238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2491 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_2491  hypothetical protein  100 
 
 
92 aa  186  7e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00258271  normal  0.0855304 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5612  hypothetical protein  68.18 
 
 
91 aa  126  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.792267 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2241  protein of unknown function DUF156  62.79 
 
 
88 aa  120  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.181547  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5165  hypothetical protein  63.64 
 
 
102 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4727  protein of unknown function DUF156  60.47 
 
 
88 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.641634 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2969  hypothetical protein  60.23 
 
 
95 aa  117  6e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0817169 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2242  hypothetical protein  61.36 
 
 
97 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00107206  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3410  hypothetical protein  56.52 
 
 
93 aa  114  5e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.480175  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1883  protein of unknown function DUF156  58.14 
 
 
91 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.512687 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2756  hypothetical protein  56.98 
 
 
89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0122308 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4279  hypothetical protein  60.23 
 
 
97 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2932  hypothetical protein  57.14 
 
 
97 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0695526  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1769  hypothetical protein  53.26 
 
 
92 aa  107  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0590786 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1807  protein of unknown function DUF156  55.91 
 
 
93 aa  107  5e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0558  hypothetical protein  66.67 
 
 
96 aa  106  9.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.986743  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3194  hypothetical protein  47.83 
 
 
92 aa  104  5e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1887  hypothetical protein  50.54 
 
 
94 aa  103  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.31313  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4224  hypothetical protein  55.17 
 
 
91 aa  101  4e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.39415  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1146  protein of unknown function DUF156  54.74 
 
 
85 aa  99.8  1e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0930028  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3513  protein of unknown function DUF156  45.78 
 
 
81 aa  79.3  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1583  NreA protein  60.34 
 
 
63 aa  77  0.00000000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1453  NreA protein  49.21 
 
 
63 aa  67.4  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0385778  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0131  hypothetical protein  36.9 
 
 
90 aa  61.2  0.000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00000289357  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2632  hypothetical protein  35.14 
 
 
95 aa  59.3  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00527658  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0690  hypothetical protein  40 
 
 
116 aa  58.5  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0207  hypothetical protein  37.33 
 
 
91 aa  58.5  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1136  protein of unknown function DUF156  48.28 
 
 
90 aa  58.2  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0543  hypothetical protein  49.09 
 
 
85 aa  57.8  0.00000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1857  protein of unknown function DUF156  36.36 
 
 
91 aa  57.4  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.151072  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3870  hypothetical protein  36.36 
 
 
91 aa  57  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.863177 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0333  protein of unknown function DUF156  38.89 
 
 
97 aa  55.8  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.14085e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01250  hypothetical protein  39.13 
 
 
114 aa  55.8  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4465  hypothetical protein  35.21 
 
 
109 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4548  hypothetical protein  35.21 
 
 
109 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4381  hypothetical protein  37.5 
 
 
91 aa  55.1  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0351  nickel resistance determinant  31.71 
 
 
89 aa  55.5  0.0000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000183122  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0438  protein of unknown function DUF156  37.5 
 
 
107 aa  55.5  0.0000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3092  hypothetical protein  33.33 
 
 
91 aa  55.1  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.642683  normal  0.388953 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10985  hypothetical protein  32.05 
 
 
119 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0616995  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1688  protein of unknown function DUF156  32.5 
 
 
103 aa  54.7  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1700  protein of unknown function DUF156  32.5 
 
 
103 aa  54.7  0.0000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0139409  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4021  protein of unknown function DUF156  32.47 
 
 
93 aa  53.9  0.0000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.359633 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1454  hypothetical protein  35.21 
 
 
109 aa  53.5  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1472  hypothetical protein  35.21 
 
 
109 aa  53.5  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3435  hypothetical protein  36.11 
 
 
91 aa  53.5  0.0000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2284  hypothetical protein  34.21 
 
 
98 aa  53.5  0.0000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5881  hypothetical protein  28.92 
 
 
98 aa  53.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.811301 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0725  protein of unknown function DUF156  40.91 
 
 
86 aa  53.1  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.66886  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1481  hypothetical protein  33.77 
 
 
91 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.494418  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0148  hypothetical protein  30.86 
 
 
103 aa  52.8  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.626316  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0714  hypothetical protein  29.76 
 
