More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3003 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_3003  b-glycosyltransferase  100 
 
 
240 aa  494  1e-139  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00616181  normal  0.0256653 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3959  glycosyl transferase family 2  67.24 
 
 
236 aa  354  7.999999999999999e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.568122  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7281  glycosyl transferase family 2  66.11 
 
 
249 aa  333  1e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.764542  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12873  glycosyltransferase  65.25 
 
 
238 aa  332  3e-90  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.514986  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1765  glycosyl transferase family protein  58.12 
 
 
229 aa  284  7e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1428  glycosyl transferase family protein  53.31 
 
 
244 aa  278  6e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1655  glycosyl transferase family 2  56.84 
 
 
227 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1110  glycosyl transferase family 2  58.55 
 
 
227 aa  268  5e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0704361  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3771  glycosyl transferase family protein  58.12 
 
 
238 aa  256  2e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1622  glycosyl transferase family 2  52.52 
 
 
280 aa  251  7e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.429819  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0534  glycosyl transferase family protein  55.56 
 
 
238 aa  250  2e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0128  glycosyl transferase family protein  52.38 
 
 
393 aa  249  3e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.388343  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0589  glycosyl transferase family protein  50.86 
 
 
226 aa  234  9e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3730  glycosyl transferase family protein  44.02 
 
 
227 aa  205  4e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00146021 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3242  glycosyl transferase family protein  44.64 
 
 
227 aa  205  5e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.412321 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1961  glycosyl transferase family 2  45.26 
 
 
230 aa  204  8e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00401817  hitchhiker  0.00275199 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1976  glycosyl transferase family 2  45.69 
 
 
230 aa  202  5e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.364573  normal  0.0138769 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4444  glycosyl transferase family protein  39.15 
 
 
519 aa  201  9e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1038  glycosyl transferase family protein  42.26 
 
 
685 aa  194  1e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.152383  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4593  glycosyl transferase family protein  42.49 
 
 
230 aa  192  3e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4293  glycosyl transferase family protein  37.21 
 
 
531 aa  191  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4432  glycosyl transferase family 2  37.21 
 
 
527 aa  190  2e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0009  glycosyl transferase family 2  39.18 
 
 
271 aa  186  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0011  glycosyl transferase family 2  39.18 
 
 
271 aa  186  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4453  glycosyl transferase family 2  36.82 
 
 
527 aa  186  3e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2870  glycosyl transferase family 2  41.88 
 
 
227 aa  179  4e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000193907  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1627  glycosyl transferase family protein  45.76 
 
 
234 aa  177  1e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0667673  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4853  glycosyl transferase family 2  40.09 
 
 
227 aa  166  4e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3686  glycosyl transferase family 2  37.77 
 
 
234 aa  162  3e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.204283  hitchhiker  0.00350774 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4987  glycosyl transferase family protein  38.43 
 
 
235 aa  161  9e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.278061  hitchhiker  0.000170854 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4474  glycosyl transferase family protein  38.43 
 
 
235 aa  161  1e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0455914 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3976  glycosyl transferase family protein  34.44 
 
 
514 aa  122  4e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1077  glycosyl transferase family protein  29.82 
 
 
298 aa  101  9e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.273313  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2117  glycosyl transferase family protein  32.03 
 
 
304 aa  95.5  7e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322002  normal  0.308153 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0818  glycosyl transferase family 2  30.84 
 
 
411 aa  94.7  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2133  glycosyl transferase family 2  30.64 
 
 
340 aa  94.4  1e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0441778  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17261  glycosyl transferase family protein  31.22 
 
 
320 aa  94.4  1e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.503177  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1793  glycosyl transferase family 2  31.25 
 
 
313 aa  92.4  6e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237379  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4222  glycosyl transferase family protein  29.63 
 
 
420 aa  92.4  6e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3067  glycosyl transferase family protein  32.21 
 
 
394 aa  91.7  9e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.936306  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0151  histidinol-phosphate phosphatase family protein  28.33 
 
 
410 aa  91.3  1e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3095  glycosyl transferase family 2  28.87 
 
 
341 aa  90.9  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17141  glycosyl transferase family protein  31.22 
 
 
320 aa  91.3  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.517229  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2933  glycosyl transferase family 2  31.78 
 
 
355 aa  90.1  3e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.175593 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3118  glycosyl transferase family protein  32.39 
 
 
235 aa  90.1  3e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000616031  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0451  glycosyl transferase family protein  29.87 
 
 
414 aa  90.1  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.252184  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4198  glycosyl transferase family protein  25.83 
 
 
358 aa  89.7  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.797946  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1061  glycosyl transferase family 2  30 
 
 
448 aa  88.2  1e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1989  glycosyl transferase family protein  28.75 
 
 
320 aa  87.4  2e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.151695  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0506  glycosyl transferase  27.87 
 
 
332 aa  87  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.641026  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1385  glycosyl transferase family 2  30.52 
 
