More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6730 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_2643  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  57.96 
 
 
644 aa  734    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6730  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  100 
 
 
632 aa  1298    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.907657  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1350  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  55.7 
 
 
655 aa  686    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06914  prolyl oligopeptidase  49.18 
 
 
655 aa  605  9.999999999999999e-173  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000910  putative peptidase  49.18 
 
 
640 aa  605  9.999999999999999e-173  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.982884  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1004  prolyl oligopeptidase family protein  40.57 
 
 
759 aa  489  1e-137  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2049  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  44.05 
 
 
907 aa  464  1e-129  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.564098  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3201  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  44.64 
 
 
924 aa  456  1e-127  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.243991 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1646  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  42.61 
 
 
705 aa  451  1e-125  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.106603  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0365  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  36.44 
 
 
632 aa  449  1.0000000000000001e-124  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1266  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  41.36 
 
 
631 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.211135  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5159  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  38.6 
 
 
666 aa  442  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.017012  decreased coverage  0.000228688 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2052  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  39.44 
 
 
630 aa  435  1e-120  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.55137  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0766  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  42.11 
 
 
641 aa  431  1e-119  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1930  peptidase S9, prolyl oligopeptidase  39.61 
 
 
646 aa  427  1e-118  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0952  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  41.03 
 
 
706 aa  423  1e-117  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.630914  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1669  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  39.17 
 
 
629 aa  422  1e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1353  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  39.4 
 
 
629 aa  416  9.999999999999999e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.262385  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8147  hypothetical protein  39.27 
 
 
634 aa  413  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4393  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  39.12 
 
 
626 aa  411  1e-113  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03802  dipeptidyl anminopeptidase  39.04 
 
 
694 aa  407  1.0000000000000001e-112  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5922  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  38.49 
 
 
626 aa  402  1e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2658  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  37.66 
 
 
642 aa  389  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.55127  normal  0.367777 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1886  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  37.7 
 
 
636 aa  374  1e-102  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0377  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  37.62 
 
 
626 aa  370  1e-101  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.280031  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0301  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  36.94 
 
 
626 aa  368  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.111113 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0345  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  36.94 
 
 
626 aa  368  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0476  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  36.14 
 
 
688 aa  365  2e-99  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0706  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  35.36 
 
 
656 aa  363  6e-99  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.155251 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4483  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  35.22 
 
 
682 aa  363  6e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4772  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  38.72 
 
 
632 aa  363  7.0000000000000005e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1803  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  36.52 
 
 
731 aa  362  1e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.184836  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0482  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  36.46 
 
 
686 aa  362  1e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3884  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  34.74 
 
 
686 aa  352  8.999999999999999e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.913505  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17781  hypothetical protein  34.65 
 
 
681 aa  324  3e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.46714 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0702  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  34.32 
 
 
665 aa  303  5.000000000000001e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0469  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  32.63 
 
 
638 aa  303  6.000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0003  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.6 
 
 
665 aa  300  6e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0048  prolyl oligopeptidase family protein  29.28 
 
 
642 aa  293  9e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.436282  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0384  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.61 
 
 
662 aa  281  2e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.290431  normal  0.0110983 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3841  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.5 
 
 
654 aa  281  2e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0372  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.61 
 
 
662 aa  281  2e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3485  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.36 
 
 
654 aa  280  4e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0398  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.45 
 
 
662 aa  279  1e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000316056 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4252  prolyl oligopeptidase family protein  29.84 
 
 
662 aa  279  1e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0594  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.16 
 
 
623 aa  277  3e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0373  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.24 
 
 
662 aa  276  9e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.265704  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4565  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.71 
 
 
657 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00542478  unclonable  0.0000000539912 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3832  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.02 
 
 
659 aa  274  3e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3774  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.89 
 
 
661 aa  274  3e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.455998 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3714  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.78 
 
 
650 aa  274  3e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0448  peptidase  30.11 
 
 
678 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.547634 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0323  prolyl oligopeptidase family protein  29.4 
 
 
649 aa  271  2.9999999999999997e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0381  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.69 
 
 
654 aa  269  8.999999999999999e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.217468  unclonable  0.000000000177281 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3601  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.78 
 
 
661 aa  268  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0322  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  28.29 
 
 
653 aa  264  4.999999999999999e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0395751  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0398  peptidase  31.07 
 
 
657 aa  263  1e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4518  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.29 
 
 
652 aa  261  2e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.164406 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0355  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.04 
 
 
662 aa  261  3e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.824077 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4496  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  33.5 
 
 
657 aa  252  1e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.597999  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3833  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.48 
 
 
649 aa  252  2e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1087  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.77 
 
 
650 aa  251  2e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.393964  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4618  prolyl oligopeptidase family protein  31.64 
 
 
645 aa  248  2e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2303  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  31 
 
 
615 aa  247  4e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3803  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.7 
 
 
645 aa  247  4e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.6032 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0246  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.23 
 
 
644 aa  243  6e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3511  prolyl oligopeptidase family protein  29.55 
 
 
638 aa  237  4e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0143  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.91 
 
 
645 aa  237  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4323  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.11 
 
 
645 aa  236  6e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4124  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  32.11 
 
 
645 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00624  prolyl oligopeptidase  28.84 
 
 
653 aa  234  3e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0602  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.11 
 
 
653 aa  233  9e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0774537 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0834  hypothetical protein  26.88 
 
 
648 aa  229  1e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.386873  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0129  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  35.78 
 
 
665 aa  229  1e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.286088 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0844  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.75 
 
 
646 aa  226  9e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0897  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.39 
 
 
600 aa  221  1.9999999999999999e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.835581  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4261  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.85 
 
 
652 aa  221  3.9999999999999997e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3234  acylamino-acid-releasing enzyme  27.21 
 
 
596 aa  220  6e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2353  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.76 
 
 
597 aa  218  2e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000276973  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1709  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.31 
 
 
594 aa  218  2.9999999999999998e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2025  prolyl oligopeptidase family protein  29.16 
 
 
636 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00251963  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1112  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.24 
 
 
656 aa  217  5e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.245577  normal  0.568355 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0529  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.15 
 
 
634 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3064  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.4 
 
 
755 aa  211  4e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.366531  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1193  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.73 
 
 
642 aa  204  4e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0078  prolyl oligopeptidase family protein  25.77 
 
 
665 aa  203  7e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6348  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.06 
 
 
629 aa  198  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0493  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.53 
 
 
662 aa  197  5.000000000000001e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0179177  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3063  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.42 
 
 
688 aa  197  5.000000000000001e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1195  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.33 
 
 
645 aa  196  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.430413  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6187  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.49 
 
 
656 aa  196  1e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.317055 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3931  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  32.14 
 
 
695 aa  194  5e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0988778 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0522  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.06 
 
 
610 aa  192  2e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.450113  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0494  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.26 
 
 
685 aa  182  2e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0656758  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3188  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.26 
 
 
612 aa  182  2e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0312  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  29 
 
 
588 aa  179  1e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0027  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.85 
 
 
642 aa  173  6.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.018636  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3662  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.68 
 
 
621 aa  172  2e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0540328  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2493  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.1 
 
 
607 aa  171  5e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.530992  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0194  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  24.85 
 
 
638 aa  170  7e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>