More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5659 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4272  ATP-dependent protease La  65.59 
 
 		 775 aa  686    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.41949  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1818  ATP-dependent protease La  69.19 
 
 		 798 aa  1105    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000643095  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2893  ATP-dependent protease La  45.07 
 
 		 812 aa  644    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.490936  normal  0.0275961 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1469  ATP-dependent protease La  44.67 
 
 		 823 aa  640    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00898612  normal  0.863404 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5659  ATP-dependent protease La  100 
 
 		 854 aa  1672    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.361913 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0599  ATP-dependent protease La  59.02 
 
 		 804 aa  905    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.737999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5873  ATP-dependent protease La  68.29 
 
 		 785 aa  1014    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3336  ATP-dependent protease La  60.76 
 
 		 780 aa  917    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.594281  normal  0.0410698 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2802  ATP-dependent protease La  59.83 
 
 		 783 aa  907    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.289517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2249  ATP-dependent protease La  62.32 
 
 		 778 aa  942    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.622317  normal  0.359605 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3246  Endopeptidase La  64.99 
 
 		 789 aa  989    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171847  normal  0.924213 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2928  ATP-dependent protease La  53.35 
 
 		 760 aa  768    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0257746  normal  0.350775 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3064  ATP-dependent protease La  59.79 
 
 		 776 aa  909    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.870237  normal  0.872303 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2775  ATP-dependent protease La  59.95 
 
 		 783 aa  909    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.560852  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5508  ATP-dependent protease La  61.19 
 
 		 835 aa  949    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.528904 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3988  ATP-dependent protease La  61.22 
 
 		 769 aa  947    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.180349  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2819  ATP-dependent protease La  59.95 
 
 		 783 aa  909    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.246765  normal  0.027393 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2110  ATP-dependent protease La  43.67 
 
 		 793 aa  622  1e-176  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1892  ATP-dependent protease La  43.27 
 
 		 793 aa  596  1e-169  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0163436  hitchhiker  0.00257453 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1560  ATP-dependent protease La  41.41 
 
 		 792 aa  589  1e-167  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4561  ATP-dependent protease La 1  41.22 
 
 		 773 aa  587  1e-166  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4606  ATP-dependent protease La 1  40.98 
 
 		 776 aa  586  1e-166  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000105653  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4214  endopeptidase La (ATP-dependent protease La 1)  40.98 
 
 		 776 aa  586  1e-166  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000107008  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4203  endopeptidase La (ATP-dependent protease La 1)  40.87 
 
 		 776 aa  585  1.0000000000000001e-165  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000103757  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4557  ATP-dependent protease La 1  40.87 
 
 		 776 aa  585  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4792  ATP-dependent protease La  42.5 
 
 		 812 aa  584  1.0000000000000001e-165  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2098  ATP-dependent protease La  42.81 
 
 		 828 aa  579  1e-164  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.293508 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4588  ATP-dependent protease La 1  40.87 
 
 		 776 aa  582  1e-164  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.349716  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4367  ATP-dependent protease La 1  40.63 
 
 		 776 aa  580  1e-164  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000611183  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4702  ATP-dependent protease La 1  40.68 
 
 		 773 aa  580  1e-164  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0646  ATP-dependent protease La 1  40.87 
 
 		 776 aa  581  1e-164  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2153  ATP-dependent protease La  42.48 
 
 		 813 aa  580  1e-164  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.582641  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3193  ATP-dependent protease La  41.68 
 
 		 819 aa  576  1.0000000000000001e-163  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1713  ATP-dependent protease LA protein  42.21 
 
 		 806 aa  577  1.0000000000000001e-163  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.0334567 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1867  ATP-dependent protease La  42.21 
 
 		 804 aa  577  1.0000000000000001e-163  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0743782  hitchhiker  0.00647578 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4315  ATP-dependent protease La  40.68 
 
 		 773 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2585  ATP-dependent protease La  40.61 
 
 		 774 aa  576  1.0000000000000001e-163  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1534  ATP-dependent protease La  42.21 
 
 		 804 aa  577  1.0000000000000001e-163  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.254924 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3353  ATP-dependent protease La  40.83 
 
 		 806 aa  577  1.0000000000000001e-163  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.273973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0683  ATP-dependent protease La  40.73 
 
 		 810 aa  573  1.0000000000000001e-162  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0018045  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2915  ATP-dependent protease La  41.55 
 
 		 805 aa  575  1.0000000000000001e-162  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1226  endopeptidase La  41.92 
 
 		 785 aa  575  1.0000000000000001e-162  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000223975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2559  ATP-dependent protease La  38.77 
 
 		 810 aa  570  1e-161  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1796  ATP-dependent protease La  42.3 
 
 		 785 aa  570  1e-161  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2418  ATP-dependent protease La  41.33 
 
 		 806 aa  572  1e-161  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.679519  normal  0.805498 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2681  ATP-dependent protease La  41.33 
 
 		 806 aa  572  1e-161  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.492035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1707  ATP-dependent protease La  42.91 
 
 		 843 aa  571  1e-161  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00968626  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3815  ATP-dependent protease La  40.63 
 
 		 783 aa  570  1e-161  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0134568  normal  0.586345 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2594  ATP-dependent protease La  41.9 
 
 		 783 aa  571  1e-161  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000142236  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2373  ATP-dependent protease La  41.21 
 
 		 807 aa  569  1e-160  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1687  ATP-dependent protease La  41.51 
 