 
319 aa  87.4  2e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1106  glycosyl transferase family 2  25.64 
 
 
338 aa  87.4  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.263485  normal  0.233647 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1182  glycosyl transferase family protein  31.87 
 
 
228 aa  87.4  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0187488  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3586  glycosyl transferase family 2  27.04 
 
 
272 aa  87  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19621  glycosyl transferase family protein  29.39 
 
 
320 aa  87.8  2e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.217021  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1087  glycosyltransferase  28.38 
 
 
320 aa  86.3  4e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1041  glycosyl transferase family 2  28.99 
 
 
368 aa  85.9  5e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3268  glycosyl transferase family protein  34.94 
 
 
301 aa  85.9  5e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.230129  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0955  glycosyl transferase family 2  25.21 
 
 
338 aa  85.9  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.254585  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0605  glycosyl transferase  31.02 
 
 
310 aa  85.5  6e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1971  glycosyl transferase family protein  28.11 
 
 
347 aa  85.9  6e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0162  glycosyl transferase family 2  30.85 
 
 
314 aa  85.5  8e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00320055 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0418  glycosyl transferase family protein  29.82 
 
 
230 aa  85.1  9e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0496978  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0429  glycosyl transferase  29.39 
 
 
328 aa  84.3  0.000000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.541189  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0464  glycosyl transferase  29.65 
 
 
310 aa  84.7  0.000000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1614  glycosyl transferase family protein  29.79 
 
 
324 aa  84.7  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1551  glycosyl transferase family 2  32.59 
 
 
324 aa  85.1  0.000000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000748201  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0635  glycosyl transferase family 2  30.05 
 
 
310 aa  83.6  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0825  glycosyl transferase family 2  29.47 
 
 
351 aa  83.6  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0531655  normal  0.237079 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1340  glycosyl transferase family protein  30.84 
 
 
318 aa  83.6  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.275627  normal  0.171595 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0217  glycosyl transferase family protein  29.69 
 
 
283 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.860122  normal  0.275888 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17011  glycosyl transferase family protein  29.31 
 
 
320 aa  84.3  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.553457  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0202  histidinol-phosphate phosphatase family protein/glycosyl transferase, group 2 family protein  27.39 
 
 
410 aa  83.2  0.000000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.631531  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12000  glycosyl transferase  28.44 
 
 
243 aa  83.2  0.000000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.2509  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5302  glycosyl transferase family protein  31.6 
 
 
380 aa  83.2  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.157801  normal  0.641383 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0505  glycosyl transferase family protein  29.69 
 
 
262 aa  82.8  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0214  glycosyl transferase family protein  31.43 
 
 
378 aa  82.8  0.000000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.840225  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1913  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.33 
 
 
382 aa  82.4  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1271  glycosyltransferase  28.21 
 
 
237 aa  82.4  0.000000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1164  glycosyl transferase family protein  29.58 
 
 
320 aa  82.8  0.000000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.164128  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1230  glycosyl transferase family 2  28.39 
 
 
340 aa  82.8  0.000000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3690  glycosyl transferase family 2  28.95 
 
 
234 aa  82.4  0.000000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.349905  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8623  dolichol-p-glucose synthetase  28.81 
 
 
406 aa  82  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2693  glycosyl transferase family protein  31.1 
 
 
273 aa  82  0.000000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.756814  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1671  glycosyl transferase family 2  29.65 
 
 
310 aa  81.6  0.000000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000135664  normal  0.123031 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1442  glycosyl transferase family protein  26.67 
 
 
312 aa  81.6  0.000000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_190  histidinol-phosphate phosphatase protein/glycosyl transferase  26.52 
 
 
410 aa  81.3  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00438992  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3172  family 2 glycosyl transferase  28.09 
 
 
412 aa  81.6  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0111  glycosyl transferase family protein  31.4 
 
 
318 aa  80.9  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.375009  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33890  glycosyl transferase  26.58 
 
 
749 aa  80.5  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.47583  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0656  glycosyl transferase family protein  25.32 
 
 
329 aa  80.5  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3635  glycosyl transferase family 2  26.76 
 
 
312 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.338719  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1238  glycosyl transferase family protein  28.38 
 
 
340 aa  80.9  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0299197  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0417  glycosyl transferase family protein  28.45 
 
 
230 aa  80.5  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.304436  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3213  glycosyl transferase family 2  24.17 
 
 
256 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.595641 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0976  glycosyl transferase family 2  27.47 
 
 
430 aa  80.5  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1658  glycosyl transferase family 2  27.75 
 
 
278 aa  80.9  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0430  glycosyl transferase family 2  27.98 
 
 
301 aa  80.5  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0734  glycosyl transferase family protein  30.21 
 
 
230 aa  80.1  0.00000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0939265  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0165  glycosyl transferase family protein  28.5 
 
 
321 aa  80.1  0.00000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000128177 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>