More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2373 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_2373  ABC transporter related  100 
 
 
225 aa  431  1e-120  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0253  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  40.85 
 
 
240 aa  167  9e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  7.10517e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0292  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.73 
 
 
247 aa  153  2e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1172  ABC transporter related  44.69 
 
 
251 aa  153  3e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.867834  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1617  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  41.82 
 
 
247 aa  150  1e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000736916  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1467  ABC transporter related protein  44.55 
 
 
222 aa  149  4e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1201  ABC transporter related  38.92 
 
 
617 aa  146  3e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1053  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  40.49 
 
 
246 aa  145  4e-34  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.588648  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4231  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  36.64 
 
 
249 aa  145  5e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0627  basic organic compound ABC-transporter  41.36 
 
 
251 aa  144  8e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2821  ABC transporter, ATPase subunit  44.61 
 
 
237 aa  144  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.341071  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0645  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  40 
 
 
246 aa  144  1e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0719  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  40 
 
 
246 aa  144  1e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.153614  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1929  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  37.74 
 
 
255 aa  144  1e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0696107  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0798  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  39.51 
 
 
246 aa  143  2e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.205108  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3752  phosphate transporter ATP-binding protein  40.71 
 
 
293 aa  142  3e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.600965 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0713  ABC transporter related protein  39.51 
 
 
245 aa  142  5e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0161092  normal  0.0156766 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0519  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  37.1 
 
 
364 aa  142  6e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.629407  normal  0.744926 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1778  ABC transporter related  37.1 
 
 
271 aa  142  6e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00372314 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  39.51 
 
 
245 aa  141  7e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1376  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  36.99 
 
 
260 aa  140  1e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000114898  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1679  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  38.5 
 
 
286 aa  140  1e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0234903  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0808  putative phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  37.39 
 
 
255 aa  140  2e-32  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00357  ABC transporter ATP-binding protein  39.09 
 
 
249 aa  140  2e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1617  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  37.61 
 
 
284 aa  139  3e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.336518  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1919  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  42.23 
 
 
253 aa  139  4e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.603751  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2696  ABC transporter related  38.94 
 
 
241 aa  139  4e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1992  phosphate transporter ATP-binding protein  37.02 
 
 
249 aa  139  4e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0439  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  36.89 
 
 
250 aa  139  4e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0501472  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0539  phosphate ABC transporter permease  41.83 
 
 
272 aa  139  4e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1236  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  39.44 
 
 
286 aa  139  5e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.534632  normal  0.227488 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1202  ABC transporter related  39.07 
 
 
256 aa  139  5e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0445  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  39.06 
 
 
268 aa  138  6e-32  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1041  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  40.19 
 
 
284 aa  138  7e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  3.53293e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5550  glutamine ABC transporter  39.63 
 
 
507 aa  137  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.488891  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4922  ABC transporter related  46.05 
 
 
253 aa  137  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0024396 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0396  ABC transporter related  40.5 
 
 
253 aa  137  1e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  1.27447e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10951  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  42.59 
 
 
276 aa  137  1e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.79244 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0946  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  37.05 
 
 
287 aa  137  1e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.754172 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  38.81 
 
 
244 aa  136  2e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3118  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  38.86 
 
 
291 aa  137  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0430987  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3166  ABC transporter related  37.91 
 
 
242 aa  137  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.631435  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1656  ABC transporter related  38.16 
 
 
255 aa  136  3e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00836866  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1479  phosphate ABC transporter permease  37.78 
 
 
260 aa  136  3e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0327  ABC transporter related  36.15 
 
 
244 aa  136  3e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.115025  normal  0.15023 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1820  ABC transporter related  37.93 
 
 
248 aa  135  3e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.327234  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1910  phosphate transporter ATP-binding protein  42.65 
 
 
256 aa  136  3e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.57723  normal  0.261135 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0569  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  40.09 
 
 
251 aa  136  3e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2631  ABC transporter related  41.09 
 
 
264 aa  135  4e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000448343  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4560  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  42.11 
 
 
594 aa  135  4e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0482  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  40.57 
 
 
253 aa  135  5e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1053  ABC transporter related  34.91 
 
