More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0147 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_0147  dihydropteroate synthase  100 
 
 
257 aa  509  1e-143  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1765  dihydropteroate synthase  57.25 
 
 
285 aa  283  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.270074 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1581  dihydropteroate synthase  58.69 
 
 
290 aa  281  1e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.239571 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3026  dihydropteroate synthase  56.64 
 
 
285 aa  268  5e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.369504 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1932  dihydropteroate synthase  54.58 
 
 
392 aa  266  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.36752  normal  0.985512 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2233  dihydropteroate synthase  52.36 
 
 
292 aa  266  2.9999999999999995e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2633  dihydropteroate synthase  52.19 
 
 
294 aa  265  5e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.160124  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2044  dihydropteroate synthase  53.33 
 
 
285 aa  263  2e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2581  dihydropteroate synthase  49.2 
 
 
393 aa  262  4.999999999999999e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1814  dihydropteroate synthase  53.97 
 
 
289 aa  260  1e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.690503 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0812  dihydropteroate synthase  48.4 
 
 
270 aa  259  2e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000234542  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0513  dihydropteroate synthase  52.53 
 
 
278 aa  258  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.884922 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5758  dihydropteroate synthase  54.37 
 
 
295 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.425757 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1766  dihydropteroate synthase  54.76 
 
 
289 aa  253  3e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.202084  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2150  dihydropteroate synthase  53.97 
 
 
289 aa  252  5.000000000000001e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.733482  normal  0.221707 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0110  dihydropteroate synthase  50 
 
 
402 aa  251  8.000000000000001e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5983  dihydropteroate synthase  54.76 
 
 
279 aa  249  3e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0523591  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0235  dihydropteroate synthase  49.6 
 
 
394 aa  248  8e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.683276 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3533  dihydropteroate synthase  52.36 
 
 
288 aa  246  2e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.139072  normal  0.316671 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0067  dihydropteroate synthase  48.22 
 
 
277 aa  242  5e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0079  dihydropteroate synthase  46 
 
 
277 aa  236  2e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.863078  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5237  dihydropteroate synthase  46.4 
 
 
277 aa  234  7e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000121132 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1883  dihydropteroate synthase  50.59 
 
 
394 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.436317  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0067  dihydropteroate synthase  45.85 
 
 
286 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0069  dihydropteroate synthase  51.05 
 
 
283 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0151  dihydropteroate synthase  46.64 
 
 
407 aa  233  3e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.355211  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0070  dihydropteroate synthase  46 
 
 
280 aa  232  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0939  dihydropteroate synthase  45 
 
 
397 aa  232  4.0000000000000004e-60  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0784  dihydropteroate synthase  46.72 
 
 
279 aa  232  4.0000000000000004e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.362908  unclonable  0.000000150876 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0071  dihydropteroate synthase  46.25 
 
 
280 aa  231  8.000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0067  dihydropteroate synthase (DHPS) (dihydropteroate pyrophosphorylase)  46.25 
 
 
280 aa  231  8.000000000000001e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0067  dihydropteroate synthase (DHPS) (dihydropteroate pyrophosphorylase)  46.25 
 
 
280 aa  231  8.000000000000001e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0071  dihydropteroate synthase  46.25 
 
 
280 aa  231  8.000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1882  dihydropteroate synthase  48.33 
 
 
274 aa  231  9e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.747516  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0080  dihydropteroate synthase  46.25 
 
 
277 aa  231  9e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000343414 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0083  dihydropteroate synthase  45.6 
 
 
277 aa  231  1e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.944677  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0095  dihydropteroate synthase  48.8 
 
 
396 aa  229  2e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2253  dihydropteroate synthase  50 
 
 
400 aa  228  8e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.379586  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1889  dihydropteroate synthase  51.84 
 
 
290 aa  227  1e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000220218  hitchhiker  0.00000000634632 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3451  dihydropteroate synthase  46.3 
 
 
286 aa  225  4e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0072  dihydropteroate synthase  48.1 
 
 
285 aa  224  7e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1098  dihydropteroate synthase  45 
 
 
269 aa  224  1e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0139197  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1029  dihydropteroate synthase  45.82 
 
 
279 aa  223  3e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.191608  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1330  dihydropteroate synthase  44.13 
 
 
274 aa  222  4.9999999999999996e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.144104  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0995  dihydropteroate synthase  46.86 
 
 
279 aa  221  6e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1276  dihydropteroate synthase  44.17 
 
 
269 aa  221  8e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000186218  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0619  dihydropteroate synthase  45.98 
 
 
397 aa  220  9.999999999999999e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000204624  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4718  dihydropteroate synthase  47.1 
 
 
283 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4717  dihydropteroate synthase  47.1 
 
 
283 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00896074 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0154  dihydropteroate synthase  46.8 
 
 
399 aa  219  3e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.465574  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3289  dihydropteroate synthase  46.34 
 
