227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4963 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_4963  heat shock protein Hsp20  100 
 
 
141 aa  281  3.0000000000000004e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.971356  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0188  heat shock protein Hsp20  60 
 
 
148 aa  159  9e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.822794  normal  0.424528 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3755  heat shock protein Hsp20  53.19 
 
 
182 aa  147  4e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0408  heat shock protein Hsp20  53.33 
 
 
167 aa  147  6e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3663  heat shock protein Hsp20  57.75 
 
 
141 aa  146  7e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.728714  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1572  HSP20 family protein  54.01 
 
 
155 aa  145  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.583414  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0224  heat shock protein Hsp20  54.01 
 
 
155 aa  145  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.953259 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1620  heat shock protein Hsp20  54.93 
 
 
143 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0107266 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1902  heat shock protein Hsp20  54.93 
 
 
143 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.724367 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1616  heat shock protein Hsp20  54.23 
 
 
143 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0212201  hitchhiker  0.00491481 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4228  heat shock protein Hsp20  54.17 
 
 
144 aa  144  3e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00904113 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3054  heat shock protein Hsp20  53.28 
 
 
155 aa  144  5e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0683  heat shock protein  54.01 
 
 
147 aa  144  5e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0489966  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4738  heat shock protein Hsp20  54.23 
 
 
144 aa  143  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0552071  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3162  heat shock protein Hsp20  52.74 
 
 
142 aa  142  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.866915  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0010  heat shock protein Hsp20  53.52 
 
 
141 aa  141  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000317964 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3350  heat shock protein Hsp20  49.64 
 
 
172 aa  140  6e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0610  heat shock protein Hsp20  52.14 
 
 
137 aa  140  6e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.127052  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0341  heat shock protein Hsp20  53.03 
 
 
162 aa  140  6e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0137519  normal  0.0838875 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0651  heat shock protein Hsp20  52.11 
 
 
141 aa  140  8e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0518672 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0056  heat shock protein Hsp20  52.11 
 
 
141 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.368709  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0163  HSP20 family protein  53.9 
 
 
160 aa  138  1.9999999999999998e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0409  heat shock protein Hsp20  51.41 
 
 
141 aa  138  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0182  heat shock protein Hsp20  50.7 
 
 
141 aa  138  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.578899  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0512  heat shock protein Hsp20  51.39 
 
 
166 aa  138  1.9999999999999998e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2205  heat shock protein Hsp20  54.01 
 
 
136 aa  139  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0115  putative small heat shock protein  53.52 
 
 
141 aa  138  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.652181 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0157  HSP20 family protein  53.9 
 
 
160 aa  138  1.9999999999999998e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.183636  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0211  heat shock protein Hsp20  52.82 
 
 
141 aa  138  3e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0010  heat shock protein Hsp20  52.82 
 
 
141 aa  136  7.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.138244  normal  0.090985 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0174  heat shock protein Hsp20  51.77 
 
 
140 aa  135  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.743685  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0049  heat shock protein Hsp20  53.47 
 
 
143 aa  134  3.0000000000000003e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000515794 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0167  heat shock protein Hsp20  52.08 
 
 
143 aa  133  7.000000000000001e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2032  heat shock protein Hsp20  51.05 
 
 
141 aa  131  3e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0447  small heat shock protein  46.15 
 
 
142 aa  118  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2501  16 kDa heat shock protein A  47.66 
 
 
145 aa  117  6e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1016  small heat shock protein  48.44 
 
 
158 aa  113  6.9999999999999995e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.127734  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2676  heat shock protein Hsp20  48.44 
 
 
158 aa  113  6.9999999999999995e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.983147  normal  0.298779 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002003  heat shock protein A  48.03 
 
 
145 aa  113  8.999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2020  16 kDa heat shock protein A  48.84 
 
 
147 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0459252  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1668  small heat shock protein IbpA (16 kDa heat shock protein A)  45.74 
 
 
139 aa  112  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.172487  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3646  heat shock protein Hsp20  47.62 
 
 
148 aa  112  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.498726  normal  0.603742 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0212  heat shock protein Hsp20  46.88 
 
 
158 aa  111  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.734603  normal  0.555417 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2668  heat shock protein HSP20  49.61 
 
 
147 aa  110  4.0000000000000004e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000229058  decreased coverage  0.000680468 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1971  heat shock protein Hsp20  48.06 
 
 
147 aa  110  5e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000191166  hitchhiker  0.0000381021 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2388  heat shock protein Hsp20  48.06 
 
 
147 aa  110  5e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00175284  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2492  heat shock protein Hsp20  48.06 
 
