264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1926 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1926  dihydrofolate reductase  100 
 
 		 171 aa  346  8e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000147298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1653  Dihydrofolate reductase  47.4 
 
 		 165 aa  140  9e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3084  dihydrofolate reductase  43.59 
 
 		 160 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2312  dihydrofolate reductase  48.48 
 
 		 160 aa  123  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.312727  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2922  dihydrofolate reductase  43.59 
 
 		 160 aa  123  2e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000038363  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3318  Dihydrofolate reductase  47.69 
 
 		 160 aa  122  3e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0959  dihydrofolate reductase  47.29 
 
 		 160 aa  121  6e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3120  dihydrofolate reductase  46.51 
 
 		 160 aa  120  7e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0972  dihydrofolate reductase  46.92 
 
 		 160 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.415398  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0857  dihydrofolate reductase  46.92 
 
 		 160 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.535024  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1074  dihydrofolate reductase  46.15 
 
 		 160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0303057  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3646  dihydrofolate reductase  47.29 
 
 		 160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1041  dihydrofolate reductase  46.15 
 
 		 160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0691593  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3214  dihydrofolate reductase  46.51 
 
 		 160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.871101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1090  dihydrofolate reductase  50.38 
 
 		 163 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0523811 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0900  dihydrofolate reductase  45.74 
 
 		 160 aa  117  7e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.131279  normal  0.732147 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2824  dihydrofolate reductase  48.46 
 
 		 160 aa  117  7e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0984  dihydrofolate reductase  45.52 
 
 		 160 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.69665  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0932  dihydrofolate reductase  42.48 
 
 		 163 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0874  dihydrofolate reductase  44.68 
 
 		 160 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0789491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2886  Dihydrofolate reductase  44.36 
 
 		 166 aa  115  3e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2659  dihydrofolate reductase  45.11 
 
 		 166 aa  114  5e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.691401 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0700  dihydrofolate reductase region  45.11 
 
 		 163 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.694361  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3741  dihydrofolate reductase  42.54 
 
 		 169 aa  113  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.674026  hitchhiker  0.000322893 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3735  dihydrofolate reductase  41.3 
 
 		 171 aa  112  3e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0124901  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2781  Dihydrofolate reductase  45.74 
 
 		 166 aa  112  3e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.258533 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0096  dihydrofolate reductase  45.31 
 
 		 159 aa  111  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0092  dihydrofolate reductase  45.31 
 
 		 159 aa  111  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.197159 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0093  dihydrofolate reductase  45.31 
 
 		 159 aa  111  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0098  dihydrofolate reductase  45.31 
 
 		 159 aa  111  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.653551 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0091  dihydrofolate reductase  45.31 
 
 		 159 aa  111  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.895795 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1009  dihydrofolate reductase  45.38 
 
 		 160 aa  111  5e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.415728  hitchhiker  0.0000243395 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4209  dihydrofolate reductase  36.88 
 
 		 176 aa  111  6e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03728  dihydrofolate reductase type I, trimethoprim resistance  39.85 
 
 		 167 aa  111  6e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.794995  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00052  dihydrofolate reductase  44.53 
 
 		 159 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3551  Dihydrofolate reductase  44.53 
 
 		 196 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0050  dihydrofolate reductase  44.53 
 
 		 196 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.450338 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0042  dihydrofolate reductase  44.53 
 
 		 159 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3607  dihydrofolate reductase  44.53 
 
 		 159 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00332333 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2039  dihydrofolate reductase  42.31 
 
 		 167 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.570547  normal  0.482414 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0720  dihydrofolate reductase  44.53 
 
 		 160 aa  110  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.919586 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00051  hypothetical protein  44.53 
 
 		 159 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3353  dihydrofolate reductase  44.03 
 
 		 179 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0397175 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0054  dihydrofolate reductase  44.53 
 
 		 159 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2220  dihydrofolate reductase  40.77 
 
 		 162 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.151366  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3104  dihydrofolate reductase  40 
 
 		 162 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.172131  hitchhiker  0.0000000000100648 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0052  dihydrofolate reductase  43.75 
 
 		 159 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.264396  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0597  dihydrofolate reductase  44.53 
 
 		 159 aa  109  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.235828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0423  dihydrofolate reductase  43.41 
 
 		 166 aa  108  3e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0200309 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2267  dihydrofolate reductase  39.23 
 
 		 162 aa  108  5e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00982117  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0052  dihydrofolate reductase  44.53 
 
 		 196 aa  107  6e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2264  dihydrofolate reductase  39.23 
 