 
287 aa  218  6e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2568  dihydropteroate synthase  44.02 
 
 
286 aa  218  7.999999999999999e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.032898  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4583  dihydropteroate synthase  47.1 
 
 
283 aa  218  7.999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.918855  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3614  dihydropteroate synthase  46.15 
 
 
283 aa  215  5e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1596  dihydropteroate synthase  50.41 
 
 
278 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0715  dihydropteroate synthase  46.72 
 
 
283 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.964503  normal  0.0739685 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2404  dihydropteroate synthase  45.91 
 
 
279 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2354  dihydropteroate synthase  45.91 
 
 
279 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2638  dihydropteroate synthase  50 
 
 
278 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.578756  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2861  dihydropteroate synthase  44.81 
 
 
299 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.366025  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1971  dihydropteroate synthase  46.67 
 
 
289 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.305951 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3567  dihydropteroate synthase  44.23 
 
 
279 aa  211  9e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00503342  hitchhiker  0.00000448434 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1808  dihydropteroate synthase  52.26 
 
 
303 aa  210  1e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.70358  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1469  dihydropteroate synthase  45.74 
 
 
298 aa  211  1e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.400128  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1534  dihydropteroate synthase  43.58 
 
 
289 aa  210  2e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.631326 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62850  dihydropteroate synthase  45.17 
 
 
283 aa  209  3e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1527  7,8-dihydropteroate synthase protein  46.36 
 
 
291 aa  209  4e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.134999  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3354  dihydropteroate synthase  43.24 
 
 
276 aa  209  4e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.2621  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2261  dihydropteroate synthase  45.53 
 
 
258 aa  209  5e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00525567  hitchhiker  0.00000000957493 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0773  dihydropteroate synthase  45.17 
 
 
283 aa  209  5e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00166691  normal  0.0199876 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0484  dihydropteroate synthase  43.08 
 
 
277 aa  208  6e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00193978  normal  0.18931 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2635  dihydropteroate synthase  45.53 
 
 
277 aa  208  7e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1198  dihydropteroate synthase  43.19 
 
 
277 aa  207  1e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5470  dihydropteroate synthase  45.17 
 
 
283 aa  207  1e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.592135  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3735  dihydropteroate synthase  43.08 
 
 
277 aa  207  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00714217  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3601  dihydropteroate synthase  43.08 
 
 
277 aa  207  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000106991  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2841  dihydropteroate synthase  41.54 
 
 
264 aa  206  2e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0633  dihydropteroate synthase  45.56 
 
 
258 aa  206  2e-52  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3245  dihydropteroate synthase  43.19 
 
 
277 aa  206  4e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000109731  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1024  dihydropteroate synthase  43.19 
 
 
277 aa  206  4e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0113899  hitchhiker  0.0000441656 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1349  dihydropteroate synthase  45.38 
 
 
282 aa  205  5e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.694482  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2840  dihydropteroate synthase  43.19 
 
 
277 aa  205  6e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000230549  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3423  dihydropteroate synthase  43.19 
 
 
277 aa  205  7e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000169878  decreased coverage  0.000110965 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1263  dihydropteroate synthase  43.7 
 
 
270 aa  205  7e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.823203 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3080  dihydropteroate synthase  45.91 
 
 
290 aa  205  7e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.642553  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2710  dihydropteroate synthase  41.15 
 
 
264 aa  204  9e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3611  dihydropteroate synthase  42.31 
 
 
282 aa  204  9e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00230251  normal  0.142126 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3395  dihydropteroate synthase  42.25 
 
 
280 aa  204  1e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000218907  hitchhiker  0.0003141 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1485  dihydropteroate synthase  46.22 
 
 
284 aa  204  1e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0106007  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1603  dihydropteroate synthase  45.8 
 
 
282 aa  203  2e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0216733  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0205  dihydropteroate synthase  47.01 
 
 
262 aa  203  2e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0151744  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0955  dihydropteroate synthase  43.08 
 
 
279 aa  203  2e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0212772  normal  0.281578 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3986  dihydropteroate synthase  42.69 
 
 
277 aa  203  2e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000550562  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1925  dihydropteroate synthase  42.58 
 
 
291 aa  202  3e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00000353988  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1122  dihydropteroate synthase  42.8 
 
 
284 aa  203  3e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000916741  unclonable  0.00000000000396906 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2183  dihydropteroate synthase  45.1 
 
 
289 aa  202  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0156937 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2115  dihydropteroate synthase  43.92 
 
 
282 aa  203  3e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1085  dihydropteroate synthase  42.41 
 
 
277 aa  203  3e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00216639  normal  0.0692827 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0550  dihydropteroate synthase  41.7 
 
 
286 aa  202  3e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.860771 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0530  dihydropteroate synthase  41.92 
 
 
282 aa  202  4e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0023005  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>