142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0098 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0098  hydrogenase maturation protease HydD  100 
 
 
180 aa  366  1e-100  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0404839  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1900  hydrogenase maturation protease superfamily  68.89 
 
 
179 aa  253  8e-67  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0937  hydrogenase maturation protease HydD  60.45 
 
 
179 aa  229  2e-59  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.353395  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1400  hydrogenase maturation protease HydD  60.47 
 
 
178 aa  217  6e-56  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1280  hydrogenase maturation protease HydD  59.88 
 
 
178 aa  214  8e-55  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00834079  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0864  hydrogenase maturation protease HydD  53.59 
 
 
181 aa  211  4e-54  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0462  hydrogenase maturation protease HydD  58.14 
 
 
178 aa  207  6e-53  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  3.46095e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1103  hydrogenase maturation protease  54.07 
 
 
179 aa  206  2e-52  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2091  hydrogenase expression/formation protein  51.96 
 
 
187 aa  203  1e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.910871  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2096  hydrogenase expression/formation protein  50.28 
 
 
192 aa  202  1e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1819  hydrogenase expression/formation protein  50.28 
 
 
192 aa  202  2e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2158  hydrogenase expression/formation protein  50.28 
 
 
192 aa  202  2e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.6852  normal  0.309785 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1877  hydrogenase expression/formation protein  50.28 
 
 
192 aa  202  2e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2030  hydrogenase expression/formation protein  49.72 
 
 
185 aa  201  6e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0715  Ni/Fe hydrogenase, expression/formation protein  52.66 
 
 
177 aa  200  9e-51  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.930335  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1905  hydrogenase expression/formation protein  51.4 
 
 
185 aa  199  2e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0136333 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1762  hydrogenase expression/formation protein  48.6 
 
 
187 aa  194  8e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1676  hydrogenase expression/formation protein  50.29 
 
 
185 aa  194  8e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.903036 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2407  hydrogenase expression/formation protein  51.4 
 
 
185 aa  190  9e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.132093  hitchhiker  0.000269982 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1912  hydrogenase expression/formation protein  50.84 
 
 
185 aa  188  4e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.816191  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1919  hydrogenase expression/formation protein  50.84 
 
 
185 aa  188  4e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1886  hydrogenase expression/formation protein  50.84 
 
 
185 aa  187  5e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2106  hydrogenase maturation protease  45.76 
 
 
184 aa  178  3e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1433  peptidase M52, hydrogenase expression/formation protein  44.44 
 
 
181 aa  178  5e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.50886  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2036  peptidase M52, hydrogen uptake protein  33.55 
 
 
190 aa  103  1e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2951  hydrogenase expression/formation protein  37.14 
 
 
170 aa  99.8  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.585714 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0765  hydrogenase expression/formation protein  32.91 
 
 
161 aa  97.4  9e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0267  hydrogenase expression/formation protein  33.13 
 
 
165 aa  95.5  4e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.312911  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2139  hydrogenase expression/formation protein  34.42 
 
 
165 aa  89.4  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1037  hydrogenase expression/formation protein  33.33 
 
 
161 aa  86.3  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0456714  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2740  hydrogenase maturation protease  31.55 
 
 
164 aa  86.7  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.12894e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1244  hydrogenase expression/formation protein  32.89 
 
 
165 aa  86.7  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.791163  normal  0.298279 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0269  hydrogenase expression/formation protein  36.36 
 
 
168 aa  85.5  4e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0820491 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0786  hydrogenase maturation protease  35.61 
 
 
160 aa  80.9  9e-15  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.177407  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2530  hydrogenase expression/formation protein  33.33 
 
 
169 aa  77  1e-13  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.780336  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1947  hydrogenase maturation protease  34.85 
 
 
166 aa  76.6  2e-13  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0162  hydrogenase expression/formation protein  35.51 
 
 
201 aa  75.9  3e-13  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.793155  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1414  hydrogenase expression/formation protein  31.43 
 
 
166 aa  75.1  5e-13  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0272  hydrogenase maturation protease  31.65 
 
 
159 aa  75.1  5e-13  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.268401 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2136  peptidase M52, hydrogen uptake protein  32.84 
 
 
156 aa  73.9  1e-12  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3970  HybD peptidase  31.33 
 
 
159 aa  73.6  1e-12  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0051  hydrogenase maturation protease  31.76 
 
 
166 aa  73.2  2e-12  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0212564  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3986  HyaD peptidase  34.72 
 
 
204 aa  72.4  3e-12  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0148  hydrogenase maturation protease  33.33 
 
 
161 aa  72.4  3e-12  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1153  hydrogenase expression/formation protein  30.49 
 
 
218 aa  71.2  7e-12  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.838065  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2322  hydrogenase expression/formation protein  29.41 
 
 
166 aa  70.9  8e-12  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.659738  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3145  hydrogenase expression/formation protein  32.12 
 
 
159 aa  70.1  1e-11  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00208925  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0542  hydrogenase expression/formation protein  30 
 
 
169 aa  70.9  1e-11  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.995345  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1293  HyaD peptidase  33.1 
 
 
221 aa  70.5  1e-11  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000175592  normal  0.533116 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50560  hydrogenase expression/formation protein, HoxM  31.82 
 
