296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_2746 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_2746  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, alpha subunit  100 
 
 
278 aa  564  1e-160  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2398  fumarase alpha subunit  52.86 
 
 
280 aa  298  5e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000179798  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1779  fumarate hydratase  56.36 
 
 
280 aa  298  5e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00122299  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3090  fumarate hydratase  55.71 
 
 
280 aa  288  7e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000169234  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1872  fumarate hydratase  52.86 
 
 
283 aa  286  2e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.457105  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3063  fumarate hydratase  51.07 
 
 
279 aa  278  1e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2422  fumarate hydratase  53.6 
 
 
280 aa  276  3e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000432763  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1520  fumarate hydratase  52.31 
 
 
281 aa  273  3e-72  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.12019  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0623  fumarate hydratase  50.18 
 
 
281 aa  273  3e-72  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000355042  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4397  fumarate hydratase  50.37 
 
 
289 aa  272  5.000000000000001e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0277035  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1068  fumarate hydratase  50.72 
 
 
280 aa  269  5e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.149426  normal  0.287386 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10050  fumarate hydratase  51.26 
 
 
279 aa  266  2e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.146733  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0023  fumarate hydratase  49.11 
 
 
281 aa  266  2.9999999999999995e-70  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26960  fumarase alpha subunit  48.55 
 
 
281 aa  266  2.9999999999999995e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3639  fumarate hydratase  48.56 
 
 
279 aa  264  1e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0007  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase alpha subunit  51.62 
 
 
280 aa  264  1e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1927  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase alpha subunit  51.07 
 
 
280 aa  263  3e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1701  fumarate hydratase  48.75 
 
 
281 aa  262  4.999999999999999e-69  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.451126  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1255  fumarate hydratase  48.92 
 
 
279 aa  261  8e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2135  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, alpha subunit  47.64 
 
 
281 aa  258  9e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.986162  hitchhiker  0.00977913 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1341  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, alpha subunit  47.67 
 
 
280 aa  256  2e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2748  fumarate hydratase  47.45 
 
 
280 aa  256  3e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0857  fumarate hydratase  45.62 
 
 
293 aa  256  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0293622  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2461  fumarate hydratase  48.93 
 
 
279 aa  255  5e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1954  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, alpha subunit  47.5 
 
 
280 aa  254  9e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0826  fumarate hydratase  45.62 
 
 
281 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.399636  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0798  fumarate hydratase  45.62 
 
 
281 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.100513  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0889  fumarate hydratase  45.62 
 
 
281 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2283  fumarate hydratase  52.33 
 
 
281 aa  253  3e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0352467 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0125  fumarate hydratase  49.64 
 
 
279 aa  247  1e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.493649  normal  0.1698 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1254  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase alpha subunit  49.44 
 
 
294 aa  242  6e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0302  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, alpha subunit  48.74 
 
 
282 aa  242  6e-63  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1528  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, alpha subunit  46.4 
 
 
281 aa  241  7e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0847181  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0297  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase alpha subunit  48.55 
 
 
279 aa  240  2e-62  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0747555 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5472  fumarate hydratase  43.07 
 
 
280 aa  236  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0430  fumarate hydratase  47.27 
 
 
280 aa  233  3e-60  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16210  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily  42.09 
 
 
292 aa  233  3e-60  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000147794 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1275  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, alpha subunit  44.72 
 
 
283 aa  232  5e-60  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_395  tartrate/fumarate hydratase family, alpha subunit  47.27 
 
 
280 aa  225  7e-58  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0453  fumarate hydratase  47.64 
 
 
280 aa  221  8e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0629  fumarate hydratase  46.32 
 
 
283 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1135  fumarate hydratase  45.22 
 
 
282 aa  217  1e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1129  fumarate hydratase  45.49 
 
 
281 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.668239  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0301  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, alpha subunit  47.81 
 
 
279 aa  211  1e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.768443  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1116  fumarase alpha subunit  43.23 
 
 
294 aa  209  6e-53  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.395574  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1548  fumarate hydratase  45.49 
 
 
281 aa  206  3e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5883  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase alpha subunit  40.35 
 
 
507 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2194  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase alpha subunit  40.35 
 
 
507 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1082  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase alpha subunit  40.35 
 
 
507 aa  202  5e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2233  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase alpha subunit  40 
 
 
507 aa  201  8e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.102224  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5523  fumarase  40 
 
 
507 aa  201  9e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.209704  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2232  fumarase  41.11 
 
