239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C4139 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011094  SeSA_A4018  heat shock chaperone IbpB  100 
 
 
142 aa  293  4e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4197  heat shock chaperone IbpB  100 
 
 
142 aa  293  4e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4090  heat shock chaperone IbpB  100 
 
 
142 aa  293  4e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4139  heat shock chaperone IbpB  100 
 
 
142 aa  293  4e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4035  heat shock chaperone IbpB  100 
 
 
142 aa  293  4e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0017  heat shock protein Hsp20  88.73 
 
 
142 aa  263  5.999999999999999e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0017  heat shock chaperone IbpB  88.73 
 
 
142 aa  263  5.999999999999999e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03513  hypothetical protein  88.73 
 
 
142 aa  263  5.999999999999999e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3898  heat shock chaperone IbpB  88.73 
 
 
142 aa  263  5.999999999999999e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4051  heat shock chaperone IbpB  88.73 
 
 
142 aa  263  5.999999999999999e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4194  heat shock chaperone IbpB  88.73 
 
 
142 aa  263  5.999999999999999e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5118  heat shock chaperone IbpB  88.73 
 
 
142 aa  263  5.999999999999999e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.238843 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4233  heat shock chaperone IbpB  88.03 
 
 
142 aa  261  2e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0014  heat shock chaperone IbpB  85.92 
 
 
142 aa  260  4.999999999999999e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03569  heat shock chaperone  88.72 
 
 
133 aa  246  1e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0040  heat shock chaperone IbpB  71.13 
 
 
150 aa  208  2e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0035  heat shock chaperone IbpB  71.13 
 
 
149 aa  207  4e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3913  heat shock chaperone IbpB  68.12 
 
 
149 aa  199  7e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4104  heat shock chaperone IbpB  70.37 
 
 
149 aa  199  1.9999999999999998e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0012  heat shock chaperone IbpB  64.63 
 
 
154 aa  195  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3794  heat shock chaperone IbpB  64.63 
 
 
154 aa  195  2.0000000000000003e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.82162  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4142  heat shock chaperone IbpB  64.63 
 
 
154 aa  195  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0049  heat shock chaperone IbpB  64.79 
 
 
142 aa  194  5.000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.206343 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2134  heat shock protein Hsp20  49.32 
 
 
145 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2668  heat shock protein HSP20  49.66 
 
 
147 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000229058  decreased coverage  0.000680468 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03570  heat shock chaperone  50 
 
 
137 aa  136  1e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0016  heat shock protein Hsp20  50 
 
 
137 aa  136  1e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4052  heat shock protein IbpA  50 
 
 
137 aa  136  1e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4232  heat shock protein IbpA  50 
 
 
137 aa  136  1e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5119  heat shock protein IbpA  50 
 
 
137 aa  136  1e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.188059 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3899  heat shock protein IbpA  50 
 
 
137 aa  136  1e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4195  heat shock protein IbpA  50 
 
 
137 aa  136  1e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0016  heat shock protein IbpA  50 
 
 
137 aa  136  1e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03514  hypothetical protein  50 
 
 
137 aa  136  1e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1953  heat shock protein Hsp20  47.26 
 
 
146 aa  134  3.0000000000000003e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0504926 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2277  16 kDa heat shock protein A  47.26 
 
 
147 aa  134  5e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4091  heat shock protein IbpA  49.28 
 
 
139 aa  134  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4198  heat shock protein IbpA  49.28 
 
 
139 aa  134  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4140  heat shock protein IbpA  49.28 
 
 
139 aa  134  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2020  16 kDa heat shock protein A  47.22 
 
 
147 aa  134  5e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0459252  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4036  heat shock protein IbpA  49.28 
 
 
139 aa  134  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4019  heat shock protein IbpA  49.28 
 
 
137 aa  134  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0013  heat shock protein IbpA  47.79 
 
 
136 aa  133  6.0000000000000005e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2492  heat shock protein Hsp20  45.89 
 
 
147 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00176998  hitchhiker  0.00301221 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2170  heat shock protein, Hsp20 family  43.36 
 
 
147 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0048  heat shock protein IbpA  47.45 
 
 
137 aa  132  9.999999999999999e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.208212 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1971  heat shock protein Hsp20  45.89 
 
 
147 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000191166  hitchhiker  0.0000381021 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1748  heat shock protein Hsp20  48.55 
 
 
147 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0323144  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1828  heat shock protein Hsp20  48.55 
 
 
147 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.122774  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2271  heat shock protein Hsp20  48.55 
 
