More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4725 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_4725  hypothetical protein  100 
 
 		 123 aa  245  1e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1389  protein of unknown function DUF59  47.37 
 
 		 106 aa  97.8  4e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.158284  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1484  hypothetical protein  46.24 
 
 		 106 aa  94.7  4e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0464568  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2907  hypothetical protein  44.21 
 
 		 114 aa  90.9  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2804  phenylacetic acid degradation protein paaD  44.21 
 
 		 114 aa  90.9  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2380  hypothetical protein  44.21 
 
 		 114 aa  90.9  6e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1695  hypothetical protein  44.21 
 
 		 114 aa  90.9  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2681  phenylacetic acid degradation protein paaD  44.21 
 
 		 114 aa  90.9  6e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2739  phenylacetic acid degradation protein paaD  44.21 
 
 		 114 aa  90.9  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0848605  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1812  mrp protein  44.68 
 
 		 112 aa  89.7  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0588494  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0632  hypothetical protein  45.05 
 
 		 96 aa  88.6  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.534801  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3948  hypothetical protein  44.79 
 
 		 109 aa  86.3  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1981  hypothetical protein  41.18 
 
 		 120 aa  84.7  4e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.170034  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2957  protein of unknown function DUF59  37.82 
 
 		 122 aa  82  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0466  protein of unknown function DUF59  37.76 
 
 		 100 aa  82.8  0.000000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000420765  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0641  hypothetical protein  40.2 
 
 		 111 aa  81.6  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2151  protein of unknown function DUF59  41.3 
 
 		 107 aa  82  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0657  hypothetical protein  40.2 
 
 		 111 aa  81.3  0.000000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2963  hypothetical protein  38.95 
 
 		 113 aa  80.5  0.000000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.097887  normal  0.074667 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0721  protein of unknown function DUF59  35.42 
 
 		 100 aa  79.3  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0172  hypothetical protein  39.56 
 
 		 212 aa  79.3  0.00000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00946712 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0062  phenylacetic acid degradation protein PaaD  40.4 
 
 		 105 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00111662  hitchhiker  0.00639923 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2041  metal-sulfur cluster biosynthetic protein  42.72 
 
 		 106 aa  77.4  0.00000000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2230  protein of unknown function DUF59  38.3 
 
 		 117 aa  77  0.00000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000479191  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0562  hypothetical protein  45 
 
 		 102 aa  76.6  0.0000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4274  hypothetical protein  41.41 
 
 		 128 aa  76.3  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1140  hypothetical protein  38.24 
 
 		 103 aa  76.3  0.0000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0364796 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2070  protein of unknown function DUF59  37.76 
 
 		 129 aa  75.9  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.787637  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0991  hypothetical protein  42 
 
 		 102 aa  75.5  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.110893  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14660  predicted metal-sulfur cluster biosynthetic enzyme  37 
 
 		 110 aa  75.5  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0972  hypothetical protein  42 
 
 		 102 aa  75.5  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.530657  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2027  FeS assembly SUF system protein  39.22 
 
 		 113 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1214  hypothetical protein  43.75 
 
 		 100 aa  75.5  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.595392  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1551  protein of unknown function DUF59  36.46 
 
 		 100 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0876  hypothetical protein  34.69 
 
 		 102 aa  75.5  0.0000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1833  protein of unknown function DUF59  40.66 
 
 		 99 aa  75.5  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3279  FeS assembly SUF system protein  39.67 
 
 		 185 aa  75.1  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0585568  normal  0.0371399 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1281  hypothetical protein  42.39 
 
 		 118 aa  75.1  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.654013 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0998  hypothetical protein  37 
 
 		 108 aa  74.7  0.0000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.239725 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2448  hypothetical protein  37.74 
 
 		 129 aa  74.7  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0276111 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1701  hypothetical protein  39.42 
 
 		 115 aa  74.7  0.0000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.782765  normal  0.0606512 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5187  hypothetical protein  39.39 
 
 		 105 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.287075  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4906  hypothetical protein  39.39 
 
 		 105 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4751  hypothetical protein  39.39 
 
 		 105 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000601505  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5281  hypothetical protein  39.39 
 
 		 105 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.604827  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1486  hypothetical protein  35.71 
 
 		 105 aa  73.9  0.0000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0634808 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5151  hypothetical protein  39.39 
 
 		 105 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000362667 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0200  hypothetical protein  41.84 
 
 		 160 aa  73.9  0.0000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4770  hypothetical protein  38.38 
 
 		 105 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0900  hypothetical protein  37.08 
 
 		 108 aa  73.2  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5182  hypothetical protein  37.37 
 
 		 105 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00344764  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2914  protein of unknown function DUF59  37.5 
 