 		 801 aa  567  1e-160  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000016663  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2748  ATP-dependent protease La  42.07 
 
 		 785 aa  566  1e-160  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000341636  normal  0.663967 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2141  ATP-dependent protease La  42.25 
 
 		 835 aa  566  1e-160  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0189691  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1033  ATP-dependent protease La  41.01 
 
 		 811 aa  566  1e-160  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0951111  hitchhiker  0.0000000189689 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1411  Lon-A peptidase  41.56 
 
 		 811 aa  567  1e-160  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000104589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1492  ATP-dependent protease La  42.07 
 
 		 785 aa  567  1e-160  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000160323  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5926  ATP-dependent protease La  42.18 
 
 		 803 aa  566  1e-160  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2493  Lon-A peptidase  42.19 
 
 		 785 aa  567  1e-160  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000173516  normal  0.0963956 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2561  Lon-A peptidase  42.3 
 
 		 785 aa  567  1e-160  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000338529  normal  0.0789552 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2231  ATP-dependent protease La  42.25 
 
 		 835 aa  566  1e-160  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.019328  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2659  Lon-A peptidase  41.99 
 
 		 785 aa  567  1e-160  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000097236  normal  0.812724 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0493  ATP-dependent protease La  42.26 
 
 		 797 aa  567  1e-160  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.229233  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2182  ATP-dependent protease La  40.61 
 
 		 804 aa  565  1.0000000000000001e-159  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.542449 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0912  ATP-dependent protease La  41.01 
 
 		 796 aa  565  1.0000000000000001e-159  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1595  ATP-dependent protease La  41.95 
 
 		 785 aa  564  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000103769  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1827  hypothetical protein  40.12 
 
 		 816 aa  565  1.0000000000000001e-159  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1823  hypothetical protein  40 
 
 		 816 aa  562  1.0000000000000001e-159  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3111  ATP-dependent protease La  41.28 
 
 		 785 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000302601  hitchhiker  0.00000706703 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1543  endopeptidase La  41.41 
 
 		 781 aa  564  1.0000000000000001e-159  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000152333  hitchhiker  0.000667603 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1606  ATP-dependent protease La  42.27 
 
 		 784 aa  565  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000976039  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004042  ATP-dependent protease La Type I  40.94 
 
 		 783 aa  565  1.0000000000000001e-159  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000129867  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1171  Lon-A peptidase  41.68 
 
 		 804 aa  563  1.0000000000000001e-159  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.618926  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0536  ATP-dependent protease La  40.74 
 
 		 808 aa  564  1.0000000000000001e-159  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1629  ATP-dependent protease La  41.95 
 
 		 785 aa  564  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000414531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0994  ATP-dependent protease La  40.65 
 
 		 786 aa  564  1.0000000000000001e-159  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0985601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0691  ATP-dependent protease La  39.74 
 
 		 817 aa  561  1e-158  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000937415  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3214  Lon-A peptidase  40.8 
 
 		 823 aa  560  1e-158  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0115305  hitchhiker  0.000000048524 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2506  ATP-dependent protease La  41.82 
 
 		 785 aa  561  1e-158  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000773513  normal  0.491127 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1079  ATP-dependent protease La  40.66 
 
 		 824 aa  559  1e-158  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.932404  normal  0.310729 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2044  Lon-A peptidase  40.73 
 
 		 802 aa  562  1e-158  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1897  peptidase S16, ATP-dependent protease La  40.42 
 
 		 808 aa  558  1e-157  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2679  ATP-dependent protease La  41.29 
 
 		 785 aa  556  1e-157  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000848642  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1552  Lon-A peptidase  41.75 
 
 		 806 aa  555  1e-157  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0531  Lon-A peptidase  40.28 
 
 		 768 aa  556  1e-157  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000877407  normal  0.534279 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1476  ATP-dependent protease La  40.35 
 
 		 797 aa  556  1e-157  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.10535  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2286  Lon-A peptidase  42 
 
 		 816 aa  558  1e-157  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.620388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41220  Lon protease  40.82 
 
 		 798 aa  555  1e-157  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.238701 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2604  ATP-dependent protease La  40.33 
 
 		 823 aa  558  1e-157  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0869192  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2576  ATP-dependent protease La  45.56 
 
 		 802 aa  554  1e-156  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0456726  normal  0.0149166 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2559  ATP-dependent protease La  45.21 
 
 		 794 aa  555  1e-156  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0604  ATP-dependent protease La  40.52 
 
 		 816 aa  553  1e-156  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.601617  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5273  ATP-dependent protease La  41.27 
 
 		 805 aa  554  1e-156  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14910  ATP-dependent protease La  39.55 
 
 		 783 aa  553  1e-156  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1777  ATP-dependent protease La  40.78 
 
 		 802 aa  554  1e-156  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.169591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3090  DNA-binding ATP-dependent protease La  40.33 
 
 		 784 aa  549  1e-155  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  0.00000000000000593102  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6716  ATP-dependent protease La  48.38 
 
 		 798 aa  550  1e-155  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.902322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2557  ATP-dependent protease La  42.64 
 
 		 802 aa  550  1e-155  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0122618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1510  ATP-dependent protease LA  40.83 
 
 		 786 aa  551  1e-155  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000293183  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3593  ATP-dependent protease La  41.18 
 
 		 805 aa  546  1e-154  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.333831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1097  DNA-binding ATP-dependent protease La  41.22 
 
 		 784 aa  546  1e-154  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000612483  hitchhiker  0.00000716976 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>