 		 162 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.24191e-31 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2083  dihydrofolate reductase  39.23 
 
 		 162 aa  107  8.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.25981  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2021  dihydrofolate reductase  39.23 
 
 		 162 aa  107  8.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.981299  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2021  dihydrofolate reductase  39.23 
 
 		 162 aa  107  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2237  dihydrofolate reductase  39.23 
 
 		 162 aa  107  8.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.044685  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2349  dihydrofolate reductase  39.23 
 
 		 162 aa  107  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000130652  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2062  dihydrofolate reductase  39.23 
 
 		 162 aa  107  8.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000278641  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2431  dihydrofolate reductase  38.24 
 
 		 171 aa  106  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1640  dihydrofolate reductase  39.23 
 
 		 162 aa  106  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00601598  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4526  dihydrofolate reductase  44.53 
 
 		 166 aa  106  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.85477  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0571  dihydrofolate reductase  43.23 
 
 		 160 aa  105  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4737  dihydrofolate reductase  41.79 
 
 		 170 aa  106  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.153856 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0121  dihydrofolate reductase type 5  39.35 
 
 		 160 aa  106  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.43125 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0443  dihydrofolate reductase  40.15 
 
 		 168 aa  106  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001668  dihydrofolate reductase  38.41 
 
 		 159 aa  106  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1582  Dihydrofolate reductase  36.3 
 
 		 162 aa  105  3e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000274022  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1045  dihydrofolate reductase  38.46 
 
 		 163 aa  104  6e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.46602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2571  dihydrofolate reductase  39.57 
 
 		 195 aa  104  7e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.115778  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0054  dihydrofolate reductase  37.98 
 
 		 161 aa  104  7e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.892369  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2037  dihydrofolate reductase  44.03 
 
 		 179 aa  103  8e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.750289  normal  0.473794 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2947  dihydrofolate reductase  40.26 
 
 		 161 aa  103  9e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.631471  normal  0.0218136 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1411  Dihydrofolate reductase  38.73 
 
 		 306 aa  103  9e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000149982 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0051  dihydrofolate reductase  35 
 
 		 161 aa  103  9e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0778  dihydrofolate reductase  42.97 
 
 		 160 aa  103  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.143949  normal  0.0713752 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3449  dihydrofolate reductase  42.97 
 
 		 160 aa  103  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00805  hypothetical protein  37.09 
 
 		 159 aa  103  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1468  dihydrofolate reductase  35.22 
 
 		 160 aa  103  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3578  dihydrofolate reductase  42.97 
 
 		 160 aa  103  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0573  dihydrofolate reductase  41.86 
 
 		 175 aa  102  2e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1398  dihydrofolate reductase  37.74 
 
 		 172 aa  102  3e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1051  Dihydrofolate reductase  39.23 
 
 		 163 aa  101  5e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04580  dihydrofolate reductase  39.86 
 
 		 168 aa  101  5e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0437  dihydrofolate reductase  40.3 
 
 		 170 aa  101  6e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1354  dihydrofolate reductase  37.74 
 
 		 172 aa  100  7e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.340933  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2811  Dihydrofolate reductase  39.49 
 
 		 292 aa  100  7e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000627481  hitchhiker  0.0000305943 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2729  dihydrofolate reductase  42.64 
 
 		 172 aa  99.4  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0802679  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2588  Dihydrofolate reductase  39.53 
 
 		 164 aa  99.4  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0579  dihydrofolate reductase  40.15 
 
 		 163 aa  99.8  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0599  dihydrofolate reductase  42.97 
 
 		 165 aa  99.8  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2332  dihydrofolate reductase  35.29 
 
 		 193 aa  99.8  2e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209062 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1421  Dihydrofolate reductase  33.76 
 
 		 161 aa  99.4  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.491047 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1310  dihydrofolate reductase region  38.93 
 
 		 161 aa  99.8  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000886123  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1793  dihydrofolate reductase  40.44 
 
 		 174 aa  99.8  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.928797  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0366  dihydrofolate reductase type 3  37.66 
 
 		 173 aa  99  3e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1963  dihydrofolate reductase  35.88 
 
 		 183 aa  98.6  4e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1259  dihydrofolate reductase  42.86 
 
 		 166 aa  98.6  4e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000117579 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5361  dihydrofolate reductase  34.76 
 
 		 170 aa  98.2  5e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2858  dihydrofolate reductase  40.31 
 
 		 165 aa  98.2  5e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000404405  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0189  dihydrofolate reductase  36.15 
 
 		 161 aa  97.8  7e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>