 
207 aa  68.9  4e-11  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00480221  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1127  hydrogenase maturation protease  28.22 
 
 
159 aa  68.2  6e-11  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2879  hydrogenase maturation protease  31.01 
 
 
158 aa  67  1e-10  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.980378 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3135  hydrogenase maturation protease  31.62 
 
 
159 aa  67.4  1e-10  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4305  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  27.91 
 
 
164 aa  67.4  1e-10  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.227122  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3462  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  27.91 
 
 
164 aa  67.4  1e-10  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3281  hydrogenase maturation protease  31.01 
 
 
158 aa  67  1e-10  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3393  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  27.91 
 
 
164 aa  66.6  2e-10  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.441153 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3328  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  27.91 
 
 
164 aa  66.6  2e-10  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.581349  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3399  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  27.91 
 
 
164 aa  66.6  2e-10  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1271  peptidase M52, hydrogen uptake protein  33.83 
 
 
167 aa  66.6  2e-10  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.813931  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3319  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  27.91 
 
 
164 aa  66.6  2e-10  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00237916  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3494  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  27.91 
 
 
164 aa  66.6  2e-10  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.627392  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02818  hypothetical protein  27.91 
 
 
164 aa  66.2  3e-10  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02869  predicted maturation element for hydrogenase 2  27.91 
 
 
164 aa  66.2  3e-10  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3173  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  27.91 
 
 
164 aa  65.9  3e-10  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3420  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  27.91 
 
 
164 aa  66.2  3e-10  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1165  hydrogenase expression/formation protein  34.29 
 
 
203 aa  65.9  3e-10  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.464172  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2176  hydrogenase expression/formation protein  29.68 
 
 
208 aa  65.9  3e-10  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0123485  normal  0.201269 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3279  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  27.91 
 
 
164 aa  65.9  3e-10  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0700  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  27.91 
 
 
164 aa  65.9  3e-10  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0703  hydrogenase expression/formation protein  27.91 
 
 
164 aa  65.9  3e-10  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3101  hydrogenase expression/formation protein  30.86 
 
 
222 aa  65.5  4e-10  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1999  hydrogenase maturation  33.33 
 
 
195 aa  64.7  7e-10  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.116789  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0173  hydrogenase maturation protease  35.16 
 
 
170 aa  64.3  8e-10  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2026  HyaD peptidase  29.44 
 
 
208 aa  64.3  1e-09  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.462165  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1247  hydrogenase maturation protease  30.6 
 
 
156 aa  63.9  1e-09  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.188771 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0499  HyaD peptidase  35.2 
 
 
206 aa  63.9  1e-09  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2150  hydrogenase expression/formation protein  35.2 
 
 
206 aa  64.3  1e-09  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.133093  normal  0.20367 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3372  hypothetical protein  32.61 
 
 
206 aa  63.2  2e-09  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.288217  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1157  hydrogenase expression/formation protein  31.88 
 
 
195 aa  63.2  2e-09  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.486513  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0335  hydrogenase expression/formation protein  32.91 
 
 
191 aa  62.8  2e-09  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00352637  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1233  hydrogenase maturation protease  29.03 
 
 
172 aa  62.8  2e-09  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.120838  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4092  peptidase M52, hydrogen uptake protein  32.81 
 
 
174 aa  62.8  2e-09  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0783921  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3769  hydrogenase expression/formation protein  33.81 
 
 
209 aa  62.8  3e-09  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.645157  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1971  hydrogenase expression/formation protein  30.66 
 
 
223 aa  61.6  5e-09  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.814536  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1380  peptidase M52, hydrogen uptake protein  32.09 
 
 
156 aa  61.6  6e-09  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0298181  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2822  Ni-Fe hydrogenase maturation factor-like protein  31.43 
 
 
224 aa  61.6  6e-09  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1345  hydrogenase 1 maturation protease  27.01 
 
 
198 aa  60.5  1e-08  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0380  hydrogenase maturation protease  26.71 
 
 
176 aa  60.5  1e-08  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1968  hydrogenase maturation protease  29.27 
 
 
155 aa  60.1  1e-08  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3329  peptidase M52, hydrogenase maturation peptidase  30.47 
 
 
172 aa  60.5  1e-08  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1529  hydrogenase 1 maturation protease  27.01 
 
 
198 aa  59.7  2e-08  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.468604  normal  0.329104 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0522  hydrogenase maturation protease  30.07 
 
 
177 aa  60.1  2e-08  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1635  hydrogenase expression/formation protein  28.47 
 
 
202 aa  58.9  4e-08  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3406  hydrogenase maturation protease  30.83 
 
 
191 aa  58.9  4e-08  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1640  hydrogenase expression/formation protein  28.47 
 
 
202 aa  58.9  4e-08  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1800  hydrogenase expression/formation protein  28.47 
 
 
202 aa  58.9  4e-08  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.16559  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1987  hydrogenase 1 maturation protease  27.01 
 
 
198 aa  58.5  4e-08  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1707  hydrogenase expression/formation protein  28.47 
 
 
202 aa  58.9  4e-08  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.460815  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1648  hydrogenase expression/formation protein  28.47 
 
 
202 aa  58.9  4e-08  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>