 		 117 aa  72.8  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.757819 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0960  hypothetical protein  36.08 
 
 		 110 aa  72.8  0.000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000488551  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2269  protein of unknown function DUF59  38.46 
 
 		 107 aa  72  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.787383 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0268  protein of unknown function DUF59  38.46 
 
 		 133 aa  72.4  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5196  hypothetical protein  37.37 
 
 		 105 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0118  protein of unknown function DUF59  42.11 
 
 		 99 aa  71.6  0.000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3304  hypothetical protein  38.04 
 
 		 140 aa  71.6  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000282005 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5981  metal-sulfur cluster biosynthetic enzyme  34.48 
 
 		 121 aa  71.2  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.579625  normal  0.0823678 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4866  hypothetical protein  36.36 
 
 		 105 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2291  protein of unknown function DUF59  42.55 
 
 		 109 aa  70.9  0.000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0318532  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2107  hypothetical protein  38.95 
 
 		 110 aa  70.5  0.000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0521729  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0498  hypothetical protein  42.11 
 
 		 111 aa  70.9  0.000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.305412 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1666  hypothetical protein  36.13 
 
 		 149 aa  70.5  0.000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.470727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3621  hypothetical protein  39.8 
 
 		 104 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0348  protein of unknown function DUF59  34.38 
 
 		 96 aa  70.5  0.000000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000101094  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1832  protein of unknown function DUF59  37.76 
 
 		 98 aa  69.7  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0938164  normal  0.975103 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3077  hypothetical protein  36.96 
 
 		 138 aa  69.7  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.214528  normal  0.195602 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2392  protein of unknown function DUF59  41.11 
 
 		 238 aa  69.7  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2530  hypothetical protein  40 
 
 		 105 aa  70.1  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2091  hypothetical protein  36.73 
 
 		 123 aa  69.7  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2569  hypothetical protein  39.58 
 
 		 132 aa  68.9  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0766  hypothetical protein  38.24 
 
 		 120 aa  69.3  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.36517  normal  0.611735 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2914  FeS assembly SUF system protein  37.11 
 
 		 164 aa  68.6  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.446647  normal  0.950309 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0668  hypothetical protein  38.54 
 
 		 156 aa  68.6  0.00000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00352857  normal  0.307047 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2033  metal-sulfur cluster biosynthetic protein  40.43 
 
 		 101 aa  68.2  0.00000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04480  hypothetical protein  39.6 
 
 		 108 aa  68.6  0.00000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.633098  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3473  hypothetical protein  34.15 
 
 		 135 aa  68.2  0.00000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.642924  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1024  protein of unknown function DUF59  38.68 
 
 		 142 aa  67.8  0.00000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.929199  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0561  YitW  33.33 
 
 		 93 aa  67.8  0.00000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0356325  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3035  FeS assembly SUF system protein  34.95 
 
 		 104 aa  67.4  0.00000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.010077 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2441  hypothetical protein  36.73 
 
 		 126 aa  67.4  0.00000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1175  hypothetical protein  40.21 
 
 		 107 aa  67.4  0.00000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1849  protein of unknown function DUF59  35.79 
 
 		 110 aa  67.4  0.00000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000125685 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1197  hypothetical protein  33.33 
 
 		 104 aa  67  0.00000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.792644  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1842  YitW  36.46 
 
 		 96 aa  67  0.00000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0133153  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1805  hypothetical protein  37 
 
 		 108 aa  67  0.00000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.752163  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1425  hypothetical protein  34.02 
 
 		 113 aa  66.2  0.0000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00404545  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0141  hypothetical protein  35.79 
 
 		 124 aa  66.6  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00350528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1272  hypothetical protein  32.11 
 
 		 132 aa  66.6  0.0000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.025331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1435  protein of unknown function DUF59  37.5 
 
 		 99 aa  66.2  0.0000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0162  FeS assembly SUF system protein  38 
 
 		 103 aa  66.6  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000779531  unclonable  7.25464e-16 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2334  protein of unknown function DUF59  34.44 
 
 		 143 aa  66.6  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.633871 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1447  hypothetical protein  33.33 
 
 		 121 aa  66.2  0.0000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.399108  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1848  hypothetical protein  33.03 
 
 		 131 aa  66.2  0.0000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.180623 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2388  protein of unknown function DUF59  34.45 
 
 		 134 aa  65.9  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.322473  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1674  hypothetical protein  32.04 
 
 		 101 aa  65.5  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0498751  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5148  protein of unknown function DUF59  32.23 
 
 		 131 aa  65.9  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.657235  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21890  predicted metal-sulfur cluster biosynthetic enzyme  35.23 
 
 		 121 aa  65.9  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.904123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1459  hypothetical protein  37.37 
 
 		 106 aa  65.1  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.226744  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>