 
242 aa  135  7e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  40.51 
 
 
239 aa  135  7e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  4.09698e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1559  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  38.39 
 
 
251 aa  134  8e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6373  ABC transporter related  38.43 
 
 
254 aa  134  8e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.535484  normal  0.530942 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0988  phosphate transporter ATP-binding protein  38.91 
 
 
252 aa  134  8e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.265224  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2406  ABC phosphate transporter ATP-binding protein  36.68 
 
 
275 aa  134  9e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0506125 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1928  phosphate transporter ATP-binding protein  39.61 
 
 
251 aa  134  9e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.333841  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2279  phosphate transporter ATP-binding protein  37.61 
 
 
275 aa  134  9e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0589752  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  37.31 
 
 
244 aa  134  9e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03093  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  44.06 
 
 
335 aa  134  1e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0371  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  35.32 
 
 
252 aa  134  1e-30  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.959364  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1242  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  39.71 
 
 
286 aa  134  1e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.867725  normal  0.755467 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1050  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  39.15 
 
 
265 aa  134  1e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.597616  hitchhiker  4.48659e-07 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2847  ABC transporter-related protein  37.75 
 
 
240 aa  134  1e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.174952  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3055  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  42.58 
 
 
595 aa  134  1e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0704257  decreased coverage  0.00962069 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0881  phosphate transporter ATP-binding protein  43 
 
 
255 aa  134  1e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0906767 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2660  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  38.12 
 
 
253 aa  134  1e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2386  phosphate transporter ATP-binding protein  41.06 
 
 
253 aa  134  1e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00455032  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2860  ABC transporter related  41.43 
 
 
242 aa  134  1e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0471  ABC transporter related  31.96 
 
 
240 aa  134  1e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.185653  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1064  ABC transporter related  40.39 
 
 
252 aa  134  1e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  33.18 
 
 
240 aa  133  2e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0397  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  41.06 
 
 
284 aa  133  2e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3638  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  36.48 
 
 
267 aa  133  2e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000916154  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2890  phosphate transporter ATP-binding protein  40.09 
 
 
252 aa  133  2e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0597569 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  33.64 
 
 
240 aa  133  2e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1596  ABC transporter related  37.78 
 
 
249 aa  133  2e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0658  phosphate transporter ATP-binding protein  37.67 
 
 
260 aa  133  2e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40.7 
 
 
253 aa  133  2e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00684125  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02349  ATP-binding cassette multidrug transport protein ATRC [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9Y8G2]  39.45 
 
 
1284 aa  133  3e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.506788  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0489  phosphate transporter ATP-binding protein  39.01 
 
 
271 aa  133  3e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.357305  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2890  ABC transporter  38.26 
 
 
261 aa  132  3e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00124978  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34660  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  41.1 
 
 
260 aa  133  3e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2154  ABC transporter related  37.44 
 
 
274 aa  132  3e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.117419  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0377  ABC transporter-like  40.89 
 
 
244 aa  133  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.250088 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1794  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  35.71 
 
 
295 aa  132  3e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0186801  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0857  ABC transporter related  42.56 
 
 
243 aa  132  3e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00848915 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1021  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  38.68 
 
 
265 aa  132  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000242  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease component  39.22 
 
 
586 aa  132  4e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0477  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  36.82 
 
 
252 aa  132  4e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0601  phosphate transporter ATP-binding protein  38.22 
 
 
248 aa  132  4e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.889031  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2294  ABC transporter related protein  39.07 
 
 
255 aa  132  4e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0200  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  39.23 
 
 
274 aa  132  4e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.249945  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0506  ABC transporter, ATP-binding protein/permease  35.48 
 
 
612 aa  132  4e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.740474 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001265  phosphate transport ATP-binding protein PstB  37.89 
 
 
249 aa  132  4e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0545  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  37.32 
 
 
244 aa  132  4e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  8.20774e-05  unclonable  1.61335e-28 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0489  ABC transporter, ATP-binding protein  38.57 
 
 
341 aa  132  4e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0551  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  39.5 
 
 
268 aa  132  4e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.41658  hitchhiker  1.78063e-20 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6145  phosphate transporter ATP-binding protein  41.55 
 
 
277 aa  132  4e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>