287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_24230 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_24230  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  100 
 
 		 358 aa  706    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.795122  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3289  cytochrome c assembly protein  43.48 
 
 		 381 aa  272  7e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.794512  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3088  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  44.05 
 
 		 360 aa  269  5e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17940  ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis, permease component  42.86 
 
 		 366 aa  263  4e-69  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4471  cytochrome c assembly protein  42.4 
 
 		 366 aa  259  5.0000000000000005e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4302  cytochrome c assembly protein  42.4 
 
 		 366 aa  259  5.0000000000000005e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.694809  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4202  cytochrome c assembly protein  42.4 
 
 		 366 aa  259  5.0000000000000005e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0631  cytochrome c assembly protein  41.64 
 
 		 328 aa  251  2e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.244792  hitchhiker  0.001469 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4574  cytochrome c assembly protein  41.1 
 
 		 360 aa  244  1.9999999999999999e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0447  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  42.49 
 
 		 321 aa  234  2.0000000000000002e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6117  cytochrome c assembly protein  35.93 
 
 		 396 aa  231  1e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.242647  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0254  cytochrome c assembly protein  39.9 
 
 		 378 aa  228  1e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.409306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0513  cytochrome c assembly protein  47.49 
 
 		 397 aa  227  2e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.525112  normal  0.322787 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07230  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  39.89 
 
 		 340 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.383381 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0524  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  38.59 
 
 		 301 aa  216  5.9999999999999996e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00389658 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0929  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  37.37 
 
 		 346 aa  213  4.9999999999999996e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0824  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  38.89 
 
 		 357 aa  207  3e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.341691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24320  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  47.84 
 
 		 297 aa  206  4e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.909816 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02970  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  37.54 
 
 		 333 aa  206  7e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1039  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  35.33 
 
 		 361 aa  204  2e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4428  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  37.92 
 
 		 339 aa  204  2e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3251  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  41.22 
 
 		 351 aa  203  4e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.165529  normal  0.248135 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4570  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  36.69 
 
 		 309 aa  202  8e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0695  cytochrome c assembly protein  40.07 
 
 		 334 aa  202  8e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0708  cytochrome c assembly protein  40.07 
 
 		 334 aa  202  8e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.034343 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0688  cytochrome c assembly protein  40.07 
 
 		 334 aa  202  8e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8079  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  34.83 
 
 		 358 aa  202  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0986266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2200  cytochrome c assembly protein  42.07 
 
 		 327 aa  199  5e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2820  cytochrome c assembly protein  40.14 
 
 		 326 aa  197  3e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4512  cytochrome c assembly protein  38.66 
 
 		 328 aa  196  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5339  cytochrome c assembly protein  39.72 
 
 		 326 aa  196  7e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5672  cytochrome c assembly protein  39.72 
 
 		 326 aa  196  7e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.593468 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3702  cytochrome c assembly protein  39.72 
 
 		 326 aa  196  7e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4515  cytochrome c assembly protein  37.12 
 
 		 330 aa  195  9e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00609835 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10540  cytochrome C-type biogenesis protein ccsA  39 
 
 		 324 aa  191  2e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000241853  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0692  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  34.44 
 
 		 330 aa  191  2e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0232519  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0869  cytochrome c assembly protein  38.75 
 
 		 327 aa  189  4e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.0057057  normal  0.189022 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2731  cytochrome c assembly protein  44.22 
 
 		 341 aa  186  7e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0354846  normal  0.099851 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0049  cytochrome c assembly protein  36.33 
 
 		 324 aa  185  8e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.255683 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4095  cytochrome c assembly protein  34.83 
 
 		 325 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.16923  normal  0.451277 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5011  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  36.31 
 
 		 330 aa  179  4.999999999999999e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6712  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  38.6 
 
 		 321 aa  179  5.999999999999999e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0575  ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis permease component-like protein  35.26 
 
 		 320 aa  177  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2701  CcsB  42.56 
 
 		 329 aa  171  2e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.223788  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0504  cytochrome c assembly protein  35.99 
 
 		 341 aa  171  2e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0350668  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0272  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  41.87 
 
 		 323 aa  171  2e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.480455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2200  cytochrome c assembly protein  39.23 
 
 		 276 aa  157  2e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.418476 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3357  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  36.48 
 
