More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0489 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011989  Avi_0489  phosphate transporter ATP-binding protein  100 
 
 
271 aa  567  1e-161  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.357305  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0122  phosphate transporter ATP-binding protein  89.67 
 
 
271 aa  512  1e-144  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.341225 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0171  phosphate transporter ATP-binding protein  88.19 
 
 
271 aa  509  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0181  phosphate transporter ATP-binding protein  88.19 
 
 
271 aa  508  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.353351 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0768  phosphate transporter ATP-binding protein  76.92 
 
 
273 aa  435  1e-121  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0255819  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3118  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  80.72 
 
 
291 aa  428  1e-119  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0430987  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2141  phosphate transporter ATP-binding protein  78.74 
 
 
257 aa  421  1e-117  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2056  phosphate transporter ATP-binding protein  78.35 
 
 
257 aa  417  1e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12029  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0397  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  71.96 
 
 
284 aa  410  1e-114  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3752  phosphate transporter ATP-binding protein  73.76 
 
 
293 aa  413  1e-114  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.600965 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0601  phosphate transporter ATP-binding protein  76.21 
 
 
248 aa  401  1e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.889031  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1259  phosphate transporter ATP-binding protein  70.77 
 
 
265 aa  397  9.999999999999999e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1541  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  75.1 
 
 
265 aa  398  9.999999999999999e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000871214  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4327  phosphate transporter ATP-binding protein  71.86 
 
 
265 aa  397  9.999999999999999e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.172468  normal  0.997199 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1259  phosphate transporter ATP-binding protein  71.32 
 
 
265 aa  394  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2601  phosphate transporter ATP-binding protein  71.32 
 
 
265 aa  394  1e-109  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1536  phosphate transporter ATP-binding protein  70.66 
 
 
264 aa  395  1e-109  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.424595  normal  0.394597 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2279  phosphate transporter ATP-binding protein  70.5 
 
 
275 aa  392  1e-108  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0589752  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1922  phosphate transporter ATP-binding protein  70.16 
 
 
265 aa  390  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.588083 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4548  phosphate transporter ATP-binding protein  71.37 
 
 
302 aa  389  1e-107  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.662956  normal  0.262151 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2292  phosphate transporter ATP-binding protein  68.16 
 
 
283 aa  390  1e-107  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0823  phosphate transporter ATP-binding protein  71.37 
 
 
260 aa  390  1e-107  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00511308 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1074  phosphate transporter ATP-binding protein  75.1 
 
 
247 aa  386  1e-106  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.566041  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1231  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  70.92 
 
 
281 aa  387  1e-106  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.758755 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3626  phosphate transporter ATP-binding protein  73.47 
 
 
295 aa  386  1e-106  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.926867  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1225  phosphate transporter ATP-binding protein  71.89 
 
 
252 aa  384  1e-105  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.315326  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3315  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  69.48 
 
 
290 aa  374  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0283925  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0481  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  69.88 
 
 
263 aa  370  1e-101  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.180726  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2406  ABC phosphate transporter ATP-binding protein  68.53 
 
 
275 aa  367  1e-100  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0506125 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21550  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  69.8 
 
 
253 aa  363  1e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0469  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  65.06 
 
 
254 aa  356  1.9999999999999998e-97  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0379  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  64.43 
 
 
254 aa  350  2e-95  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.198087  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1569  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  63.86 
 
 
251 aa  350  2e-95  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0498  phosphate ABC transporter permease  62.85 
 
 
254 aa  348  5e-95  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0350  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  64.26 
 
 
251 aa  348  6e-95  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.000161831 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0881  phosphate transporter ATP-binding protein  66.53 
 
 
255 aa  347  9e-95  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0906767 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0486  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  63.86 
 
 
251 aa  346  2e-94  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0423  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  62.7 
 
 
251 aa  346  2e-94  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1856  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  59.23 
 
 
273 aa  345  3e-94  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1479  phosphate ABC transporter permease  61.66 
 
 
260 aa  344  7e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1910  phosphate transporter ATP-binding protein  63.35 
 
 
256 aa  343  2e-93  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.57723  normal  0.261135 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0114  phosphate ABC transporter permease  64.26 
 
 
252 aa  341  8e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2386  phosphate transporter ATP-binding protein  65.2 
 
 
253 aa  341  9e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00455032  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0954  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  62.5 
 
 
276 aa  340  2e-92  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.222469  normal  0.101255 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1416  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  63.05 
 
 
251 aa  338  5.9999999999999996e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00175163  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1595  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  61.09 
 
 
301 aa  337  9.999999999999999e-92  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.332102  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0092  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  62.4 
 
 
255 aa  337  9.999999999999999e-92  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1963  phosphate transporter ATP-binding protein  58.82 
 
 
253 aa  337  9.999999999999999e-92  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4145  phosphate transporter ATP-binding protein  64.66 
 
 
262 aa  337  9.999999999999999e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4003  phosphate transporter ATP-binding protein  64.66 
 
