53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0032 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_0032  hypothetical protein  100 
 
 		 221 aa  436  1e-121  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.306313 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0039  hypothetical protein  47.57 
 
 		 210 aa  156  2e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.745199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2593  hypothetical protein  47.57 
 
 		 206 aa  155  5.0000000000000005e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.441598 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3562  hypothetical protein  48.39 
 
 		 212 aa  154  1e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2911  hypothetical protein  43.85 
 
 		 205 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.396041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3042  hypothetical protein  44.21 
 
 		 194 aa  146  2.0000000000000003e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2825  hypothetical protein  43.24 
 
 		 202 aa  141  6e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3627  hypothetical protein  46.84 
 
 		 227 aa  141  7e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.426525 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1164  hypothetical protein  43.24 
 
 		 210 aa  141  8e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.872281  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2756  hypothetical protein  42.7 
 
 		 202 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.014789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2296  protein of unknown function DUF448  41.67 
 
 		 234 aa  137  1e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0327098 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1048  hypothetical protein  42.86 
 
 		 247 aa  135  4e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.911629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0056  hypothetical protein  39.63 
 
 		 237 aa  134  9e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.955133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0441  hypothetical protein  47.56 
 
 		 259 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4617  protein of unknown function DUF448  42.65 
 
 		 249 aa  131  7.999999999999999e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.204222  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0748  hypothetical protein  42.53 
 
 		 200 aa  126  3e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.213653  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2924  protein of unknown function DUF448  40.4 
 
 		 247 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.964618  normal  0.0939755 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2820  protein of unknown function DUF448  41.71 
 
 		 243 aa  124  8.000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.19991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2698  hypothetical protein  40.4 
 
 		 247 aa  124  8.000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.430127  normal  0.265509 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3780  hypothetical protein  39.77 
 
 		 263 aa  124  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0580173  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2164  hypothetical protein  41.38 
 
 		 200 aa  123  2e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.121209  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0232  hypothetical protein  44.38 
 
 		 264 aa  123  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.024742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2076  hypothetical protein  40.8 
 
 		 217 aa  122  6e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.168905  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0023  hypothetical protein  41.88 
 
 		 221 aa  121  7e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.488276  normal  0.0323771 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2612  hypothetical protein  42.47 
 
 		 257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.150488  normal  0.180751 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0599  hypothetical protein  41.88 
 
 		 275 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.48783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0294  hypothetical protein  42.77 
 
 		 239 aa  119  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.211719  decreased coverage  0.00732343 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2069  hypothetical protein  35.14 
 
 		 215 aa  117  9.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.587906 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1253  hypothetical protein  34.39 
 
 		 211 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3929  hypothetical protein  42.78 
 
 		 211 aa  112  4.0000000000000004e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.336833  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0030  hypothetical protein  39.38 
 
 		 221 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0479  hypothetical protein  44.72 
 
 		 234 aa  111  9e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.256495 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3728  hypothetical protein  40.52 
 
 		 240 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.373596  normal  0.0153677 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4068  hypothetical protein  37.71 
 
 		 231 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4388  hypothetical protein  35.24 
 
 		 230 aa  108  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.693571 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0168  hypothetical protein  33.33 
 
 		 231 aa  107  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3440  hypothetical protein  36.22 
 
 		 240 aa  106  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.21121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0224  hypothetical protein  36 
 
 		 246 aa  101  8e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0611  hypothetical protein  34.87 
 
 		 252 aa  100  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0129859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2491  hypothetical protein  33.17 
 
 		 244 aa  94.7  9e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00369583  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3817  hypothetical protein  33.14 
 
 		 246 aa  89.7  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.429858  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1301  protein of unknown function DUF448  35.54 
 
 		 197 aa  81.6  0.000000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000545277  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2982  protein of unknown function DUF448  34.94 
 
 		 197 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.54059e-28 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0962  hypothetical protein  30.22 
 
 		 200 aa  77  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.342649  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1554  L7Ae family ribosomal protein  36.52 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000328024  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1668  protein of unknown function DUF448  33.59 
 
 		 203 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1585  50S ribosomal protein L7AE  38.95 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0618553  normal  0.174445 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1900  hypothetical protein  30.82 
 
 		 197 aa  63.2  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0283041  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl293  hypothetical protein  33.7 
 
 		 103 aa  60.5  0.00000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0458979  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1587  ribosomal protein L7Ae family protein  30.61 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00501586  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3728  50S ribosomal protein L7AE  29.93 
 
 		 210 aa  52.4  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.058823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0335  hypothetical protein  30.95 
 
 		 95 aa  47  0.0002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1153  protein of unknown function DUF448  31.03 
 
 		 96 aa  42.7  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000421176  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>