 
147 aa  110  5e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00176998  hitchhiker  0.00301221 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2376  heat shock protein Hsp20  48.06 
 
 
147 aa  110  5e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0181083  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00446  heat shock protein  46.46 
 
 
145 aa  110  8.000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2936  heat shock protein Hsp20  46.46 
 
 
150 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2134  heat shock protein Hsp20  47.29 
 
 
145 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0695  heat shock protein Hsp20  47.66 
 
 
153 aa  109  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0703839 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1953  heat shock protein Hsp20  47.24 
 
 
146 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0504926 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2140  heat shock protein Hsp20  46.51 
 
 
147 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0232809  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0957  heat shock protein Hsp20  49.28 
 
 
158 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.634441  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0014  heat shock chaperone IbpB  45.11 
 
 
142 aa  108  3e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2126  heat shock protein Hsp20  46.09 
 
 
150 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0230885  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2277  16 kDa heat shock protein A  46.46 
 
 
147 aa  107  5e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4035  heat shock chaperone IbpB  41.04 
 
 
142 aa  107  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4139  heat shock chaperone IbpB  41.04 
 
 
142 aa  107  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4197  heat shock chaperone IbpB  41.04 
 
 
142 aa  107  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4090  heat shock chaperone IbpB  41.04 
 
 
142 aa  107  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4018  heat shock chaperone IbpB  41.04 
 
 
142 aa  107  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2498  heat shock protein Hsp20  46.15 
 
 
155 aa  107  6e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.566627 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1070  heat shock protein Hsp20  44.7 
 
 
156 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0407066  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03569  heat shock chaperone  41.73 
 
 
133 aa  106  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0017  heat shock chaperone IbpB  41.91 
 
 
142 aa  106  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0017  heat shock protein Hsp20  41.91 
 
 
142 aa  106  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03513  hypothetical protein  41.91 
 
 
142 aa  106  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4533  heat shock protein Hsp20  43.97 
 
 
158 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.913477 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4194  heat shock chaperone IbpB  41.91 
 
 
142 aa  106  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1748  heat shock protein Hsp20  45.67 
 
 
147 aa  106  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0323144  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1828  heat shock protein Hsp20  45.67 
 
 
147 aa  106  1e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.122774  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1564  heat shock protein Hsp20  47.24 
 
 
148 aa  106  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.403756  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2271  heat shock protein Hsp20  45.67 
 
 
147 aa  106  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00909432  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4051  heat shock chaperone IbpB  41.91 
 
 
142 aa  106  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3898  heat shock chaperone IbpB  41.91 
 
 
142 aa  106  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5118  heat shock chaperone IbpB  41.91 
 
 
142 aa  106  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.238843 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1115  heat shock protein Hsp20  48.06 
 
 
160 aa  106  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2961  small heat shock protein  44.96 
 
 
144 aa  105  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0433  heat shock protein Hsp20  45.67 
 
 
164 aa  105  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4233  heat shock chaperone IbpB  41.91 
 
 
142 aa  105  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1909  heat shock protein Hsp20  47.29 
 
 
146 aa  105  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0679931  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2505  heat shock protein Hsp20  45.8 
 
 
153 aa  104  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167107  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1971  heat shock protein Hsp20  46.03 
 
 
154 aa  104  5e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3679  heat shock protein Hsp20  44.88 
 
 
160 aa  103  6e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.481567 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3725  heat shock protein Hsp20  44.88 
 
 
160 aa  103  6e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1116  heat shock protein Hsp20  45 
 
 
152 aa  103  7e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.109039  normal  0.304461 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2952  heat shock protein Hsp20  42.03 
 
 
153 aa  103  9e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0763  heat shock protein Hsp20  45.39 
 
 
158 aa  103  9e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.50457 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2892  putative small heat shock (HSP20) protein  44.19 
 
 
152 aa  103  9e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00328323  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02239  small heat shock protein  40.91 
 
 
151 aa  103  9e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2117  heat shock protein Hsp20  44.19 
 
 
154 aa  102  1e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0619  heat shock protein Hsp20  46.15 
 
 
176 aa  103  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4119  heat shock protein Hsp20  44.09 
 
 
160 aa  102  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.336611  normal  0.508769 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2837  molecular chaperone (small heat shock protein)  45.38 
 
 
160 aa  102  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00175036  normal  0.201531 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3036  small heat shock protein, HSP20-like chaperone  42.75 
 
 
149 aa  102  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0929913  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1513  heat shock protein Hsp20  47.66 
 
 
147 aa  101  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.307578  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2014  heat shock protein Hsp20  47.93 
 
 
153 aa  101  3e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.918897  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2213  heat shock protein Hsp20  43.85 
 
 
157 aa  101  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>