296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2422 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_2422  fumarate hydratase  100 
 
 
280 aa  564  1e-160  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  4.32763e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3090  fumarate hydratase  70 
 
 
280 aa  401  1e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  1.69234e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1779  fumarate hydratase  61.07 
 
 
280 aa  352  3e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00122299  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1872  fumarate hydratase  59.64 
 
 
283 aa  348  5e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.457105  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4397  fumarate hydratase  57.76 
 
 
289 aa  343  1e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0277035  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2135  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, alpha subunit  56.79 
 
 
281 aa  337  1e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.986162  hitchhiker  0.00977913 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1520  fumarate hydratase  60.85 
 
 
281 aa  332  3e-90  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.12019  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2398  fumarase alpha subunit  54.35 
 
 
280 aa  327  1e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  1.79798e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1701  fumarate hydratase  58.72 
 
 
281 aa  320  1e-86  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.451126  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1254  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase alpha subunit  56.07 
 
 
294 aa  316  3e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1954  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, alpha subunit  55.87 
 
 
280 aa  314  8e-85  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1927  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase alpha subunit  55.64 
 
 
280 aa  310  1e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0007  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase alpha subunit  56.07 
 
 
280 aa  310  2e-83  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2748  fumarate hydratase  53.65 
 
 
280 aa  309  4e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10050  fumarate hydratase  57.5 
 
 
279 aa  308  5e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.146733  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0623  fumarate hydratase  54.12 
 
 
281 aa  307  2e-82  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000355042  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0023  fumarate hydratase  54.8 
 
 
281 aa  303  3e-81  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26960  fumarase alpha subunit  52.13 
 
 
281 aa  297  1e-79  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2746  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, alpha subunit  53.6 
 
 
278 aa  294  1e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1528  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, alpha subunit  54.45 
 
 
281 aa  292  5e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0847181  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3063  fumarate hydratase  49.64 
 
 
279 aa  291  8e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5472  fumarate hydratase  50 
 
 
280 aa  290  2e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2461  fumarate hydratase  51.07 
 
 
279 aa  290  2e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2283  fumarate hydratase  55.91 
 
 
281 aa  290  3e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0352467 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3639  fumarate hydratase  49.29 
 
 
279 aa  284  9e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1068  fumarate hydratase  50 
 
 
280 aa  284  9e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.149426  normal  0.287386 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0857  fumarate hydratase  47.31 
 
 
293 aa  280  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0293622  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0889  fumarate hydratase  47.31 
 
 
281 aa  279  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0826  fumarate hydratase  47.31 
 
 
281 aa  279  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.399636  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0798  fumarate hydratase  47.31 
 
 
281 aa  279  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.100513  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1255  fumarate hydratase  48.21 
 
 
279 aa  278  9e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0430  fumarate hydratase  53.74 
 
 
280 aa  276  2e-73  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0125  fumarate hydratase  49.47 
 
 
279 aa  270  1e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.493649  normal  0.1698 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0301  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, alpha subunit  56.07 
 
 
279 aa  270  2e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.768443  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1341  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, alpha subunit  48.92 
 
 
280 aa  268  5e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_395  tartrate/fumarate hydratase family, alpha subunit  54.8 
 
 
280 aa  265  5e-70  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0453  fumarate hydratase  54.8 
 
 
280 aa  264  1e-69  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0302  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, alpha subunit  51.09 
 
 
282 aa  253  3e-66  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1275  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, alpha subunit  43.66 
 
 
283 aa  249  4e-65  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0297  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase alpha subunit  51.06 
 
 
279 aa  239  5e-62  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0747555 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2194  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase alpha subunit  42.76 
 
 
507 aa  218  7e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5883  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase alpha subunit  42.76 
 
 
507 aa  218  7e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2112  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase alpha subunit  42.76 
 
 
507 aa  217  1e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0775918  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5523  fumarase  42.76 
 
 
507 aa  217  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.209704  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2219  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase alpha subunit  42.76 
 
 
507 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00489886  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2233  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase alpha subunit  42.41 
 
 
507 aa  216  3e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.102224  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56300  putative fumarase  42.07 
 
 
507 aa  214  1e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3136  fumarase  41.72 
 
 
520 aa  213  2e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119324  normal  0.0284437 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4902  fumarate hydratase, class I  41.72 
 
 
507 aa  214  2e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1941  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase alpha subunit  42.07 
 
 
507 aa  213  3e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.757012  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4339  fumarate hydratase, class I, putative  41.72 
 
 
507 aa  213  4e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1413  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, alpha subunit  41.38 
 
