52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_3556 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008784  BMASAVP1_1665  polysaccharide biosynthesis family protein  86.57 
 
 
484 aa  793  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.702931  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1073  polysaccharide biosynthesis protein  72.16 
 
 
492 aa  658  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.610845 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3362  polysaccharide biosynthesis protein  98.16 
 
 
488 aa  946  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3866  polysaccharide biosynthesis protein  98.16 
 
 
488 aa  947  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.377761  normal  0.957657 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2229  polysaccharide transporter  74.33 
 
 
488 aa  692  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0925528 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3556  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 
488 aa  960  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.225239  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4609  polysaccharide biosynthesis protein  92.81 
 
 
488 aa  828  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.286147  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0545  polysaccharide biosynthesis family protein  86.57 
 
 
484 aa  793  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4394  polysaccharide biosynthesis protein  99.8 
 
 
488 aa  958  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.681509  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2289  polysaccharide biosynthesis protein  86.36 
 
 
484 aa  790  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0694  polysaccharide biosynthesis family protein  87.91 
 
 
488 aa  816  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.731179  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1969  polysaccharide biosynthesis protein  74.54 
 
 
488 aa  709  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1706  polysaccharide biosynthesis family protein  86.68 
 
 
488 aa  802  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.974383  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1873  polysaccharide biosynthesis family protein  86.57 
 
 
484 aa  793  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3973  polysaccharide biosynthesis protein  99.8 
 
 
488 aa  958  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0753  polysaccharide biosynthesis family protein  86.68 
 
 
488 aa  802  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2112  polysaccharide biosynthesis protein  97.54 
 
 
498 aa  870  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.306384 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2428  polysaccharide biosynthesis protein  86.36 
 
 
484 aa  790  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2518  polysaccharide exporter, (PST) family  56.06 
 
 
486 aa  489  1e-137  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0230734 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1344  polysaccharide biosynthesis protein  34.81 
 
 
488 aa  246  1e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3796  polysaccharide biosynthesis protein  33.54 
 
 
478 aa  241  3e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0076  polysaccharide biosynthesis protein  35.06 
 
 
499 aa  231  2e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.160586  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0079  polysaccharide biosynthesis protein  35.06 
 
 
499 aa  231  2e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.75242  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3233  polysaccharide biosynthesis protein  30.34 
 
 
473 aa  186  9e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5347  polysaccharide biosynthesis protein  29.34 
 
 
422 aa  134  4e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.775837  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1271  polysaccharide biosynthesis protein  26.97 
 
 
429 aa  132  2e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.958308  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0743  polysaccharide biosynthesis protein  25.89 
 
 
509 aa  130  5e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.197884  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3487  polysaccharide biosynthesis protein  29.65 
 
 
424 aa  121  3e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0265796 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2731  polysaccharide biosynthesis protein  28.88 
 
 
419 aa  105  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0750  polysaccharide biosynthesis protein  24.88 
 
 
468 aa  103  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1791  polysaccharide biosynthesis protein  26.27 
 
 
504 aa  77.8  4e-13  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5012  putative polysaccharide biosynthesis protein  23.85 
 
 
499 aa  71.2  4e-11  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1637  polysaccharide biosynthesis protein  21.13 
 
 
504 aa  68.2  4e-10  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0767  O-antigen transporter-like  24.23 
 
 
506 aa  57.8  4e-07  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3995  polysaccharide biosynthesis protein  24.01 
 
 
497 aa  57.8  5e-07  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.495687  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3093  O-antigen and teichoic acid-like export protein  31.96 
 
 
507 aa  55.1  3e-06  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.116162  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0645  polysaccharide biosynthesis protein  24.57 
 
 
533 aa  54.3  5e-06  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3222  polysaccharide biosynthesis protein  23.6 
 
 
504 aa  53.9  7e-06  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0507176  normal  0.252651 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3440  polysaccharide biosynthesis protein, putative  20.46 
 
 
504 aa  52.4  2e-05  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0552602  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0890  polysaccharide biosynthesis protein  25.15 
 
 
446 aa  51.6  3e-05  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.267642  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1966  polysaccharide biosynthesis protein  21.43 
 
 
507 aa  51.6  4e-05  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0361  polysaccharide biosynthesis protein  21.47 
 
 
519 aa  50.4  7e-05  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.602182  normal  0.0588594 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5560  polysaccharide biosynthesis protein, putative  24.01 
 
 
484 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3876  polysaccharide biosynthesis protein  27.36 
 
 
427 aa  47.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3697  polysaccharide biosynthesis protein  25.21 
 
 
443 aa  47  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.258081 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2211  polysaccharide biosynthesis protein  20.23 
 
 
494 aa  46.2  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.167884  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0604  polysaccharide biosynthesis protein  23.43 
 
 
483 aa  46.2  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  5.72815e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5222  polysaccharide biosynthesis protein  23.67 
 
 
484 aa  45.4  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0464  polysaccharide transporter protein, putative  23.43 
 
 
486 aa  45.8  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000125112  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1033  polysaccharide biosynthesis protein  35.71 
 
 
412 aa  45.1  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0437322  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3059  polysaccharide biosynthesis protein  37.1 
 
 
454 aa  44.3  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0827  polysaccharide biosynthesis protein  22.83 
 
 
522 aa  43.1  0.01  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.769454  normal  0.213046 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>