150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1806 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008390  Bamb_1806  hypothetical protein  100 
 
 
208 aa  421  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.49421  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1778  hypothetical protein  99.52 
 
 
208 aa  419  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6210  hypothetical protein  98.56 
 
 
208 aa  416  1e-115  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.528851  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1869  hypothetical protein  98.56 
 
 
208 aa  416  1e-115  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1892  hypothetical protein  98.56 
 
 
208 aa  416  1e-115  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  4.97448e-05  hitchhiker  6.94622e-09 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5169  hypothetical protein  97.6 
 
 
208 aa  413  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1405  hypothetical protein  97.6 
 
 
208 aa  412  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.80224 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0007  hypothetical protein  94.71 
 
 
208 aa  401  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0582837  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2184  hypothetical protein  95.19 
 
 
208 aa  403  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.390365  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1889  hypothetical protein  94.71 
 
 
208 aa  401  1e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.336902  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2411  hypothetical protein  94.71 
 
 
208 aa  401  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.644101  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1162  hypothetical protein  94.71 
 
 
208 aa  401  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2285  hypothetical protein  94.71 
 
 
208 aa  401  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2246  hypothetical protein  94.71 
 
 
208 aa  401  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0649417  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1399  hypothetical protein  94.71 
 
 
208 aa  401  1e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.238771  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0916  hypothetical protein  87.98 
 
 
208 aa  371  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0624506  normal  0.265186 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2396  inorganic phosphate transporter  87.02 
 
 
208 aa  366  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.333431  normal  0.154826 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1791  protein of unknown function DUF47  86.54 
 
 
208 aa  365  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0557964 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0593  hypothetical protein  70.19 
 
 
208 aa  297  8e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1974  hypothetical protein  70.19 
 
 
208 aa  293  1e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0570237  normal  0.103523 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2001  hypothetical protein  69.71 
 
 
208 aa  292  3e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1248  protein of unknown function DUF47  67.31 
 
 
208 aa  285  3e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.108583  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1187  protein of unknown function DUF47  67.31 
 
 
208 aa  285  3e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0873064  normal  0.0562102 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1312  hypothetical protein  65.87 
 
 
208 aa  281  3e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1469  protein of unknown function DUF47  56.07 
 
 
214 aa  241  5e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3016  hypothetical protein  55.14 
 
 
215 aa  237  1e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.25831  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2707  protein of unknown function DUF47  54.67 
 
 
215 aa  236  2e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3359  hypothetical protein  54.67 
 
 
215 aa  236  2e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.312394 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5349  hypothetical protein  53.27 
 
 
215 aa  233  1e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1880  hypothetical protein  54.67 
 
 
215 aa  233  2e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.690061  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0677  hypothetical protein  55.61 
 
 
215 aa  231  7e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1686  hypothetical protein  54.21 
 
 
215 aa  229  2e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1398  hypothetical protein  53.74 
 
 
215 aa  228  4e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1151  hypothetical protein  51.4 
 
 
215 aa  228  6e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1122  hypothetical protein  52.83 
 
 
212 aa  224  9e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.12514e-07  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0558  protein of unknown function DUF47  47.2 
 
 
215 aa  194  8e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1405  hypothetical protein  47.2 
 
 
215 aa  194  1e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3584  hypothetical protein  44.98 
 
 
206 aa  171  1e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0575149  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0388  hypothetical protein  42.31 
 
 
205 aa  168  5e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3132  hypothetical protein  43.27 
 
 
205 aa  166  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.31524e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4360  protein of unknown function DUF47  41.63 
 
 
211 aa  164  7e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0586  protein of unknown function DUF47  43.27 
 
 
205 aa  164  9e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0141186  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4383  protein of unknown function DUF47  41.63 
 
 
211 aa  164  9e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0340167  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4136  hypothetical protein  41.83 
 
 
205 aa  162  3e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00579708  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4227  hypothetical protein  41.15 
 
 
211 aa  162  4e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3782  protein of unknown function DUF47  40.87 
 
 
205 aa  160  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.287695  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3866  protein of unknown function DUF47  41.35 
 
 
205 aa  160  1e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4377  hypothetical protein  40.19 
 
 
211 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.552455  normal  0.0605917 
 
 
-
 
NC_002936  DET0033  hypothetical protein  38.92 
 
 
209 aa  152  3e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_31  hypothetical protein  37.93 
 
