32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4519 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4519  hypothetical protein  100 
 
 
729 aa  1516    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03643  hypothetical protein  35.54 
 
 
714 aa  371  1e-101  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4081  hypothetical protein  34.59 
 
 
680 aa  360  6e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.659789  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02463  hypothetical protein  34.98 
 
 
715 aa  359  9.999999999999999e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2743  hypothetical protein  35.2 
 
 
674 aa  350  4e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.762938  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5055  hypothetical protein  33.53 
 
 
674 aa  343  7e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3226  hypothetical protein  33.74 
 
 
728 aa  339  9e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1614  hypothetical protein  33.65 
 
 
746 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0090  hypothetical protein  34.05 
 
 
728 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03639  hypothetical protein  35.25 
 
 
733 aa  335  2e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0205  hypothetical protein  33.11 
 
 
728 aa  332  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0144673  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0101  Type V secretory pathway, adhesin AidA  33.2 
 
 
746 aa  330  4e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0128  hypothetical protein  33.38 
 
 
746 aa  330  4e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02459  hypothetical protein  35.06 
 
 
734 aa  330  8e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1584  hypothetical protein  32.61 
 
 
728 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.287315  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1250  hypothetical protein  31.14 
 
 
716 aa  288  2e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03200  hypothetical protein  31.79 
 
 
716 aa  282  2e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00162132  hitchhiker  0.00000000000240943 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1695  Type V secretory pathway, adhesin AidA  32.13 
 
 
447 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2253  hypothetical protein  28.98 
 
 
774 aa  128  3e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1929  putative ribonuclease G and E  29.19 
 
 
774 aa  128  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.384162  normal  0.037347 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3324  hypothetical protein  30.7 
 
 
797 aa  127  6e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1942  hypothetical protein  29.67 
 
 
746 aa  126  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.382764 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3648  hypothetical protein  30.95 
 
 
805 aa  125  3e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0960  hypothetical protein  29.24 
 
 
746 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.721372  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3370  putative transmembrane protein  29.93 
 
 
770 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5208  putative transmembrane protein  29.06 
 
 
770 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.764838  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03018  hypothetical protein  28.88 
 
 
753 aa  116  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.426915 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3219  putative transmembrane protein  28.38 
 
 
731 aa  116  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00404503 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5511  hypothetical protein  26.22 
 
 
783 aa  112  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.333676  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1687  putative ribonuclease G and E  29.2 
 
 
740 aa  109  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.696506  normal  0.229543 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0094  hypothetical protein  38.4 
 
 
241 aa  87  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.88303  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02456  hypothetical protein  31.48 
 
 
185 aa  52.8  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>