More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJJ81176_1236 on replicon NC_008787
Organism: Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE1358  DNA-binding response regulator  100 
 
 		 221 aa  446  1e-125  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0519481  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1236  DNA-binding response regulator  100 
 
 		 221 aa  446  1e-125  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000188808  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0504  DNA-binding response regulator  98.19 
 
 		 221 aa  440  1e-123  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000376141  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1103  two-component response regulator  72.27 
 
 		 221 aa  302  2.0000000000000002e-81  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1280  DNA-binding response regulator  57.8 
 
 		 220 aa  263  1e-69  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000547046  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1324  extracellular solute-binding protein  54.59 
 
 		 220 aa  242  3e-63  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.273971  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0128  two-component response regulator  60.18 
 
 		 228 aa  239  2.9999999999999997e-62  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.4797  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0840  transcriptional activator protein CopR  51.6 
 
 		 222 aa  217  1e-55  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.048163  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0136  transcriptional activator protein CopR  51.38 
 
 		 220 aa  212  3.9999999999999995e-54  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0528  transcriptional activator protein CopR  53.92 
 
 		 220 aa  201  6e-51  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0097  response regulator receiver  45.87 
 
 		 222 aa  186  2e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1365  two component transcriptional regulator  48.37 
 
 		 219 aa  178  5.999999999999999e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00130586  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0120  response regulator receiver  42.2 
 
 		 221 aa  168  6e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0257  response regulator receiver  40.93 
 
 		 219 aa  157  1e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1773  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 217 aa  155  5.0000000000000005e-37  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0625  two component transcriptional regulator  41.67 
 
 		 217 aa  154  7e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0258  two component transcriptional regulator  40.28 
 
 		 217 aa  154  1e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0200742  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1917  DNA-binding response regulator  36.28 
 
 		 222 aa  145  3e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0386  two component transcriptional regulator  35.35 
 
 		 222 aa  144  1e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0884  two component transcriptional regulator  37.96 
 
 		 218 aa  144  1e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.68851  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2765  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.87 
 
 		 225 aa  142  5e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.497538  normal  0.0218205 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3352  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.87 
 
 		 225 aa  142  5e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1806  two-component response regulator  37.67 
 
 		 220 aa  140  9.999999999999999e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0521  two component transcriptional regulator  36.36 
 
 		 223 aa  139  3e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.720367  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3383  two component transcriptional regulator  37.39 
 
 		 224 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1341  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.82 
 
 		 226 aa  138  6e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  36.04 
 
 		 224 aa  137  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2957  two component transcriptional regulator  36.49 
 
 		 223 aa  137  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000406961  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2264  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.39 
 
 		 231 aa  136  2e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00910741  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0090  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.84 
 
 		 226 aa  135  3.0000000000000003e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4628  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.63 
 
 		 224 aa  135  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000289587 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0998  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.09 
 
 		 223 aa  135  4e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0203  response regulator receiver  37.17 
 
 		 231 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.359659 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0985  DNA-binding response regulator CiaR  38.18 
 
 		 226 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.447626  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2927  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.63 
 
 		 224 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6397  response regulator receiver protein  35.24 
 
 		 237 aa  133  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.680662  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.59 
 
 		 224 aa  132  3e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000226454  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0693  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.78 
 
 		 229 aa  132  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1404  two component transcriptional regulator  32.43 
 
 		 229 aa  132  3.9999999999999996e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.153238  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18630  Response regulator, two-component  35.35 
 
 		 219 aa  132  3.9999999999999996e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1330  response regulator receiver  31.05 
 
 		 219 aa  132  6e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0272  response regulator receiver  39.63 
 
 		 223 aa  131  6e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1579  response regulator receiver  35.35 
 
 		 225 aa  131  6.999999999999999e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.410227  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04130  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  33.78 
 
 		 236 aa  131  9e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.118973  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0227  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.59 
 
 		 224 aa  131  9e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1969  response regulator receiver domain-containing protein  32.72 
 
 		 219 aa  130  1.0000000000000001e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.478098  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0210  DNA-binding response regulator  34.4 
 