 		 284 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000743711  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3065  cytochrome c biogenesis protein  38.06 
 
 		 278 aa  144  2e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253378  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2587  cytochrome c assembly protein  35.63 
 
 		 284 aa  144  3e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.192397  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0406  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  34.5 
 
 		 271 aa  139  6e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0600631  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0504  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  38.21 
 
 		 271 aa  139  7e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000138241  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0703  cytochrome c assembly protein  36.48 
 
 		 283 aa  137  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0406  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  33.73 
 
 		 271 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0547  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  35.17 
 
 		 282 aa  137  4e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1120  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  29.73 
 
 		 283 aa  136  6.0000000000000005e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.226676  normal  0.779146 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2756  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  34.63 
 
 		 283 aa  136  7.000000000000001e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00415775  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2228  ABC-type transport system, permease component  35.96 
 
 		 285 aa  135  9.999999999999999e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.062571  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0361  cytochrome c assembly protein  33.47 
 
 		 271 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000960033  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3283  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  33.74 
 
 		 271 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3232  cytochrome c assembly protein  32.53 
 
 		 271 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00268584  normal  0.260264 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3841  cytochrome c assembly protein  34.65 
 
 		 282 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000353743  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0614  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  33.48 
 
 		 283 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2514  cytochrome c assembly protein  32.61 
 
 		 284 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000017273  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2900  cytochrome c assembly protein  32.31 
 
 		 284 aa  129  8.000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000276179  normal  0.563922 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1894  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  33.46 
 
 		 272 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.29708  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3263  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  34.2 
 
 		 395 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.147783  normal  0.312102 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2916  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  33.96 
 
 		 395 aa  124  3e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.652315  hitchhiker  0.00362581 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2985  putative transmembrane cytochrome C-type biogenesis transmembrane protein  33.57 
 
 		 395 aa  124  3e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3453  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  32.44 
 
 		 282 aa  124  3e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0684308  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0038  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  33.05 
 
 		 390 aa  123  4e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.854137 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3145  cytochrome c assembly protein  34.2 
 
 		 401 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1049  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  29.84 
 
 		 310 aa  121  1.9999999999999998e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000143982  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0091  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  32.34 
 
 		 454 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3519  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  32.46 
 
 		 282 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00186818 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2805  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  35.27 
 
 		 405 aa  120  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3282  cytochrome c assembly protein  33.46 
 
 		 407 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0234  cytochrome c assembly protein  33.21 
 
 		 381 aa  119  7e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3609  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  33.46 
 
 		 401 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.122456  hitchhiker  0.00000004022 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3481  cytochrome c assembly protein  32.39 
 
 		 396 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0301  cytochrome c assembly protein  32.39 
 
 		 396 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.816512  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0310  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  32.39 
 
 		 396 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.269517 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3741  cytochrome c assembly family protein  35.27 
 
 		 408 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.124691  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0283  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  34.85 
 
 		 396 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.19464  normal  0.962379 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3034  cytochrome c assembly family protein  35.27 
 
 		 396 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0348  cytochrome c assembly protein  34.85 
 
 		 403 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00374335 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2168  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  32.91 
 
 		 405 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1958  cytochrome C assembly protein  35.27 
 
 		 396 aa  117  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.32068  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2597  cytochrome c assembly family protein  35.27 
 
 		 396 aa  117  3e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3512  cytochrome C assembly protein  35.27 
 
 		 396 aa  117  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0773  putative heme transporter  37.99 
 
 		 309 aa  117  3e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.694231  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3712  cytochrome C assembly protein  35.27 
 
 		 396 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3135  cytochrome C assembly protein  35.27 
 
 		 396 aa  117  3e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0361  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  34.44 
 
 		 396 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.342475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2725  cytochrome c assembly protein  34.44 
 
 		 396 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0382  cytochrome c assembly protein  34.44 
 
 		 396 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3770  cytochrome C assembly protein  35.27 
 
 		 396 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2075  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  33.2 
 
 		 258 aa  116  6e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09971  putative heme transporter  32.21 
 
 		 311 aa  115  7.999999999999999e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.671585  normal  0.218138 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0695  cytochrome c assembly protein  32.57 
 
 		 283 aa  115  8.999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00968755  normal  0.243634 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>