148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_0767 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_0767  hypothetical protein  100 
 
 		 188 aa  384  1e-106  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00881796  unclonable  0.0000125283 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1154  hypothetical protein  31.75 
 
 		 197 aa  92  5e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  unclonable  0.0000000000000130498  unclonable  0.000000151962 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2281  hypothetical protein  30.53 
 
 		 197 aa  91.3  8e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.380109  normal  0.354927 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1069  hypothetical protein  28.95 
 
 		 197 aa  77.8  0.00000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0501  hypothetical protein  26.9 
 
 		 180 aa  74.3  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3184  putative phosphoribosyl transferase  24.34 
 
 		 230 aa  64.7  0.0000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.392419 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0453  phosphoribosyltransferase  27.94 
 
 		 257 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0234  putative competence protein F-related protein  26.32 
 
 		 240 aa  63.2  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0348529 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0188  phosphoribosyltransferase  31.58 
 
 		 239 aa  60.1  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.138467  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3081  phosphoribosyltransferase  29.82 
 
 		 237 aa  60.1  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000295242  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2102  competence protein F  27.66 
 
 		 246 aa  59.3  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3529  competence protein ComF  27.15 
 
 		 293 aa  59.3  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0273  putative competence protein F-related protein  25.68 
 
 		 268 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.317287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1977  hypothetical protein  29.49 
 
 		 231 aa  57  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3629  competence protein ComF  26.47 
 
 		 252 aa  57  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1128  phosphoribosyltransferase  26.75 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0423  ComF family protein  26.85 
 
 		 255 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0215  putative competence protein F-related protein  23.68 
 
 		 240 aa  57  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.162002 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2141  comFC protein  31.13 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0447  phosphoribosyltransferase  32.61 
 
 		 229 aa  56.2  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.300519  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2252  hypothetical protein  27.78 
 
 		 234 aa  55.8  0.0000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2280  hypothetical protein  27.78 
 
 		 234 aa  55.5  0.0000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0317  hypothetical protein  24.09 
 
 		 230 aa  55.1  0.0000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0134906 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4012  competence protein ComF  25.36 
 
 		 249 aa  54.3  0.0000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2181  hypothetical protein  26.14 
 
 		 227 aa  53.9  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000180305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1490  competence protein  30.17 
 
 		 232 aa  54.3  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.923217  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0317  gluconate periplasmic binding protein  24.43 
 
 		 233 aa  53.5  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2767  phosphoribosyltransferase  26.67 
 
 		 270 aa  53.5  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3800  competence protein ComF  25 
 
 		 262 aa  52.4  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0248  amidophosphoribosyltransferase  28.57 
 
 		 245 aa  51.6  0.000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.067407  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3894  phosphoribosyltransferase  27.12 
 
 		 259 aa  51.2  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.148595 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2905  phosphoribosyltransferase  27.94 
 
 		 270 aa  51.2  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0784  ComF family protein  23.84 
 
 		 251 aa  50.8  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0887705  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0109  phosphoribosyltransferase  25.64 
 
 		 245 aa  50.4  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0864582 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1028  competence protein F, putative  26.05 
 
 		 262 aa  50.4  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0218  competence protein,-like protein  27.85 
 
 		 273 aa  50.1  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0828937  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4625  competence protein ComF  22.06 
 
 		 235 aa  49.7  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0243  competence protein ComF  25.19 
 
 		 268 aa  49.7  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1458  comF family protein, putative  27.45 
 
 		 233 aa  49.3  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000115929  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0129  competence protein F  23.48 
 
 		 237 aa  49.7  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2431  competence protein FC  30.46 
 
 		 219 aa  49.3  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3805  competence protein ComF  22.79 
 
 		 268 aa  49.7  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.274004 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3880  gluconate periplasmic binding protein  23.46 
 
 		 227 aa  49.3  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3925  gluconate periplasmic binding protein  21.6 
 
 		 233 aa  48.9  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3881  competence protein ComF  22.79 
 
 		 268 aa  49.3  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2248  phosphoribosyltransferase  24.12 
 
 		 220 aa  49.3  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000079712  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3712  gluconate periplasmic binding protein  23.46 
 
 		 227 aa  48.9  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4633  gluconate periplasmic binding protein  23.95 
 
 		 227 aa  48.9  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4009  competence protein ComF  22.79 
 
 		 262 aa  48.9  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0559  phosphoribosyltransferase  25.62 
 
 		 248 aa  48.9  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.230828  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1124  competence protein F  28.7 
 
 		 233 aa  48.5  0.00006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2863  phosphoribosyltransferase  26.09 
 