 
89 aa  53.1  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00303881  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A01  hypothetical protein  35.59 
 
 
85 aa  53.1  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0821974  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0157  hypothetical protein  30.86 
 
 
103 aa  52.8  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.603264  normal  0.882667 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10191  hypothetical protein  30.59 
 
 
96 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0183  hypothetical protein  32.1 
 
 
103 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.49313  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0279  YvgZ  32.1 
 
 
103 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0910  hypothetical protein  34.72 
 
 
91 aa  52.4  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3817  hypothetical protein  34.72 
 
 
91 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.510545  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3027  hypothetical protein  28.95 
 
 
91 aa  52  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.120862 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3832  hypothetical protein  45.45 
 
 
85 aa  52.4  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3465  protein of unknown function DUF156  30 
 
 
107 aa  52  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0950133  normal  0.633622 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4499  hypothetical protein  32.61 
 
 
108 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.519747 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11794  hypothetical protein  39.06 
 
 
89 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000113188  hitchhiker  0.00000461883 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36130  hypothetical protein  37.5 
 
 
93 aa  51.6  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.225482  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1900  protein of unknown function DUF156  34.92 
 
 
109 aa  52  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0356  protein of unknown function DUF156  47.27 
 
 
88 aa  52  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11230  hypothetical protein  35.38 
 
 
103 aa  52  0.000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.499044 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0295  hypothetical protein  30.85 
 
 
94 aa  51.2  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4242  protein of unknown function DUF156  33.8 
 
 
115 aa  51.6  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1650  hypothetical protein  30 
 
 
93 aa  51.6  0.000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4267  hypothetical protein  32.93 
 
 
110 aa  51.6  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2133  hypothetical protein  36.36 
 
 
92 aa  51.2  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0961579  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0138  hypothetical protein  30.86 
 
 
103 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0713014 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2574  protein of unknown function DUF156  45.45 
 
 
88 aa  51.6  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000536206  hitchhiker  0.00036449 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3602  protein of unknown function DUF156  34.38 
 
 
100 aa  51.2  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.251846  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3746  hypothetical protein  42.59 
 
 
96 aa  51.6  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2226  hypothetical protein  45.45 
 
 
89 aa  51.2  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.366789 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4507  YrkD  32 
 
 
87 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000126278 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1802  protein of unknown function DUF156  32.5 
 
 
103 aa  50.8  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0193  hypothetical protein  31.75 
 
 
89 aa  50.8  0.000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00253275  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0988  protein of unknown function DUF156  29.55 
 
 
91 aa  50.8  0.000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.11096  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4026  hypothetical protein  40.32 
 
 
90 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.363044  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3243  hypothetical protein  36.07 
 
 
129 aa  50.8  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0741  protein of unknown function DUF156  32.88 
 
 
97 aa  50.8  0.000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000244551  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3648  protein of unknown function DUF156  29.33 
 
 
121 aa  50.4  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0982  hypothetical protein  43.64 
 
 
89 aa  50.4  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0685  hypothetical protein  32 
 
 
87 aa  50.4  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1827  hypothetical protein  43.64 
 
 
89 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.573125  normal  0.937495 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4130  protein of unknown function DUF156  29.33 
 
 
127 aa  50.1  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3583  protein of unknown function DUF156  29.33 
 
 
121 aa  50.1  0.000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4587  hypothetical protein  31.71 
 
 
93 aa  50.1  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0195  hypothetical protein  38.46 
 
 
89 aa  50.1  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.165888  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4097  hypothetical protein  28.92 
 
 
115 aa  50.1  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0141  hypothetical protein  40 
 
 
87 aa  49.7  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2921  hypothetical protein  28.57 
 
 
93 aa  49.7  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.719524  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0202  protein of unknown function DUF156  43.64 
 
 
85 aa  49.7  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1739  protein of unknown function DUF156  32.88 
 
 
103 aa  50.1  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0478748  hitchhiker  0.00498764 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2597  protein of unknown function DUF156  33.8 
 
 
109 aa  49.7  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2895  protein of unknown function DUF156  29.41 
 
 
86 aa  50.1  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0466  protein of unknown function DUF156  32.31 
 
 
97 aa  49.7  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.686705  normal  0.135664 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>