39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1564 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_1564  membrane protein  100 
 
 		 206 aa  409  1e-113  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0500  phosphatidate cytidylyltransferase  67.33 
 
 		 211 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1994  phosphatidate cytidylyltransferase  62.12 
 
 		 269 aa  260  8e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1685  membrane protein  60.59 
 
 		 218 aa  254  8e-67  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0453  phosphatidate cytidylyltransferase  61.69 
 
 		 223 aa  247  7e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.843154 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0488  phosphatidate cytidylyltransferase  59.51 
 
 		 220 aa  233  1.0000000000000001e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0497  phosphatidate cytidylyltransferase  61.39 
 
 		 226 aa  228  6e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1186  phosphatidate cytidylyltransferase  38.14 
 
 		 204 aa  102  6e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2406  CTP:2, 3-di-O-geranylgeranyl-sn-glycero-1-phosphate cytidyltransferase  28.64 
 
 		 199 aa  78.6  0.00000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.531038  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1411  phosphatidate cytidylyltransferase  27.04 
 
 		 230 aa  75.5  0.0000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1936  CTP:2, 3-di-O-geranylgeranyl-sn-glycero-1-phosphate cytidyltransferase  29.95 
 
 		 198 aa  68.2  0.00000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.168979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56382  predicted protein  26.98 
 
 		 227 aa  65.1  0.0000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03177  phosphatidate cytidylyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G13270)  32.43 
 
 		 381 aa  58.5  0.00000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0441776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3714  hypothetical protein  28.57 
 
 		 196 aa  58.2  0.00000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2262  phosphatidate cytidylyltransferase  27.56 
 
 		 181 aa  56.6  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2240  phosphatidate cytidylyltransferase  27.4 
 
 		 227 aa  53.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.687386 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1450  phosphatidate cytidylyltransferase  31.71 
 
 		 197 aa  52.8  0.000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0625007  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3224  phosphatidate cytidylyltransferase  26.47 
 
 		 225 aa  51.2  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28276  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2717  phosphatidate cytidylyltransferase, putative  30 
 
 		 208 aa  50.8  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.480674  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1815  phosphatidate cytidylyltransferase  29.95 
 
 		 181 aa  51.2  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1043  hypothetical protein  26.4 
 
 		 217 aa  50.4  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.416178 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2872  phosphatidate cytidylyltransferase  25.98 
 
 		 225 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0072  protein of unknown function DUF205  24.43 
 
 		 410 aa  50.1  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0369  phosphatidate cytidylyltransferase  27.92 
 
 		 237 aa  48.1  0.00008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.104235  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1986  dolichol kinase-like protein  29.6 
 
 		 196 aa  47.8  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00109651  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0082  phosphatidate cytidylyltransferase  28.08 
 
 		 236 aa  47.8  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.184871  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0852  hypothetical protein  25.66 
 
 		 387 aa  47  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0524  phosphatidate cytidylyltransferase  27.89 
 
 		 183 aa  46.2  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0735  phosphatidate cytidylyltransferase  30.5 
 
 		 237 aa  45.8  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.859315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1487  hypothetical protein  25.37 
 
 		 215 aa  45.1  0.0008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4221  phosphatidate cytidylyltransferase  25.12 
 
 		 235 aa  44.7  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.030183  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05650  dolichol kinase, putative  35.29 
 
 		 1011 aa  44.3  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.979152  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2171  phosphatidate cytidylyltransferase  28.21 
 
 		 237 aa  43.5  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21791  dolichol kinase  25.84 
 
 		 217 aa  43.5  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.174019 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1198  phosphatidate cytidylyltransferase  26.05 
 
 		 260 aa  42.7  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.126624  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0763  phosphatidate cytidylyltransferase  33.72 
 
 		 183 aa  42.4  0.004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.149439  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23590  CDP-diglyceride synthetase  32.59 
 
 		 280 aa  42.4  0.006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0168367 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1306  hypothetical protein  24.52 
 
 		 217 aa  42  0.006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2225  phosphatidate cytidylyltransferase  27.7 
 
 		 237 aa  41.2  0.01  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>