More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1295 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_1310  phosphopyruvate hydratase  75.59 
 
 
429 aa  651    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2987  phosphopyruvate hydratase  71.93 
 
 
428 aa  641    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000287207  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1505  phosphopyruvate hydratase  100 
 
 
431 aa  874    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.246827  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1295  phosphopyruvate hydratase  100 
 
 
431 aa  874    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000258447  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0143  phosphopyruvate hydratase  72.92 
 
 
433 aa  632  1e-180  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000522536  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0136  phosphopyruvate hydratase  71.63 
 
 
427 aa  632  1e-180  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3133  phosphopyruvate hydratase  72.83 
 
 
430 aa  629  1e-179  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1403  phosphopyruvate hydratase  74.83 
 
 
434 aa  623  1e-177  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000162747  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2958  phosphopyruvate hydratase  72.6 
 
 
430 aa  624  1e-177  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000744717  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1780  phosphopyruvate hydratase  70.02 
 
 
429 aa  612  9.999999999999999e-175  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000860602  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3678  phosphopyruvate hydratase  70.26 
 
 
430 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00320398  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2254  phosphopyruvate hydratase  70.7 
 
 
431 aa  608  1e-173  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0274446  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0266  enolase  72.71 
 
 
428 aa  607  1e-173  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0768  enolase  71.03 
 
 
431 aa  608  1e-173  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0396287  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3933  enolase  70.45 
 
 
426 aa  610  1e-173  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000019797  normal  0.771462 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4824  phosphopyruvate hydratase  69.63 
 
 
431 aa  604  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.223702  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2286  phosphopyruvate hydratase  70.82 
 
 
428 aa  601  1.0000000000000001e-171  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4985  phosphopyruvate hydratase  69.39 
 
 
431 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4814  phosphopyruvate hydratase  69.39 
 
 
431 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5364  phosphopyruvate hydratase  69.39 
 
 
431 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0413646  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4927  phosphopyruvate hydratase  69.39 
 
 
431 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5220  phosphopyruvate hydratase  69.39 
 
 
431 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0996  phosphopyruvate hydratase  69.56 
 
 
429 aa  599  1e-170  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0889818  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3264  phosphopyruvate hydratase  69.56 
 
 
429 aa  599  1e-170  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15790  enolase  71.16 
 
 
428 aa  597  1e-169  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000402486  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2372  phosphopyruvate hydratase  69.56 
 
 
429 aa  597  1e-169  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0900103  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1174  phosphopyruvate hydratase  67.38 
 
 
427 aa  594  1e-168  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.538518 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5238  phosphopyruvate hydratase  69.63 
 
 
431 aa  592  1e-168  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0256572  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2364  phosphopyruvate hydratase  65.96 
 
 
427 aa  591  1e-168  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.593258 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1230  phosphopyruvate hydratase  67.06 
 
 
428 aa  593  1e-168  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000046481  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5284  phosphopyruvate hydratase  69.63 
 
 
431 aa  592  1e-168  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000135484  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4715  phosphopyruvate hydratase  68.63 
 
 
425 aa  592  1e-168  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000215444  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1654  phosphopyruvate hydratase  68.62 
 
 
429 aa  593  1e-168  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000730285  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2019  phosphopyruvate hydratase  69.46 
 
 
431 aa  594  1e-168  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00033595  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1402  enolase  67.29 
 
 
431 aa  594  1e-168  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1909  phosphopyruvate hydratase  66.43 
 
 
427 aa  590  1e-167  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.48075  normal  0.540424 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5249  phosphopyruvate hydratase  69.63 
 
 
431 aa  590  1e-167  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.33817  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5703  phosphopyruvate hydratase  69.39 
 
 
431 aa  589  1e-167  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000699269  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0276  phosphopyruvate hydratase  67.38 
 
 
425 aa  590  1e-167  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000321511  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3446  enolase  66.43 
 
 
427 aa  590  1e-167  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0306  phosphopyruvate hydratase  66.43 
 
 
427 aa  585  1e-166  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0931  phosphopyruvate hydratase  67.22 
 
 
425 aa  587  1e-166  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0406521  normal  0.0209015 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0050  phosphopyruvate hydratase  65.19 
 
 
429 aa  581  1.0000000000000001e-165  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0358  enolase  68.54 
 
 
429 aa  581  1.0000000000000001e-165  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2650  phosphopyruvate hydratase  65.48 
 
 
427 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.828693  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0050  phosphopyruvate hydratase  65.19 
 
 
429 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0004  phosphopyruvate hydratase  64.45 
 
 
422 aa  578  1e-164  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00896876  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1688  enolase  68.01 
 
 
427 aa  580  1e-164  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1322  phosphopyruvate hydratase  65.8 
 
 
428 aa  579  1e-164  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0003  enolase  65.24 
 
 
424 aa  577  1.0000000000000001e-163  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0397743  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0341  phosphopyruvate hydratase  65.58 
 
 
433 aa  576  1.0000000000000001e-163  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00111686  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3739  phosphopyruvate hydratase  65.73 
 