 		 225 aa  130  1.0000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5018  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.14 
 
 		 226 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4258  response regulator receiver  31.34 
 
 		 220 aa  130  1.0000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0567705  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3039  two component transcriptional regulator  36.28 
 
 		 220 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4347  two component transcriptional regulator  34.36 
 
 		 236 aa  129  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0535  two component transcriptional regulator  35 
 
 		 223 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.660155  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3354  two component transcriptional regulator  34.26 
 
 		 220 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.44436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4293  two component transcriptional regulator  35.59 
 
 		 224 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000934276  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1480  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.02 
 
 		 219 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000681553  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1333  response regulator receiver protein  33.94 
 
 		 222 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.40527  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2440  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 222 aa  129  3e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0936231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0660  two component transcriptional regulator  33.94 
 
 		 224 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000259813  hitchhiker  0.0000270487 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1213  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.26 
 
 		 223 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0707  winged helix family two component transcriptional regulator  33.94 
 
 		 222 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2122  DNA-binding response regulator  34.09 
 
 		 223 aa  128  5.0000000000000004e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4261  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.16 
 
 		 224 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.906422  normal  0.0109867 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2713  DNA-binding response regulator  36.28 
 
 		 220 aa  128  6e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.20215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2941  multi-component transcriptional regulator, winged helix family  36.14 
 
 		 652 aa  128  6e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  32.73 
 
 		 240 aa  128  6e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1155  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.88 
 
 		 230 aa  128  7.000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.560017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3221  DNA-binding response regulator  32.73 
 
 		 224 aa  128  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2296  two component transcriptional regulator  34.09 
 
 		 255 aa  128  8.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.398969  normal  0.240289 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3846  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.39 
 
 		 222 aa  128  8.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2033  DNA-binding response regulator  32.73 
 
 		 224 aa  128  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.725953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1887  two component transcriptional regulator  33.63 
 
 		 231 aa  128  8.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.882564  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0558  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.68 
 
 		 237 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4222  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.16 
 
 		 224 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3593  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.3 
 
 		 226 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000142937  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3019  two component transcriptional regulator  35.81 
 
 		 220 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.933394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0737  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.28 
 
 		 224 aa  127  1.0000000000000001e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2915  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.18 
 
 		 225 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.892207  normal  0.300351 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.62 
 
 		 225 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0583  two component transcriptional regulator  33.49 
 
 		 224 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0841609  normal  0.467543 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3235  DNA-binding response regulator  32.27 
 
 		 224 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2389  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 		 240 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0687652  decreased coverage  0.0000973314 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0310  DNA-binding transcriptional regulator BasR  32.56 
 
 		 232 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0214332  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3617  DNA-binding transcriptional regulator BasR  33.02 
 
 		 220 aa  127  2.0000000000000002e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000270917  normal  0.430126 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0699  two component transcriptional regulator  32.87 
 
 		 220 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3286  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.78 
 
 		 228 aa  127  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167791  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3836  DNA-binding transcriptional regulator BasR  33.49 
 
 		 222 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0016  two component transcriptional regulator  32.27 
 
 		 262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3651  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.09 
 
 		 228 aa  126  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0435949 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0575  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.09 
 
 		 224 aa  126  3e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.21251 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0343  response regulator receiver  34.07 
 
 		 232 aa  126  3e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.86362  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1566  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.18 
 
 		 228 aa  126  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435599 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3267  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.94 
 
 		 220 aa  126  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3820  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 221 aa  126  3e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4793  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.64 
 
 		 219 aa  126  3e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.732153 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1913  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.73 
 
 		 221 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0526  two component transcriptional regulator  33.94 
 
 		 229 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0788787  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0465  two component transcriptional regulator  33.49 
 
 		 229 aa  125  4.0000000000000003e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0776  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 		 224 aa  125  4.0000000000000003e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0107208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3875  two component transcriptional regulator  33.94 
 
 		 224 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000754116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2549  response regulator receiver  33.94 
 
 		 222 aa  125  5e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>