175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1193 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1193  ModE family transcriptional regulator  100 
 
 		 107 aa  214  4e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.239879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2794  ModE family transcriptional regulator  73.58 
 
 		 107 aa  159  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4071  putative transcriptional regulator, ModE family  56.19 
 
 		 115 aa  125  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3515  ModE family transcriptional regulator  55.24 
 
 		 112 aa  118  3e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000445767  normal  0.258614 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0723  helix-turn-helix domain protein  49.06 
 
 		 123 aa  110  7.000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.523038  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0871  putative transcriptional regulator, ModE family  49.06 
 
 		 123 aa  110  7.000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.741628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4259  ModE family transcriptional regulator  56.19 
 
 		 138 aa  105  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.459196  normal  0.100548 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4205  putative transcriptional regulator, ModE family  49.5 
 
 		 125 aa  103  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.590179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2496  ModE family transcriptional regulator  60.44 
 
 		 115 aa  102  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3706  putative transcriptional regulator, ModE family  46.6 
 
 		 114 aa  101  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5511  putative transcriptional regulator, ModE family  46.6 
 
 		 114 aa  101  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2824  ModE family transcriptional regulator  51.06 
 
 		 152 aa  101  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.812847 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2293  ModE family transcriptional regulator  51.09 
 
 		 115 aa  99.4  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.11585  normal  0.260705 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0934  LysR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 134 aa  98.6  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.102124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1642  LysR family transcriptional regulator  45.54 
 
 		 128 aa  98.6  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.986241 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3881  putative transcriptional regulator, ModE family  48.51 
 
 		 119 aa  97.8  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180792  normal  0.0155271 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4319  ModE family transcriptional regulator  48.35 
 
 		 129 aa  94.4  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0494502  normal  0.0757875 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0974  molybdenum-binding transcriptional repressor  44.55 
 
 		 132 aa  94.4  5e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1343  molybdenum transport protein, putative  52.17 
 
 		 177 aa  92  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3409  ModE family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 116 aa  92.4  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0426925  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2514  ModE family transcriptional regulator  43.96 
 
 		 125 aa  89.7  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.217491  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3199  ModE family transcriptional regulator  45.63 
 
 		 162 aa  88.2  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.213891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6170  ModE family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 141 aa  88.2  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.350331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3767  putative transcriptional regulator, ModE family  52.48 
 
 		 112 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1950  ModE family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 137 aa  85.9  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0318025  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4419  ModE family transcriptional regulator  47.67 
 
 		 125 aa  84.3  5e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.675399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1869  putative transcriptional regulator, ModE family  51.11 
 
 		 125 aa  84.3  6e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.214893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3855  ModE family transcriptional regulator  47.25 
 
 		 117 aa  83.6  9e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.81779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0460  ModE family transcriptional regulator  44.87 
 
 		 127 aa  83.2  0.000000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000661787  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2664  ModE family transcriptional regulator  42.57 
 
 		 118 aa  80.1  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.554277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1405  putative transcriptional regulator, ModE family  45.65 
 
 		 126 aa  79  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.518534  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2036  ModE family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 276 aa  79  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1927  ModE family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 129 aa  77.8  0.00000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6143  putative transcriptional regulator, ModE family  36.26 
 
 		 114 aa  77.4  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.144159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2952  ModE family transcriptional regulator  51.06 
 
 		 118 aa  76.6  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0281  ModE family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 134 aa  72.8  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1477  molybdenum-binding protein, N-terminal:molybdenum-pterin binding protein  41.98 
 
 		 272 aa  70.9  0.000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5342  putative transcriptional regulator, ModE family  40.54 
 
 		 114 aa  70.5  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0940  transcriptional regulator, ModE family  35.37 
 
 		 263 aa  69.7  0.00000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000762676  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0207  ModE family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 120 aa  68.9  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3480  transcriptional regulator ModE  42.31 
 
 		 117 aa  67.4  0.00000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2075  molybdenum transport regulator  35.64 
 
 		 140 aa  67  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0066  ModE family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 108 aa  65.5  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000184024  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4134  putative transcriptional regulator, ModE family  37.78 
 
 		 121 aa  65.5  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0113407 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50680  Mo regulation, Mo processing homeostasis  38.46 
 
 		 270 aa  65.1  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.438349  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1131  putative transcriptional regulator, ModE family  48.28 
 