 
262 aa  337  9.999999999999999e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3821  ABC-type phosphate transporter, ATP-binding protein  62.25 
 
 
249 aa  337  9.999999999999999e-92  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.970472 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0851  phosphate transporter ATP-binding protein  63.67 
 
 
271 aa  337  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0709  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  63.05 
 
 
251 aa  336  1.9999999999999998e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4349  phosphate transporter ATP-binding protein  63.27 
 
 
271 aa  335  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4171  phosphate transporter ATP-binding protein  63.27 
 
 
271 aa  335  2.9999999999999997e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4009  phosphate transporter ATP-binding protein  63.27 
 
 
271 aa  335  2.9999999999999997e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4019  phosphate transporter ATP-binding protein  63.27 
 
 
271 aa  335  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48570  phosphate transporter ATP-binding protein  63.79 
 
 
277 aa  335  2.9999999999999997e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.253106  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4493  phosphate transporter ATP-binding protein  63.27 
 
 
271 aa  335  2.9999999999999997e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4289  phosphate transporter ATP-binding protein  63.27 
 
 
271 aa  335  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.010131 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4402  phosphate transporter ATP-binding protein  63.27 
 
 
271 aa  335  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1992  phosphate transporter ATP-binding protein  62.45 
 
 
249 aa  336  2.9999999999999997e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2997  phosphate transporter ATP-binding protein  61.54 
 
 
271 aa  336  2.9999999999999997e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5234  phosphate transporter ATP-binding protein  61.72 
 
 
277 aa  335  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.634569  normal  0.16068 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4385  phosphate transporter ATP-binding protein  63.27 
 
 
271 aa  335  3.9999999999999995e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.893389  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5373  phosphate transporter ATP-binding protein  64.2 
 
 
277 aa  335  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.417045 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5326  phosphate transporter ATP-binding protein  61.72 
 
 
281 aa  335  5e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.364055  normal  0.0105558 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0586  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  62.65 
 
 
272 aa  335  5e-91  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.518906 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4122  phosphate transporter ATP-binding protein  63.27 
 
 
271 aa  335  5e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0148  phosphate transporter ATP-binding protein  64.2 
 
 
277 aa  335  7e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6145  phosphate transporter ATP-binding protein  60.54 
 
 
277 aa  334  7.999999999999999e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5612  phosphate transporter ATP-binding protein  64.2 
 
 
277 aa  334  7.999999999999999e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.8399  normal  0.188753 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70810  phosphate transporter ATP-binding protein  60.54 
 
 
277 aa  334  7.999999999999999e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.356471 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0621  phosphate transporter ATP-binding protein  64.49 
 
 
261 aa  334  7.999999999999999e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0621  phosphate transporter ATP-binding protein  61.57 
 
 
253 aa  333  1e-90  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.118922  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0607  phosphate transporter ATP-binding protein  61.57 
 
 
253 aa  333  1e-90  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.080383  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2831  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  59.84 
 
 
252 aa  333  2e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0182  phosphate transporter ATP-binding protein  63.37 
 
 
277 aa  333  2e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1079  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  61.96 
 
 
252 aa  333  3e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.376922  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2660  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  61.96 
 
 
253 aa  332  3e-90  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4119  phosphate transporter ATP-binding protein  63.86 
 
 
262 aa  332  3e-90  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1928  phosphate transporter ATP-binding protein  63.45 
 
 
251 aa  332  4e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.333841  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2104  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  60.64 
 
 
252 aa  332  6e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0569  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  65.04 
 
 
251 aa  331  6e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2548  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  65.59 
 
 
292 aa  331  9e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.126141 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5038  phosphate transporter ATP-binding protein  58.67 
 
 
277 aa  330  1e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.268746  normal  0.333592 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2388  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  62.55 
 
 
249 aa  330  1e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000155567  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1137  phosphate transporter ATP-binding protein  62.3 
 
 
285 aa  330  2e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.326059  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0093  phosphate transporter ATP-binding protein  63.11 
 
 
284 aa  330  2e-89  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1483  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  60.82 
 
 
249 aa  329  3e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00537874  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4154  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  61.2 
 
 
272 aa  329  3e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.914841  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0421  phosphate transporter ATP-binding protein  62.65 
 
 
260 aa  328  4e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.846145 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2890  phosphate transporter ATP-binding protein  62.25 
 
 
252 aa  328  4e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0597569 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3638  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  60.96 
 
 
267 aa  328  5.0000000000000004e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000916154  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2278  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  62.3 
 
 
253 aa  328  6e-89  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1781  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  58.78 
 
 
258 aa  328  6e-89  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2650  phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  64.49 
 
 
285 aa  328  6e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.567129  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0291  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  55.6 
 
 
267 aa  327  1.0000000000000001e-88  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000180282  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0982  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  60 
 
 
253 aa  327  1.0000000000000001e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0534146 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0622  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  60.24 
 
 
269 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.970932  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>