More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5365 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5365  precorrin-4 C11-methyltransferase  100 
 
 
241 aa  483  1e-136  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.973627 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1249  precorrin-4 C11-methyltransferase / precorrin-2 C20-methyltransferase  96.27 
 
 
241 aa  447  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.230063  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3139  precorrin-4 C11-methyltransferase  82.57 
 
 
243 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103399  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1198  precorrin-4 C11-methyltransferase  82.5 
 
 
242 aa  387  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1678  precorrin-4 C11-methyltransferase  82.5 
 
 
242 aa  387  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0635313  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1651  precorrin-4 C11-methyltransferase  82.5 
 
 
242 aa  387  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4829  precorrin-4 C11-methyltransferase  81.67 
 
 
242 aa  384  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0449828 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1578  precorrin-4 C11-methyltransferase  82.5 
 
 
242 aa  382  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00147705  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1596  precorrin-4 C11-methyltransferase  82.08 
 
 
242 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.727098  normal  0.416998 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1564  precorrin-4 C11-methyltransferase  79.25 
 
 
242 aa  377  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.253118  normal  0.214845 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1972  precorrin-4 C11-methyltransferase  80.42 
 
 
241 aa  371  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2213  precorrin-3 methylase  78.99 
 
 
250 aa  370  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.578417  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2117  precorrin-4 C11-methyltransferase  80.42 
 
 
241 aa  371  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.105353  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1955  precorrin-4 C11-methyltransferase  80.42 
 
 
241 aa  371  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.132176  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2394  precorrin-4 C11-methyltransferase  80.42 
 
 
241 aa  372  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25920  precorrin-3 methylase  79.41 
 
 
250 aa  373  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0297541  normal  0.071417 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1157  precorrin-4 C11-methyltransferase  79.58 
 
 
241 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.917528  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1598  precorrin-4 C11-methyltransferase  79.58 
 
 
241 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00151458  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0901  precorrin-4 C11-methyltransferase  79.58 
 
 
241 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.324814  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0259  precorrin-4 C11-methyltransferase  79.58 
 
 
241 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3020  precorrin-4 C11-methyltransferase  74.37 
 
 
249 aa  346  2e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.157987 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3154  precorrin-4 C11-methyltransferase  74.79 
 
 
249 aa  345  5e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.134288  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3103  precorrin-4 C11-methyltransferase  72.69 
 
 
248 aa  337  8e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2779  precorrin-4 C11-methyltransferase  71.01 
 
 
250 aa  335  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.545494  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2530  precorrin-4 C11-methyltransferase  70.17 
 
 
250 aa  335  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00855327 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3410  precorrin-4 C11-methyltransferase  68.49 
 
 
250 aa  329  3e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.231837 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2352  precorrin-4 C11-methyltransferase  68.49 
 
 
250 aa  329  3e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4589  precorrin-4 C11-methyltransferase  72.69 
 
 
251 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000000120449  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0176  precorrin-4 C11-methyltransferase  61.41 
 
 
258 aa  269  4e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0121511  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3384  precorrin-4 C11-methyltransferase  57.61 
 
 
253 aa  262  3e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215023  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1375  precorrin-4 C11-methyltransferase  55.37 
 
 
257 aa  259  2e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0286247 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2540  precorrin-4 C11-methyltransferase  58.7 
 
 
257 aa  258  6e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.789222 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2923  precorrin-4 C11-methyltransferase  54.51 
 
 
264 aa  256  3e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.680231  normal  0.0185874 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2635  precorrin-4 C11-methyltransferase  55.14 
 
 
263 aa  254  7e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.231618  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1262  precorrin-4 C11-methyltransferase  55 
 
 
252 aa  254  9e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3152  precorrin-4 C11-methyltransferase  54.1 
 
 
253 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.422575  normal  0.404272 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1885  precorrin-4 C11-methyltransferase  55.42 
 
 
261 aa  253  1.0000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.804703  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1300  precorrin-4 C11-methyltransferase  54.58 
 
 
252 aa  251  7e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2446  precorrin-4 C11-methyltransferase  54.73 
 
 
261 aa  246  2e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.130726  normal  0.124304 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0313  precorrin-4 C11-methyltransferase  49.17 
 
 
251 aa  246  2e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1475  precorrin-4 C11-methyltransferase  55.74 
 
 
260 aa  246  3e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.429453  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2821  precorrin-4 C11-methyltransferase  55.33 
 
 
260 aa  245  3e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3260  precorrin-4 C11-methyltransferase  55.14 
 
 
253 aa  245  4e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.280776 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1882  precorrin-4 C11-methyltransferase  56.38 
 
 
259 aa  243  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2218  precorrin-4 C11-methyltransferase  53.69 
 
 
264 aa  242  3.9999999999999997e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.352147  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0808  precorrin-4 C11-methyltransferase  52.28 
 
 
254 aa  239  2e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1525  precorrin-4 C11-methyltransferase  54.92 
 
