More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0082 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_2009  aspartate ammonia-lyase  67.6 
 
 
476 aa  654  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0094  aspartate ammonia-lyase  99.15 
 
 
468 aa  961  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0122  aspartate ammonia-lyase  99.57 
 
 
468 aa  964  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2008  aspartate ammonia-lyase  68.16 
 
 
468 aa  656  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1643  aspartate ammonia-lyase  79.53 
 
 
474 aa  780  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0082  aspartate ammonia-lyase  100 
 
 
468 aa  967  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0140  aspartate ammonia-lyase  64.74 
 
 
470 aa  623  1e-177  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2124  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  64.44 
 
 
471 aa  619  1e-176  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  5.1294e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0391  thiamine biosynthesis protein ThiC  62.5 
 
 
466 aa  620  1e-176  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2083  aspartate ammonia-lyase  61.82 
 
 
475 aa  615  1e-175  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.195347  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2177  aspartate ammonia-lyase  61.82 
 
 
475 aa  615  1e-175  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1555  aspartate ammonia-lyase (Aspartase)  64.01 
 
 
469 aa  615  1e-175  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1757  aspartate ammonia-lyase  62.69 
 
 
482 aa  601  1e-171  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2438  aspartate ammonia-lyase  62.17 
 
 
466 aa  599  1e-170  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.268607  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3403  aspartate ammonia-lyase  60.52 
 
 
469 aa  583  1e-165  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00437169  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5639  aspartate ammonia-lyase  60.09 
 
 
479 aa  581  1e-165  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.611375  normal  0.502562 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1791  aspartate ammonia-lyase  62.75 
 
 
475 aa  578  1e-164  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0481  aspartate ammonia-lyase  61.61 
 
 
474 aa  578  1e-164  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24080  aspartate ammonia-lyase  58.35 
 
 
505 aa  571  1e-162  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.252738  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0193  aspartate ammonia-lyase  60.39 
 
 
463 aa  571  1e-161  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00154  aspartate ammonia-lyase  58.33 
 
 
483 aa  570  1e-161  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1299  fumarate lyase  62.5 
 
 
479 aa  566  1e-160  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.160462  normal  0.429544 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2072  aspartate ammonia-lyase  60.52 
 
 
471 aa  565  1e-160  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1178  aspartate ammonia-lyase  56.75 
 
 
485 aa  565  1e-160  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  decreased coverage  1.50136e-06 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6431  aspartate ammonia-lyase  60.74 
 
 
471 aa  566  1e-160  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002214  aspartate ammonia-lyase  58.12 
 
 
483 aa  563  1e-159  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1091  aspartate ammonia-lyase  57.82 
 
 
485 aa  562  1e-159  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.548259  normal  0.0187146 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0939  aspartate ammonia-lyase  61.47 
 
 
468 aa  558  1e-158  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2270  aspartate ammonia-lyase  56.62 
 
 
483 aa  560  1e-158  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.935521  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2167  aspartate ammonia-lyase  57.05 
 
 
480 aa  557  1e-157  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3455  aspartate ammonia-lyase  59.7 
 
 
470 aa  556  1e-157  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.025134  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5752  aspartate ammonia-lyase  61 
 
 
475 aa  554  1e-156  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.555308  normal  0.129771 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5655  aspartate ammonia-lyase  58.15 
 
 
478 aa  554  1e-156  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0582808  normal  0.320226 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3873  aspartate ammonia-lyase  58.15 
 
 
478 aa  554  1e-156  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3825  aspartate ammonia-lyase  55.79 
 
 
478 aa  552  1e-156  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5387  aspartate ammonia-lyase  57.85 
 
 
485 aa  551  1e-156  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0626704 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3853  aspartate ammonia-lyase  58.15 
 
 
478 aa  554  1e-156  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03971  hypothetical protein  58.15 
 
 
478 aa  554  1e-156  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4694  aspartate ammonia-lyase  58.15 
 
 
478 aa  553  1e-156  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1152  fumarate lyase  57.17 
 
 
481 aa  552  1e-156  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.265028  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04009  aspartate ammonia-lyase  58.15 
 
 
478 aa  554  1e-156  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3678  aspartate ammonia-lyase  55.79 
 
 
478 aa  552  1e-156  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5499  aspartate ammonia-lyase  57.87 
 
 
474 aa  553  1e-156  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4668  aspartate ammonia-lyase  58.15 
 
 
478 aa  554  1e-156  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4608  aspartate ammonia-lyase  58.15 
 
 
478 aa  554  1e-156  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.21143  normal  0.755736 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4380  aspartate ammonia-lyase  58.15 
 
 
478 aa  554  1e-156  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.211815  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0589  aspartate ammonia-lyase  55.79 
 
 
467 aa  551  1e-156  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.774005 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0128  aspartate ammonia-lyase  57.79 
 
 
474 aa  551  1e-155  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.266622  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1746  fumarate lyase  57.85 
 
 
469 aa  548  1e-155  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0725  aspartate ammonia-lyase  55.58 
 