 
507 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.476859  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1941  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase alpha subunit  40.56 
 
 
507 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.757012  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2112  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase alpha subunit  39.65 
 
 
507 aa  199  3e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0775918  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38440  fumarate hydratase, class I  39.93 
 
 
503 aa  199  3e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2219  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase alpha subunit  39.65 
 
 
507 aa  199  3e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00489886  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0822  fumarate hydratase  44.4 
 
 
281 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.221808  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3265  fumarase  39.65 
 
 
507 aa  199  6e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1918  fumarase  39.79 
 
 
542 aa  198  9e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56300  putative fumarase  39.65 
 
 
507 aa  198  9e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4902  fumarate hydratase, class I  39.3 
 
 
507 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2334  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase alpha subunit  39.79 
 
 
505 aa  197  2.0000000000000003e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000449013  normal  0.0431842 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1000  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase alpha subunit  38.95 
 
 
507 aa  196  3e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000213492 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4454  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase alpha subunit  38.95 
 
 
507 aa  196  3e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00115261 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2020  tartrate/fumarate family Fe-S type hydro-lyase  39.1 
 
 
511 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.244289  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0089  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase alpha subunit  40.81 
 
 
278 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4452  fumarase  38.95 
 
 
507 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.160872  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2058  tartrate/fumarate family Fe-S type hydro-lyase  39.1 
 
 
511 aa  195  6e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1797  tartrate/fumarate family Fe-S type hydro-lyase  39.1 
 
 
511 aa  195  6e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1936  tartrate/fumarate family Fe-S type hydro-lyase  39.1 
 
 
511 aa  195  6e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0793  tartrate/fumarate family Fe-S type hydro-lyase  39.1 
 
 
511 aa  195  6e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1085  tartrate/fumarate family Fe-S type hydro-lyase  39.1 
 
 
511 aa  195  6e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0624  fumarate hydratase, class I  39.1 
 
 
511 aa  195  6e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0527  fumarate hydratase, class I  39.1 
 
 
511 aa  195  6e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0250  fumarate hydratase  42.44 
 
 
276 aa  195  8.000000000000001e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0136296  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0897  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, alpha subunit  38.25 
 
 
507 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.728674  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4339  fumarate hydratase, class I, putative  38.6 
 
 
507 aa  194  1e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4031  Fe-S type hydro-lyase tartrate/fumarate alpha region:Fe-S type hydro-lyase tartrate/fumarate beta region  38.6 
 
 
507 aa  194  1e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00228691 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0936  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase alpha subunit  38.25 
 
 
507 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3136  fumarase  39.51 
 
 
520 aa  194  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119324  normal  0.0284437 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0534  fumarase alpha subunit  40.81 
 
 
273 aa  193  2e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.388774 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1413  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, alpha subunit  39.16 
 
 
507 aa  193  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0515679  normal  0.0934254 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0733  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase alpha subunit  40.82 
 
 
273 aa  192  6e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.434694  normal  0.254831 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0188  fumarase  38.33 
 
 
507 aa  191  8e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2273  fumarase  39.3 
 
 
521 aa  191  8e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0060992  hitchhiker  0.00178376 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0397  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase alpha subunit  40.36 
 
 
272 aa  191  9e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0381  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase alpha subunit  44.86 
 
 
272 aa  190  2e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2418  fumarate hydratase  42.41 
 
 
280 aa  191  2e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0847876 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0990  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, alpha subunit  42.65 
 
 
283 aa  191  2e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00233327  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2102  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, alpha subunit  38.95 
 
 
507 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.228521  normal  0.564936 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1382  fumarase  41 
 
 
507 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1955  fumarate hydratase protein  38.6 
 
 
507 aa  189  4e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.728356  normal  0.488035 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2035  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase alpha subunit  40.07 
 
 
504 aa  189  4e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.19234  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6119  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, alpha subunit  38.75 
 
 
503 aa  189  4e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.244405 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1977  fumarate hydratase  37.41 
 
 
512 aa  188  8e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.146696  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1360  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase alpha subunit  38.81 
 
 
522 aa  187  1e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3613  putative fumarate hydratase, class I  37.93 
 
 
507 aa  188  1e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.985356  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2742  fumarase  38.41 
 
 
503 aa  188  1e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.993892 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1143  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, alpha subunit  40.5 
 
 
354 aa  187  2e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.423465  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3065  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase alpha subunit  39.58 
 
 
508 aa  187  2e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.998246 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>