70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_2232 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_2232  hypothetical protein  100 
 
 
138 aa  265  2e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.791357  normal  0.0104044 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3972  hypothetical protein  36.67 
 
 
125 aa  76.3  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0829336  normal  0.0274812 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1132  hypothetical protein  33.87 
 
 
145 aa  75.5  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2116  putative small multidrug resistance transmembrane protein  37.84 
 
 
118 aa  67  0.00000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.380203  normal  0.497912 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0826  hypothetical protein  34.78 
 
 
150 aa  65.1  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2476  transporter  31.78 
 
 
117 aa  60.1  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000067585  decreased coverage  0.00107573 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3092  protein of unknown function DUF6, transmembrane  32.79 
 
 
147 aa  58.2  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0387826  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1198  small multidrug resistance protein  35.54 
 
 
123 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.969405  normal  0.128153 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4588  small multidrug resistance transmembrane protein  34.48 
 
 
123 aa  57.4  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.190224  hitchhiker  0.0040913 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0880  hypothetical protein  35.2 
 
 
126 aa  57.4  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0927  hypothetical protein  32.54 
 
 
141 aa  57  0.00000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.110405  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3729  transporter protein  30.1 
 
 
118 aa  57  0.00000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000221526  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5055  transporter  31.9 
 
 
114 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.539508  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5060  transporter  31.9 
 
 
114 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3408  hypothetical protein  31.82 
 
 
121 aa  56.2  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0526043  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0304  hypothetical protein  29.36 
 
 
120 aa  55.5  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00945381  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1259  putative small multidrug resistance transmembrane protein  33.88 
 
 
123 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.627101  normal  0.60267 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3380  hypothetical protein  34.4 
 
 
126 aa  55.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2827  hypothetical protein  32.8 
 
 
146 aa  54.7  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0460127  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0754  small multidrug resistance protein  33.88 
 
 
126 aa  54.3  0.0000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0921  hypothetical protein  46.77 
 
 
120 aa  54.3  0.0000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.729046  normal  0.185429 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0801  hypothetical protein  34.56 
 
 
159 aa  53.9  0.0000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.351912  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1796  hypothetical protein  33.33 
 
 
123 aa  51.2  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1152  hypothetical protein  32.79 
 
 
126 aa  51.6  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1768  hypothetical protein  33.33 
 
 
123 aa  51.2  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0433646  normal  0.271127 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2414  hypothetical protein  31.2 
 
 
126 aa  51.2  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000101456  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4229  putative inner membrane protein  42.86 
 
 
113 aa  50.8  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0853  hypothetical protein  36.61 
 
 
139 aa  50.8  0.000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0100048  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0955  hypothetical protein  37.62 
 
 
115 aa  50.1  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00515656  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0573  hypothetical protein  29.82 
 
 
118 aa  48.9  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.454488  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5159  hypothetical protein  33.33 
 
 
123 aa  49.3  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.486542  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1415  small multidrug resistance protein  33.33 
 
 
123 aa  48.9  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.303434  normal  0.334257 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4020  putative inner membrane protein  39.66 
 
 
113 aa  48.5  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.438672  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2966  hypothetical protein  36.17 
 
 
139 aa  48.1  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1882  hypothetical protein  32.48 
 
 
123 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.226664  hitchhiker  0.00000199647 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2961  hypothetical protein  29.17 
 
 
126 aa  47.8  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000116346  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3124  hypothetical protein  30.4 
 
 
122 aa  47.8  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0351825  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1858  hypothetical protein  32.48 
 
 
123 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6221  hypothetical protein  32.48 
 
 
123 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0765  putative small multi-drug resistant family protein  32.08 
 
 
113 aa  47.4  0.00006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3052  hypothetical protein  35 
 
 
122 aa  47.4  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0093  conserved hypothetical protein; inner membrane protein  31.43 
 
 
112 aa  47  0.00009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4991  hypothetical protein  30.63 
 
 
267 aa  46.6  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.788472  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2400  drug/metabolite exporter (DME) family protein  33.33 
 
 
123 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2694  hypothetical protein  30 
 
 
108 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0340055  normal  0.21056 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1389  hypothetical protein  33.33 
 
 
123 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2194  hypothetical protein  33.33 
 
 
123 aa  46.6  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000274513  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1879  hypothetical protein  33.33 
 
 
123 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.659154  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0018  hypothetical protein  33.33 
 
 
123 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2236  hypothetical protein  33.33 
 
 
123 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2274  hypothetical protein  33.33 
 
 
123 aa  47  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1151  hypothetical protein  33.33 
 
 
123 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.972837  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1802  putative small multidrug resistance transmembrane protein, DMT superfamily  32.5 
 
 
123 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.647816  hitchhiker  0.00398859 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2134  hypothetical protein  41.18 
 
 
284 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.546995 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3978  putative small multidrug resistance transmembrane protein  34.41 
 
 
123 aa  45.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.824098  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3453  hypothetical protein  30.36 
 
 
113 aa  44.7  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18320  hypothetical protein  38.78 
 
 
115 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.187347  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2159  hypothetical protein  36.36 
 
 
115 aa  44.3  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3323  hypothetical protein  32.43 
 
 
123 aa  43.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.565499  normal  0.239211 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0920  hypothetical protein  39.29 
 
 
145 aa  43.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.176487  normal  0.189611 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0286  hypothetical protein  27.08 
 
 
121 aa  43.1  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.248934  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4515  transporter protein  32.48 
 
 
123 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0688727 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2416  hypothetical protein  40 
 
 
119 aa  42.4  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.711582  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5526  Permeases of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily  30.84 
 
 
117 aa  42.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.625199  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1892  hypothetical protein  32.73 
 
 
116 aa  42  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.156341  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1588  hypothetical protein  38.78 
 
 
115 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1323  putative small multidrug resistance transmembrane protein  32.08 
 
 
123 aa  42  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.484105  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2846  hypothetical protein  38.18 
 
 
114 aa  41.6  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.367285  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2226  putative small multidrug resistance transmembrane protein  27.62 
 
 
112 aa  40.4  0.008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.545131  hitchhiker  0.00000175504 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0834  hypothetical protein  38.1 
 
 
275 aa  40  0.009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>