20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0292 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0292  hypothetical protein  100 
 
 		 225 aa  456  1e-127  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000146713  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3596  type IV pilus assembly PilZ  53.88 
 
 		 220 aa  256  2e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01915  hypothetical protein  30.56 
 
 		 227 aa  96.3  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.429249  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2388  type IV pilus assembly PilZ  25.96 
 
 		 208 aa  90.1  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2953  type IV pilus assembly PilZ  25.23 
 
 		 222 aa  75.9  0.0000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4246  hypothetical protein  24.74 
 
 		 224 aa  64.7  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2294  putative type IV pilus assembly (PilZ) protein  28.46 
 
 		 224 aa  61.6  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0573  type IV pilus assembly PilZ  24.86 
 
 		 226 aa  59.3  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.960083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2273  type IV pilus assembly PilZ  25.84 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0091  hypothetical protein  25 
 
 		 252 aa  57.8  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000127543  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3582  hypothetical protein  28.68 
 
 		 236 aa  55.1  0.0000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0672  hypothetical protein  26.26 
 
 		 236 aa  53.5  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0260  hypothetical protein  30.83 
 
 		 237 aa  53.9  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.360055  normal  0.584816 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2668  type IV pilus assembly PilZ  22.77 
 
 		 236 aa  53.5  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0801155 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1127  type IV pilus assembly PilZ  23.78 
 
 		 214 aa  52.8  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3949  type IV pilus assembly PilZ  25 
 
 		 222 aa  52.4  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2266  hypothetical protein  29.5 
 
 		 236 aa  50.4  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.116308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2940  hypothetical protein  25.14 
 
 		 222 aa  50.1  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001233  hypothetical protein  23.61 
 
 		 268 aa  46.2  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.107425  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05100  hypothetical protein  21.96 
 
 		 248 aa  43.5  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>