40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0670 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE0670  GTP-binding protein  100 
 
 
355 aa  714    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.417298  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0264  GTP-binding protein  30.5 
 
 
383 aa  145  7.0000000000000006e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1715  hypothetical protein  32.33 
 
 
192 aa  63.2  0.000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.691695  normal  0.639266 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4488  hypothetical protein  21.37 
 
 
424 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0267  GTPase domain-containing protein  34.27 
 
 
221 aa  60.5  0.00000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.137333  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0107  small GTP-binding protein domain-containing protein  23.48 
 
 
472 aa  57  0.0000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.130324  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4307  GTP-binding protein HSR1-related  36.05 
 
 
650 aa  56.6  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1077  Miro domain protein  25.13 
 
 
444 aa  56.2  0.0000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3187  hypothetical protein  28.81 
 
 
432 aa  53.1  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0947704 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2372  hypothetical protein  27.34 
 
 
444 aa  50.1  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2203  GTP-binding protein EngA  24.43 
 
 
456 aa  48.9  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.364827 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14190  uncharacterized protein associated with GTPases  31.16 
 
 
401 aa  47.8  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2524  GTP-binding protein Era  26.99 
 
 
321 aa  47.8  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00258575  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0877  GTPase domain-containing protein  35.59 
 
 
215 aa  47.8  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000876255  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2089  small GTP-binding protein domain-containing protein  37.66 
 
 
637 aa  47.8  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000643797  unclonable  0.000000212393 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4767  GTP-binding protein HSR1-related  35.29 
 
 
629 aa  47  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.049365  hitchhiker  0.000697216 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2380  GTP-binding protein, HSR1-related  30.15 
 
 
635 aa  47  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1262  hypothetical protein  31.25 
 
 
378 aa  46.6  0.0007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0244924  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2482  hypothetical protein  19.54 
 
 
409 aa  45.8  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0321451  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0656  GTP-binding protein HSR1-related protein  38.96 
 
 
512 aa  44.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.53051  normal  0.190619 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01394  Putative uncharacterized proteinSeptin ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9C1M1]  27.53 
 
 
342 aa  45.1  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0384  small GTP-binding protein  30.4 
 
 
184 aa  45.1  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.733016  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0504  GTP-binding protein EngA  29.63 
 
 
441 aa  44.3  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2560  AAA ATPase  23.84 
 
 
687 aa  44.7  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3126  GTP-binding protein EngA  26.87 
 
 
454 aa  44.7  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1054  ribosomal biogenesis GTPase  38.18 
 
 
315 aa  44.3  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03535  GTP-binding protein Era  29.58 
 
 
320 aa  44.3  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1268  GTP-binding protein Era  24.41 
 
 
287 aa  43.9  0.004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1736  putative ABC transporter  45.65 
 
 
556 aa  43.9  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1727  GTP-binding protein EngA  26.72 
 
 
448 aa  43.9  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06120  hypothetical protein  28.3 
 
 
471 aa  43.5  0.005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000493325 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1403  hypothetical protein  36.99 
 
 
328 aa  43.9  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2038  GTP-binding protein Era  30.23 
 
 
324 aa  43.5  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.655908  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3148  GTP-binding protein Era  26.55 
 
 
300 aa  43.5  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0159525  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0192  GTP-binding protein EngA  27.7 
 
 
445 aa  43.1  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0880  GTPase domain-containing protein  28.26 
 
 
284 aa  43.1  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1153  hypothetical protein  39.06 
 
 
614 aa  43.1  0.007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.9167  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1291  GTP-binding protein EngA  25.32 
 
 
436 aa  42.7  0.008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0244351  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2314  GTP-binding protein EngA  25.95 
 
 
439 aa  43.1  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4247  GTP-binding protein EngA  27.85 
 
 
498 aa  42.7  0.009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>