 
478 aa  550  1e-155  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4604  aspartate ammonia-lyase  57.3 
 
 
478 aa  549  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0135  aspartate ammonia-lyase  57.63 
 
 
485 aa  550  1e-155  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4687  aspartate ammonia-lyase  57.3 
 
 
478 aa  549  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4722  aspartate ammonia-lyase  57.3 
 
 
478 aa  549  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5247  aspartate ammonia-lyase  57.42 
 
 
478 aa  549  1e-155  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0371805  normal  0.169068 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0406  aspartate ammonia-lyase  56.01 
 
 
478 aa  549  1e-155  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00087202 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4596  aspartate ammonia-lyase  57.3 
 
 
478 aa  549  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2806  aspartate ammonia-lyase  56.62 
 
 
482 aa  550  1e-155  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4744  aspartate ammonia-lyase  57.3 
 
 
478 aa  549  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.825089  normal  0.538431 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5338  aspartate ammonia-lyase  57.63 
 
 
478 aa  551  1e-155  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000486768 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5051  aspartate ammonia-lyase  57.66 
 
 
474 aa  551  1e-155  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.267473 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5625  aspartate ammonia-lyase  57.14 
 
 
478 aa  547  1e-154  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.149238  normal  0.246318 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6217  aspartate ammonia-lyase  57.88 
 
 
474 aa  548  1e-154  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.946627  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4064  aspartate ammonia-lyase  58.23 
 
 
468 aa  545  1e-154  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1545  aspartate ammonia-lyase  55.67 
 
 
470 aa  547  1e-154  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  1.1141e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71650  aspartate ammonia-lyase  57.67 
 
 
474 aa  546  1e-154  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3758  fumarate lyase  59.61 
 
 
471 aa  545  1e-154  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4302  aspartate ammonia-lyase  58.23 
 
 
468 aa  545  1e-154  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0827  fumarate lyase  59.48 
 
 
483 aa  546  1e-154  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1417  aspartate ammonia-lyase  54.64 
 
 
470 aa  547  1e-154  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.442168 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3846  aspartate ammonia-lyase  55.58 
 
 
467 aa  547  1e-154  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1293  aspartate ammonia-lyase  58.32 
 
 
468 aa  542  1e-153  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0277144  normal  0.160043 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1905  fumarate lyase  55.63 
 
 
475 aa  541  1e-153  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.486033 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0565  aspartate ammonia-lyase  55.94 
 
 
521 aa  542  1e-153  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0355315 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3457  aspartate ammonia-lyase  59.74 
 
 
468 aa  541  1e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.73518 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3458  aspartate ammonia-lyase  58.01 
 
 
468 aa  542  1e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.882524  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0593  aspartate ammonia-lyase  55.79 
 
 
472 aa  542  1e-153  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2052  aspartate ammonia-lyase  56.71 
 
 
485 aa  538  1e-152  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0909745  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0326  aspartate ammonia-lyase  57.08 
 
 
478 aa  538  1e-152  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  4.42883e-05 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1993  aspartate ammonia-lyase  55.65 
 
 
463 aa  535  1e-151  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0466  aspartate ammonia-lyase  56.96 
 
 
471 aa  538  1e-151  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  1.07475e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0682  aspartate ammonia-lyase  54.82 
 
 
480 aa  535  1e-151  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3976  fumarate lyase  58.95 
 
 
471 aa  535  1e-151  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3544  fumarate lyase  59.26 
 
 
471 aa  537  1e-151  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0645  aspartate ammonia-lyase  54.94 
 
 
479 aa  532  1e-150  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0480  aspartate ammonia-lyase  56.22 
 
 
479 aa  532  1e-150  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0640  aspartate ammonia-lyase  54.94 
 
 
479 aa  532  1e-150  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0398  aspartate ammonia-lyase  56.65 
 
 
479 aa  534  1e-150  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0506  aspartate ammonia-lyase  56.44 
 
 
479 aa  531  1e-150  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.560083  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0725  aspartate ammonia-lyase  56.87 
 
 
479 aa  532  1e-150  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.883409  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0618  aspartate ammonia-lyase  54.94 
 
 
479 aa  532  1e-150  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3747  aspartate ammonia-lyase  54.72 
 
 
479 aa  528  1e-149  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3964  aspartate ammonia-lyase  59.52 
 
 
468 aa  529  1e-149  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.256806 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3530  fumarate lyase  56.55 
 
 
540 aa  530  1e-149  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.448364 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1984  aspartate ammonia-lyase  58.32 
 
 
468 aa  531  1e-149  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1741  aspartate ammonia-lyase  55.43 
 
 
475 aa  525  1e-148  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3532  aspartate ammonia-lyase  56.22 
 
 
479 aa  525  1e-148  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.563164  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0356  fumarate lyase  55.91 
 
 
481 aa  518  1e-146  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2652  aspartate ammonia-lyase  55.63 
 
 
467 aa  520  1e-146  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.531608  normal  0.0454862 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3407  aspartate ammonia-lyase  55.15 
 
 
479 aa  519  1e-146  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>