 		 125 aa  65.1  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0011  ModE family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 125 aa  65.1  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1989  ModE family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 263 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.455542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0330  putative transcriptional regulator, ModE family  34.41 
 
 		 116 aa  64.7  0.0000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000263512  normal  0.179413 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1100  ModE family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 145 aa  64.7  0.0000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.87335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2476  molybdate transport repressor  38.82 
 
 		 263 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.240008  normal  0.243533 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0360  putative transcriptional regulator, ModE family  34.07 
 
 		 242 aa  63.5  0.000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3874  transcriptional repressor, ModE  38.96 
 
 		 262 aa  62.8  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0735734  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4166  ModE family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 262 aa  62.8  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00104797  normal  0.104434 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0938  putative transcriptional regulator, ModE family  41.56 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137945 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1701  ModE family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 125 aa  61.6  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.540153  normal  0.344174 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1731  ModE family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 268 aa  61.6  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000816631  normal  0.0463603 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2059  regulatory protein LysR  30.77 
 
 		 245 aa  61.6  0.000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000246336  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0962  molybdate transport repressor  36.05 
 
 		 263 aa  61.6  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0023  ModE family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 135 aa  61.6  0.000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0856  ModE family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 263 aa  60.8  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0054  ModE family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 138 aa  60.8  0.000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0286693 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0212  CBS domain-containing protein  32.97 
 
 		 247 aa  61.2  0.000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0705  ModE family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 263 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1578  putative transcriptional regulator, ModE family  34.78 
 
 		 134 aa  60.5  0.000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.82567 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5199  transcriptional regulator, ModE family  36.59 
 
 		 263 aa  60.1  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1034  molybdenum-pterin-binding protein, molybdate transport system regulatory protein  41.77 
 
 		 111 aa  60.1  0.000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.296727  normal  0.0986762 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33430  Molybdenum-binding ModE protein  37.8 
 
 		 270 aa  60.1  0.000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0057  ModE family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 137 aa  60.1  0.00000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2068  TOBE domain protein  37.78 
 
 		 257 aa  59.3  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0976  ModE family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 270 aa  58.5  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1573  putative molybdenum-binding protein  42.22 
 
 		 265 aa  57.8  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.163171  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1086  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 		 236 aa  58.2  0.00000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.702437  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2247  transcriptional regulator, ModE family  34.83 
 
 		 266 aa  57  0.00000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0567  ModE family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 268 aa  56.6  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0533  putative transcriptional regulator, ModE family  31.4 
 
 		 118 aa  55.1  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0585  ModE family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 261 aa  54.7  0.0000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0810  transcriptional regulator, ModE family  39.18 
 
 		 267 aa  53.9  0.0000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0330834  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2041  putative transcriptional regulator, ModE family  30.21 
 
 		 118 aa  53.5  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1577  transcriptional regulator of molybdate metabolism, LysR family  38.04 
 
 		 369 aa  52.8  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4219  transcriptional regulator, ModE family  38.89 
 
 		 270 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4329  transcriptional regulator, ModE family  38.89 
 
 		 270 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00653536 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2203  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  29.41 
 
 		 260 aa  53.1  0.000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0360  ModE family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 254 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.970254  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05434  putative molybdenum-pterin-binding protein  40 
 
 		 269 aa  52.8  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2953  ModE family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 263 aa  52.8  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2202  putative transcriptional regulator, ModE family  35 
 
 		 111 aa  52.4  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0390  ModE family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 254 aa  52  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.920005  normal  0.212591 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0386  ModE family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 254 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.129709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0799  ModE family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 259 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000474755  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0492  molybdate transport regulator ModE, putative  43.42 
 
 		 254 aa  52  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4689  helix-turn-helix, Fis-type:molybdenum-binding protein, N-terminal:molybdenum-pterin binding protein  43.42 
 
 		 254 aa  52  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0630  ModE family transcriptional regulator  43.53 
 
 		 290 aa  51.6  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2144  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  36.99 
 
 		 195 aa  51.6  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.947345  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06340  putative molybdenum transport regulator  42.55 
 
 		 252 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0099259  normal  0.759448 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2731  ModE family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 266 aa  51.6  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.134416 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1779  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 95 aa  52  0.000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.027196  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0662  molybdate uptake regulatory protein, HTH containing  37.8 
 
 		 270 aa  51.2  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0590  molybdenum transport regulator  42.55 
 
 		 252 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0376287  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0831  ModE family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 259 aa  51.6  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000109741  normal  0.666571 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>