 
147 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00909432  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2388  heat shock protein Hsp20  45.89 
 
 
147 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00175284  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2140  heat shock protein Hsp20  46.58 
 
 
147 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0232809  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2376  heat shock protein Hsp20  45.89 
 
 
147 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0181083  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1115  heat shock protein Hsp20  45.26 
 
 
160 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2501  16 kDa heat shock protein A  44.76 
 
 
145 aa  132  1.9999999999999998e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3646  heat shock protein Hsp20  42.65 
 
 
148 aa  131  3e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.498726  normal  0.603742 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2006  heat-shock protein IbpA  47.59 
 
 
149 aa  131  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.276785  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1980  heat shock protein Hsp20  43.26 
 
 
147 aa  130  5e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.168332  normal  0.0400891 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1909  heat shock protein Hsp20  46.58 
 
 
146 aa  130  5e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0679931  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23680  heat-shock protein IbpA  46.9 
 
 
149 aa  130  9e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00598173 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3580  chaperone protein IbpA  45.1 
 
 
156 aa  129  1.0000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3739  small heat shock protein  46.04 
 
 
155 aa  129  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1668  small heat shock protein IbpA (16 kDa heat shock protein A)  47.48 
 
 
139 aa  128  2.0000000000000002e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.172487  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38620  heat shock protein Hsp20  45.52 
 
 
152 aa  129  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38610  heat shock protein Hsp20  46.21 
 
 
152 aa  128  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1971  heat shock protein Hsp20  43.8 
 
 
154 aa  129  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1982  heat shock protein Hsp20  45.45 
 
 
149 aa  128  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.01007  normal  0.0434236 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0695  heat shock protein Hsp20  42.36 
 
 
153 aa  128  3e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0703839 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3321  heat shock protein Hsp20  44.2 
 
 
156 aa  128  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.945135 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3777  heat shock protein Hsp20  45.45 
 
 
147 aa  128  3e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.732741 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3620  heat shock protein Hsp20  44.2 
 
 
156 aa  127  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1728  heat shock protein Hsp20  44.52 
 
 
155 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.866083  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0410  heat shock protein Hsp20  44.52 
 
 
155 aa  127  7.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.390221  normal  0.0922711 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0212  heat shock protein Hsp20  42.03 
 
 
158 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.734603  normal  0.555417 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1513  heat shock protein Hsp20  44.76 
 
 
147 aa  127  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.307578  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3892  heat shock protein Hsp20  45.77 
 
 
160 aa  127  7.000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5071  heat shock protein Hsp20  43.26 
 
 
156 aa  126  8.000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4630  heat shock protein Hsp20  42.96 
 
 
162 aa  126  9.000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.127451  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4263  heat shock protein Hsp20  42.96 
 
 
167 aa  126  9.000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.135314 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1016  small heat shock protein  42.03 
 
 
158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.127734  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1545  heat shock protein Hsp20  44.76 
 
 
147 aa  125  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.114963 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5016  heat shock protein Hsp20  42.55 
 
 
156 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.244965  normal  0.0719894 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4556  heat shock protein Hsp20  42.55 
 
 
156 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0100935 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3725  heat shock protein Hsp20  42.03 
 
 
160 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2498  heat shock protein Hsp20  39.16 
 
 
155 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.566627 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3679  heat shock protein Hsp20  42.03 
 
 
160 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.481567 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2746  heat shock protein Hsp20  42.03 
 
 
168 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.145564  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0011  heat shock protein IbpA  45.26 
 
 
137 aa  124  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3795  heat shock protein IbpA  45.26 
 
 
137 aa  124  3e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2726  heat shock protein Hsp20  45.26 
 
 
160 aa  124  3e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.239135  normal  0.135003 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4143  heat shock protein IbpA  45.26 
 
 
137 aa  124  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002003  heat shock protein A  44.14 
 
 
145 aa  124  4.0000000000000003e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2676  heat shock protein Hsp20  41.3 
 
 
158 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.983147  normal  0.298779 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2961  small heat shock protein  42.36 
 
 
144 aa  124  5e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1564  heat shock protein Hsp20  46.1 
 
 
148 aa  124  5e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.403756  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3914  heat shock protein IbpA  46.72 
 
 
137 aa  124  6e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0034  heat shock protein IbpA  46.72 
 
 
137 aa  124  6e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0039  heat shock protein IbpA  46.72 
 
 
137 aa  124  6e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2892  putative small heat shock (HSP20) protein  41.01 
 
 
152 aa  124  6e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00328323  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00446  heat shock protein  45.26 
 
 
145 aa  124  6e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>