 
260 aa  239  4e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.466887 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2087  precorrin-3 methylase  49.37 
 
 
257 aa  238  5.999999999999999e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2501  precorrin-4 C11-methyltransferase  56.02 
 
 
251 aa  238  6.999999999999999e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.218572 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2374  precorrin-4 C11-methyltransferase  53.91 
 
 
259 aa  238  8e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5844  precorrin-4 C11-methyltransferase  52.87 
 
 
292 aa  235  5.0000000000000005e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.903403 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3515  precorrin-4 C11-methyltransferase  53.5 
 
 
257 aa  234  1.0000000000000001e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.312418 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3184  precorrin-4 C11-methyltransferase  53.91 
 
 
259 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2157  precorrin-4 C11-methyltransferase  53.11 
 
 
280 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.107141  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0564  precorrin-4 C11-methyltransferase  53.53 
 
 
246 aa  231  7.000000000000001e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.518716  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1779  precorrin-4 C11-methyltransferase  53.72 
 
 
250 aa  231  8.000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.592244  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5598  Precorrin-4 C(11)-methyltransferase  53.11 
 
 
247 aa  231  9e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0099157  normal  0.596158 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0473  precorrin-4 C11-methyltransferase  50.66 
 
 
252 aa  229  4e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0962  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.47 
 
 
254 aa  226  2e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.6045  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1853  precorrin-4 C11-methyltransferase  53.31 
 
 
247 aa  226  4e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0334  precorrin-4 C11-methyltransferase  57.26 
 
 
261 aa  224  7e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7180  precorrin-4 C11-methyltransferase  50 
 
 
252 aa  224  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.987588  normal  0.0970048 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1092  precorrin-4 C11-methyltransferase  52.3 
 
 
254 aa  223  2e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6025  precorrin-4 C11-methyltransferase  51.67 
 
 
252 aa  223  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0102106  normal  0.375652 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2314  precorrin-4 C11-methyltransferase  53.56 
 
 
259 aa  223  3e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0491012  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1013  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.03 
 
 
253 aa  222  4e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1011  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.13 
 
 
254 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.04114  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1523  precorrin-4 C11-methyltransferase  52.26 
 
 
280 aa  221  6e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00837984  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0969  precorrin-4 C11-methyltransferase  51.03 
 
 
262 aa  221  7e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0702  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.58 
 
 
244 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0934  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.3 
 
 
254 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.23833  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5685  precorrin-4 C11-methyltransferase  51.44 
 
 
260 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0876668  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3278  precorrin-4 C11-methyltransferase  51.67 
 
 
253 aa  220  1.9999999999999999e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.696559  normal  0.9588 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2129  precorrin-4 C11-methyltransferase  50 
 
 
259 aa  218  8.999999999999998e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000738255 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1342  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.35 
 
 
254 aa  217  1e-55  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0039  precorrin-4 C11-methyltransferase  51.03 
 
 
258 aa  217  1e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1747  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.06 
 
 
254 aa  217  1e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.129763  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12107  precorrin-4 C11-methyltransferase cobM  52.89 
 
 
251 aa  216  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.182153  normal  0.885771 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0933  precorrin-4 C11-methyltransferase  45 
 
 
260 aa  215  4e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00452437 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3123  precorrin-4 C11-methyltransferase  50.62 
 
 
258 aa  215  4e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2994  precorrin-4 C11-methyltransferase  51.87 
 
 
264 aa  215  5.9999999999999996e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2812  precorrin-4 C11-methyltransferase  49.58 
 
 
266 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.55111 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1166  precorrin-4 C11-methyltransferase  49.79 
 
 
266 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.647626  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1039  precorrin-4 C11-methyltransferase  49.79 
 
 
266 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0255255 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1265  precorrin-4 C11-methyltransferase  50.87 
 
 
267 aa  212  4.9999999999999996e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0638  precorrin-4 C11-methyltransferase  52.56 
 
 
271 aa  210  1e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2484  precorrin-4 C11-methyltransferase  51.85 
 
 
250 aa  210  2e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2529  precorrin-4 C11-methyltransferase  51.85 
 
 
250 aa  210  2e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.527305 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2711  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.84 
 
 
248 aa  208  5e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379668  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0483  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.97 
 
 
258 aa  207  9e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2205  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.47 
 
 
257 aa  206  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2151  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.06 
 
 
257 aa  206  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0163963  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0059  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.68 
 
 
256 aa  206  3e-52  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2251  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.47 
 
 
257 aa  205  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.476505  normal  0.353064 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2357  precorrin-4 C11-methyltransferase  50.43 
 
 
259 aa  204  8e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.342045  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2198  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.06 
 
 
257 aa  204  8e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.333099  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2179  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.3 
 
 
252 aa  204  1e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0645183  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2521  precorrin-4 C11-methyltransferase  51.03 
 
 
250 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.14903 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2364  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.06 
 
 
257 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3607  precorrin-4 C11-methyltransferase  49.38 
 
 
261 aa  204  1e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>