45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1154 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_1154  hypothetical protein  100 
 
 		 197 aa  399  9.999999999999999e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  unclonable  0.0000000000000130498  unclonable  0.000000151962 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2281  hypothetical protein  57.65 
 
 		 197 aa  234  7e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.380109  normal  0.354927 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1069  hypothetical protein  34.2 
 
 		 197 aa  106  3e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0767  hypothetical protein  31.75 
 
 		 188 aa  92  5e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00881796  unclonable  0.0000125283 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0501  hypothetical protein  30.51 
 
 		 180 aa  87  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4871  comF operon protein 3  31.21 
 
 		 234 aa  52.8  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0569  competence protein F, putative  31.21 
 
 		 249 aa  52.8  0.000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5041  comF operon protein 3  29.3 
 
 		 234 aa  52.8  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4886  comF operon protein 3  28.66 
 
 		 234 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5281  comF operon protein 3  29.3 
 
 		 190 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000208608 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5425  ComF operon protein 3  29.3 
 
 		 190 aa  52.4  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.412025  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5516  phosphoribosyltransferase  29.14 
 
 		 239 aa  50.8  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2141  comFC protein  26.14 
 
 		 219 aa  50.8  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3081  phosphoribosyltransferase  32.67 
 
 		 237 aa  48.5  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000295242  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4202  phosphoribosyltransferase  30.6 
 
 		 213 aa  47.8  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0030984 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2431  competence protein FC  25.49 
 
 		 219 aa  47.4  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1679  phosphoribosyltransferase  24.83 
 
 		 231 aa  47  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0188  phosphoribosyltransferase  25.69 
 
 		 239 aa  47  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.138467  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5357  comF operon protein 3  28.77 
 
 		 190 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3978  amidophosphoribosyltransferase  29.93 
 
 		 247 aa  46.2  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000228235  hitchhiker  0.000000230998 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0493  competence protein ComF, putative  28.21 
 
 		 244 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5299  comF operon protein 3  28.77 
 
 		 234 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3804  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.38 
 
 		 698 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00343497  decreased coverage  0.0000140841 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1314  hypothetical protein  26.06 
 
 		 226 aa  45.4  0.0006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3495  amidophosphoribosyltransferase  24.24 
 
 		 236 aa  44.3  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.552167 
 
 
-
 
NC_002950  PG0158  competence protein F-related protein  26.97 
 
 		 246 aa  44.3  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3856  phosphoribosyltransferase  26.67 
 
 		 232 aa  44.3  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0797  amidophosphoribosyltransferase-like protein  24.82 
 
 		 206 aa  44.7  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.582256  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0164  gluconate periplasmic binding protein  35.53 
 
 		 233 aa  44.3  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3749  gluconate periplasmic binding protein  35.53 
 
 		 233 aa  44.3  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3989  gluconate periplasmic binding protein  35.53 
 
 		 233 aa  44.3  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0447  phosphoribosyltransferase  27.22 
 
 		 229 aa  43.9  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.300519  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1490  competence protein  27.78 
 
 		 232 aa  43.5  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.923217  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5646  comF operon protein 3  25.48 
 
 		 190 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.740013  hitchhiker  0.00000001662 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3729  comF operon protein 3  27.33 
 
 		 234 aa  43.1  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.016688  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1028  competence protein F, putative  35.06 
 
 		 262 aa  43.5  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3894  phosphoribosyltransferase  27.65 
 
 		 259 aa  42.7  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.148595 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0617  phosphoribosyltransferase  26.9 
 
 		 247 aa  42.4  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5311  comF operon protein 3  25.48 
 
 		 190 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0506612  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0307  competence protein F  33.75 
 
 		 255 aa  42  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.387643 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4688  phosphoribosyltransferase  30.43 
 
 		 244 aa  41.6  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.482553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2675  competence protein F  30.86 
 
 		 253 aa  41.6  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0383  competence protein F  31.71 
 
 		 255 aa  41.6  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366991  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0385  phosphoribosyltransferase  28.76 
 
 		 271 aa  41.2  0.009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.543655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0026  phosphoribosyltransferase  30.97 
 
 		 254 aa  41.2  0.01  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>