 
507 aa  212  5e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0515679  normal  0.0934254 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1082  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase alpha subunit  41.38 
 
 
507 aa  212  5e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4031  Fe-S type hydro-lyase tartrate/fumarate alpha region:Fe-S type hydro-lyase tartrate/fumarate beta region  41.72 
 
 
507 aa  212  5e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00228691 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3265  fumarase  41.72 
 
 
507 aa  212  7e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38440  fumarate hydratase, class I  41.81 
 
 
503 aa  211  8e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2334  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase alpha subunit  42.56 
 
 
505 aa  211  8e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  4.49013e-05  normal  0.0431842 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0897  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, alpha subunit  41.38 
 
 
507 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.728674  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4454  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase alpha subunit  41.72 
 
 
507 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00115261 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0936  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase alpha subunit  41.38 
 
 
507 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1382  fumarase  40.69 
 
 
507 aa  211  1e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1116  fumarase alpha subunit  44.24 
 
 
294 aa  211  1e-53  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.395574  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1000  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase alpha subunit  41.72 
 
 
507 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  2.13492e-09 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2232  fumarase  41.72 
 
 
507 aa  210  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.476859  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2020  tartrate/fumarate family Fe-S type hydro-lyase  41.16 
 
 
511 aa  210  2e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.244289  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4452  fumarase  41.38 
 
 
507 aa  210  2e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.160872  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0250  fumarate hydratase  44.2 
 
 
276 aa  210  2e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0136296  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0527  fumarate hydratase, class I  41.16 
 
 
511 aa  210  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0793  tartrate/fumarate family Fe-S type hydro-lyase  41.16 
 
 
511 aa  210  3e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1936  tartrate/fumarate family Fe-S type hydro-lyase  41.16 
 
 
511 aa  210  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1797  tartrate/fumarate family Fe-S type hydro-lyase  41.16 
 
 
511 aa  210  3e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0624  fumarate hydratase, class I  41.16 
 
 
511 aa  210  3e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1085  tartrate/fumarate family Fe-S type hydro-lyase  41.16 
 
 
511 aa  210  3e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2058  tartrate/fumarate family Fe-S type hydro-lyase  41.16 
 
 
511 aa  210  3e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2583  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase alpha protein  40.14 
 
 
516 aa  206  3e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.604027  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2035  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase alpha subunit  41.61 
 
 
504 aa  206  4e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.19234  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2518  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, alpha subunit  40.21 
 
 
517 aa  204  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.369793  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2418  fumarate hydratase  41.28 
 
 
280 aa  204  1e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0847876 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0888  fumarase  40.14 
 
 
506 aa  204  2e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  1.00222e-08  decreased coverage  1.42387e-07 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1489  fumarase  39.93 
 
 
519 aa  204  2e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0914296  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1955  fumarate hydratase protein  41.03 
 
 
507 aa  204  2e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.728356  normal  0.488035 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1918  fumarase  42.7 
 
 
542 aa  203  2e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1139  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase alpha subunit  42.46 
 
 
507 aa  202  4e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3214  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase alpha subunit  39.8 
 
 
516 aa  202  4e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.942506  normal  0.799174 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2654  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase alpha subunit  39.52 
 
 
517 aa  202  5e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0657589  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2102  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, alpha subunit  41.03 
 
 
507 aa  202  5e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.228521  normal  0.564936 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1834  fumarase  40.14 
 
 
501 aa  201  1e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2883  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase alpha subunit  39.46 
 
 
516 aa  200  2e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.234305 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6119  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, alpha subunit  41.18 
 
 
503 aa  200  2e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.244405 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2046  fumarase  39.18 
 
 
544 aa  200  2e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.519105  normal  0.0269276 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2273  fumarase  40.69 
 
 
521 aa  200  2e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0060992  hitchhiker  0.00178376 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0629  fumarate hydratase  42.09 
 
 
283 aa  200  2e-50  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00655  fumarate hydratase  41.03 
 
 
505 aa  199  3e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0444664  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1778  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, alpha subunit  40.48 
 
 
511 aa  198  6e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.525314 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1129  fumarate hydratase  42.86 
 
 
281 aa  198  6e-50  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.668239  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1109  fumarate hydratase  40.07 
 
 
530 aa  197  2e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00489868  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1056  fumarase  38.91 
 
 
546 aa  197  2e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16210  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily  39.78 
 
 
292 aa  197  2e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  decreased coverage  1.47794e-08 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3065  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase alpha subunit  40.42 
 
 
508 aa  197  2e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.998246 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3613  putative fumarate hydratase, class I  39.3 
 
 
507 aa  196  3e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.985356  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>