 aa  172  5.999999999999999e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.145614  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1168  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.64 
 
 
281 aa  172  6.999999999999999e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000092936  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1570  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.59 
 
 
281 aa  171  7.999999999999999e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1439  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.63 
 
 
262 aa  171  7.999999999999999e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3132  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.88 
 
 
260 aa  171  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2899  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.97 
 
 
272 aa  171  1e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00203272  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0390  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.77 
 
 
272 aa  169  3e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1785  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.63 
 
 
289 aa  170  3e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1003  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.83 
 
 
281 aa  169  4e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0370  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.84 
 
 
272 aa  168  8e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1472  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.83 
 
 
257 aa  168  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000561637  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2921  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.11 
 
 
276 aa  167  2e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3143  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.11 
 
 
276 aa  167  2e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4151  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.62 
 
 
273 aa  167  2e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25379  predicted protein  43.93 
 
 
289 aa  167  2e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0340  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.8 
 
 
275 aa  167  2e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1154  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.92 
 
 
272 aa  166  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>