 
431 aa  577  1.0000000000000001e-163  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.535822  normal  0.0352048 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0912  phosphopyruvate hydratase  65.57 
 
 
428 aa  577  1.0000000000000001e-163  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1562  enolase  66.12 
 
 
429 aa  575  1.0000000000000001e-163  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0997  phosphopyruvate hydratase  65.33 
 
 
428 aa  577  1.0000000000000001e-163  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1129  phosphopyruvate hydratase  64.78 
 
 
427 aa  574  1.0000000000000001e-162  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.488598 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2491  phosphopyruvate hydratase  65.79 
 
 
425 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5413  phosphopyruvate hydratase  65.72 
 
 
427 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.456423  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0972  phosphopyruvate hydratase  64.78 
 
 
427 aa  572  1.0000000000000001e-162  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0771581  normal  0.0192441 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1159  phosphopyruvate hydratase  65.79 
 
 
425 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.582835  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2144  phosphopyruvate hydratase  65.96 
 
 
427 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1068  phosphopyruvate hydratase  65.01 
 
 
427 aa  573  1.0000000000000001e-162  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.021025  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2017  phosphopyruvate hydratase  65.96 
 
 
427 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00385308 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2125  phosphopyruvate hydratase  65.48 
 
 
427 aa  570  1e-161  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0881955  normal  0.0226177 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0930  phosphopyruvate hydratase  65.31 
 
 
425 aa  570  1e-161  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5108  phosphopyruvate hydratase  65.57 
 
 
428 aa  569  1e-161  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.967957  normal  0.613587 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0621  phosphopyruvate hydratase  66.43 
 
 
427 aa  568  1e-161  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.584957 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1228  phosphopyruvate hydratase  64.07 
 
 
427 aa  570  1e-161  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1439  phosphopyruvate hydratase  65.25 
 
 
427 aa  568  1e-161  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.679392  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3184  phosphopyruvate hydratase  65.72 
 
 
427 aa  570  1e-161  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147815  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5970  phosphopyruvate hydratase  65.48 
 
 
427 aa  570  1e-161  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1163  phosphopyruvate hydratase  65.25 
 
 
427 aa  568  1e-161  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000432295 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2107  phosphopyruvate hydratase  65.48 
 
 
427 aa  570  1e-161  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1183  phosphopyruvate hydratase  66.27 
 
 
428 aa  570  1e-161  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1466  phosphopyruvate hydratase  65.48 
 
 
427 aa  566  1e-160  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1689  phosphopyruvate hydratase  65.48 
 
 
427 aa  566  1e-160  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0511402  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2631  phosphopyruvate hydratase  65.48 
 
 
427 aa  566  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2711  phosphopyruvate hydratase  65.48 
 
 
427 aa  566  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1260  enolase  67.14 
 
 
426 aa  566  1e-160  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0967  enolase  65.97 
 
 
432 aa  567  1e-160  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1894  phosphopyruvate hydratase  65.25 
 
 
427 aa  566  1e-160  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2193  phosphopyruvate hydratase  65.48 
 
 
427 aa  566  1e-160  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0564709  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1573  phosphopyruvate hydratase  64.78 
 
 
427 aa  565  1e-160  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224968  normal  0.485305 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1055  phosphopyruvate hydratase  64.24 
 
 
429 aa  566  1e-160  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1070  phosphopyruvate hydratase  65.25 
 
 
433 aa  565  1e-160  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4532  phosphopyruvate hydratase  66.19 
 
 
429 aa  567  1e-160  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2145  phosphopyruvate hydratase  66.75 
 
 
424 aa  565  1e-160  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.604241 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2577  phosphopyruvate hydratase  65.48 
 
 
427 aa  566  1e-160  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1305  phosphopyruvate hydratase  66.04 
 
 
432 aa  567  1e-160  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2560  phosphopyruvate hydratase  64.78 
 
 
427 aa  565  1e-160  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.178105  normal  0.251128 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3125  phosphopyruvate hydratase  65.48 
 
 
427 aa  566  1e-160  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.411097  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0446  enolase  65.24 
 
 
427 aa  564  1.0000000000000001e-159  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.261622  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1184  Phosphopyruvate hydratase  66.27 
 
 
426 aa  562  1.0000000000000001e-159  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0146  phosphopyruvate hydratase  65.71 
 
 
428 aa  562  1.0000000000000001e-159  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.152915  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0446  phosphopyruvate hydratase  64.58 
 
 
434 aa  564  1.0000000000000001e-159  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3132  enolase  65.64 
 
 
426 aa  561  1.0000000000000001e-159  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0229642  normal  0.046336 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0947  phosphopyruvate hydratase  63.76 
 
 
428 aa  562  1.0000000000000001e-159  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2847  enolase  64.34 
 
 
433 aa  564  1.0000000000000001e-159  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.392404  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2689  phosphopyruvate hydratase  63.74 
 
 
437 aa  561  1.0000000000000001e-159  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0074  phosphopyruvate hydratase  65.47 
 
 
429 aa  560  1e-158  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00475517  unclonable  0.00000000106415 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>