 		 242 aa  48.5  0.00006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2292  ComF family protein  22.88 
 
 		 286 aa  48.5  0.00006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3709  gluconate periplasmic binding protein  23.46 
 
 		 227 aa  48.1  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.604176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0387  amidophosphoribosyltransferase-like protein  23.68 
 
 		 243 aa  48.1  0.00008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.336558  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0617  phosphoribosyltransferase  23.72 
 
 		 247 aa  47.8  0.00009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3051  amidophosphoribosyltransferase-like protein  24.05 
 
 		 216 aa  47.8  0.00009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4118  gluconate periplasmic binding protein  21.18 
 
 		 233 aa  47.8  0.00009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4126  competence protein ComF  23.53 
 
 		 263 aa  47.4  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1623  phosphoribosyltransferase  24.5 
 
 		 227 aa  47.4  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.933338  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3540  ComF family protein  31.3 
 
 		 242 aa  47.8  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4198  competence protein ComF  23.53 
 
 		 263 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3693  amidophosphoribosyl-transferase  23.29 
 
 		 230 aa  47.8  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.303537 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0572  ComF family protein  22.22 
 
 		 204 aa  47.8  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0235  gluconate periplasmic binding protein  24.37 
 
 		 239 aa  47.4  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3816  putative phosphoribosyl transferase  26.67 
 
 		 266 aa  47.8  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.231863 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3784  gluconate periplasmic binding protein  22.84 
 
 		 227 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3818  gluconate periplasmic binding protein  22.84 
 
 		 227 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01730  putative amidophosphoribosyl-transferase  27.21 
 
 		 226 aa  46.6  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.398316  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1412  hypothetical protein  27.97 
 
 		 231 aa  47  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0156224  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1236  ComF  26.14 
 
 		 233 aa  46.6  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.105721  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0911  hypothetical protein  25.21 
 
 		 255 aa  46.6  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.466894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3504  competence protein ComF  23.18 
 
 		 250 aa  47  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0141  competence protein ComF  23.53 
 
 		 263 aa  46.6  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3826  gluconate periplasmic binding protein  24.14 
 
 		 227 aa  46.6  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3888  gluconate periplasmic binding protein  23.33 
 
 		 227 aa  47  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4330  competence protein ComF  23.53 
 
 		 263 aa  46.6  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16480  amidophosphoribosyltransferase  24.17 
 
 		 243 aa  47  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.58809e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1242  hypothetical protein  23.67 
 
 		 271 aa  45.8  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4174  putative competence protein f-related protein  25.74 
 
 		 261 aa  45.8  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2437  competence protein F  20.92 
 
 		 262 aa  46.2  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104634 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0541  phosphoribosyltransferase  25.87 
 
 		 261 aa  46.2  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.380195  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0361  competence protein ComF, putative  22.81 
 
 		 243 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1247  phosphoribosyltransferase  26.72 
 
 		 202 aa  45.8  0.0004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0090  phosphoribosyltransferase  30 
 
 		 220 aa  45.4  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0258  amidophosphoribosyltransferases-like protein  24.27 
 
 		 279 aa  45.4  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1208  phosphoribosyltransferase  26.72 
 
 		 202 aa  45.8  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000195663  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4688  phosphoribosyltransferase  24.14 
 
 		 244 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.482553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2573  amidophosphoribosyltransferase  21.31 
 
 		 247 aa  45.4  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00031  amidophosphoribosyltransferase  32 
 
 		 486 aa  45.4  0.0005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.486133  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00031  amidophosphoribosyltransferase  29.13 
 
 		 486 aa  45.4  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00615  amidophosphoribosyltransferase  23.03 
 
 		 185 aa  45.4  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0300  gluconate periplasmic binding protein  21.79 
 
 		 227 aa  45.4  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0414054  normal  0.0237558 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2183  competence protein F  21.47 
 
 		 256 aa  45.1  0.0006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0808644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001878  predicted amidophosphoribosyltransferase  23.33 
 
 		 180 aa  45.1  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4720  gluconate periplasmic binding protein  22.44 
 
 		 248 aa  45.1  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0797  amidophosphoribosyltransferase-like protein  31.68 
 
 		 206 aa  45.1  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.582256  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1259  amidophosphoribosyltransferase-like protein  26.8 
 
 		 233 aa  45.1  0.0006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000170778  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1812  phosphoribosyltransferase  31.03 
 
 		 245 aa  45.1  0.0006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2861  phosphoribosyltransferase  24.63 
 
 		 265 aa  44.7  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.603337 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>