34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2224 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_2224  helix-turn-helix domain protein  100 
 
 		 403 aa  772    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.163485  hitchhiker  0.00213028 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1242  XRE family transcriptional regulator  39.94 
 
 		 432 aa  154  2e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0223131 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2570  hypothetical protein  36.36 
 
 		 430 aa  147  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0258744  normal  0.5369 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0826  transcriptional regulator, XRE family  39.33 
 
 		 446 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.150864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3127  helix-turn-helix domain protein  36.95 
 
 		 434 aa  135  9e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.641093  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4934  transcriptional regulator, XRE family  38.68 
 
 		 487 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5721  hypothetical protein  39.05 
 
 		 431 aa  125  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0380907  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3542  helix-turn-helix domain-containing protein  36.11 
 
 		 442 aa  110  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.518975  normal  0.855489 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9326  putative transcriptional regulator, XRE family  35.05 
 
 		 452 aa  109  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.607046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5720  hypothetical protein  30.84 
 
 		 460 aa  75.5  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.412673  normal  0.998614 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0478  helix-turn-helix domain-containing protein  25.41 
 
 		 281 aa  53.5  0.000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000308908  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0026  transcriptional regulator, XRE family  30.84 
 
 		 435 aa  52.4  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0122456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0397  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.13 
 
 		 475 aa  51.2  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.264481  normal  0.0251152 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0685  TPR repeat-containing protein  43.64 
 
 		 436 aa  50.1  0.00007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.105073  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3185  transcriptional regulator, XRE family  49.02 
 
 		 421 aa  50.1  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3404  XRE family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 424 aa  50.1  0.00008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2675  XRE family transcriptional regulator  22.87 
 
 		 422 aa  49.3  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0980951  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0172  helix-turn-helix domain-containing protein  41.38 
 
 		 313 aa  48.9  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1606  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 404 aa  47.8  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0568777  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1000  transcriptional regulator, XRE family  34.87 
 
 		 504 aa  47.4  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_13  putative peptidase, S24-like  41.54 
 
 		 205 aa  47  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.568691  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1781  DNA-binding protein  36.36 
 
 		 403 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1730  DNA-binding protein  36.36 
 
 		 403 aa  47.4  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1558  transcriptional regulator  36.36 
 
 		 403 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1567  transcriptional regulator  36.36 
 
 		 403 aa  47.4  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1606  DNA-binding protein  36.36 
 
 		 403 aa  47.4  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1748  DNA-binding protein  35.82 
 
 		 404 aa  46.6  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3595  DNA-binding protein  36.36 
 
 		 404 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3593  XRE family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 76 aa  45.8  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.283454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1554  XRE family transcriptional regulator  24.38 
 
 		 310 aa  44.7  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1807  DNA-binding protein  34.33 
 
 		 403 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1861  DNA-binding protein  34.33 
 
 		 403 aa  43.9  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2573  transcriptional regulator, XRE family  46.55 
 
 		 77 aa  43.1  0.009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0256  TPR repeat-containing protein  29.14 
 
 		 1298 aa  42.7  0.01  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.636433  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>