 
219 aa  149  2e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0030  hypothetical protein  36.95 
 
 
209 aa  146  2e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3130  hypothetical protein  38.54 
 
 
204 aa  147  2e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.418855  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1967  protein of unknown function DUF47  35.78 
 
 
209 aa  134  1e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0784272 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0128  protein of unknown function DUF47  32.23 
 
 
212 aa  130  1e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2888  Putitive phosphate transport regulator  32.84 
 
 
208 aa  130  2e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.977017 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1039  hypothetical protein  35.96 
 
 
209 aa  129  3e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0589632  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1415  hypothetical protein  35.24 
 
 
214 aa  127  1e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2118  protein of unknown function DUF47  36.06 
 
 
207 aa  127  2e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0140894  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0716  hypothetical protein  34.29 
 
 
214 aa  126  2e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.68785 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2657  hypothetical protein  34.8 
 
 
204 aa  124  8e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0044  hypothetical protein  33.99 
 
 
209 aa  124  9e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2678  protein of unknown function DUF47  33.65 
 
 
213 aa  124  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.509665 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2334  hypothetical protein  34.62 
 
 
214 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.590464 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0997  6Fe-6S prismane cluster-containing protein-like protein  35.78 
 
 
209 aa  123  2e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.3197  normal  0.498449 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1484  protein of unknown function DUF47  41.25 
 
 
208 aa  123  2e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  5.48446e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2522  protein of unknown function DUF47  34.13 
 
 
214 aa  119  2e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.244143  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3162  hypothetical protein  34.13 
 
 
214 aa  120  2e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3606  hypothetical protein  34.6 
 
 
390 aa  119  3e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.113159 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1022  hypothetical protein  34.31 
 
 
209 aa  118  5e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.808051 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2577  hypothetical protein  31.37 
 
 
214 aa  117  1e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0588  protein of unknown function DUF47  33.17 
 
 
205 aa  117  1e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5203  protein of unknown function DUF47  32.54 
 
 
213 aa  116  2e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.177281 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0891  protein of unknown function DUF47  32.02 
 
 
205 aa  116  2e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3394  hypothetical protein  31.43 
 
 
214 aa  116  2e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.103625  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2947  hypothetical protein  32.21 
 
 
214 aa  115  5e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.847202  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2627  Putitive phosphate transport regulator  39.87 
 
 
203 aa  115  5e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2032  hypothetical protein  31.58 
 
 
215 aa  115  6e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.635616  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4258  hypothetical protein  33.66 
 
 
205 aa  115  7e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1677  hypothetical protein  32.06 
 
 
218 aa  114  1e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.324564  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2384  protein of unknown function DUF47  31.86 
 
 
204 aa  114  1e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0179  protein of unknown function DUF47  32.21 
 
 
217 aa  114  1e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0449  hypothetical protein  32.02 
 
 
205 aa  114  1e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.124613  normal  0.413809 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0191  protein of unknown function DUF47  33.18 
 
 
213 aa  114  1e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.170479 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0763  hypothetical protein  31.86 
 
 
209 aa  113  2e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.615042  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4359  protein of unknown function DUF47  33.49 
 
 
208 aa  112  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.547523  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5473  protein of unknown function DUF47  31.58 
 
 
213 aa  112  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.400135 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0739  protein of unknown function DUF47  32.69 
 
 
210 aa  110  1e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.398486 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0316  hypothetical protein  34.12 
 
 
205 aa  110  1e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.411045  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1747  hypothetical protein  30.81 
 
 
212 aa  109  2e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0430129 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0299  protein of unknown function DUF47  33.5 
 
 
206 aa  109  3e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.686471  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3760  putative low-affinity phosphate transport accessory protein  30.77 
 
 
214 aa  109  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.590376  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0386  protein of unknown function DUF47  26.92 
 
 
206 aa  109  3e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3022  Putative phosphate transport regulator  30 
 
 
206 aa  109  4e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5971  hypothetical protein  32.86 
 
 
214 aa  108  5e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.115846 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2238  protein of unknown function DUF47  33.01 
 
 
206 aa  108  6e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.746394 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1084  Putitive phosphate transport regulator  27.96 
 
 
211 aa  108  7e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0042  protein of unknown function DUF47  29 
 
 
207 aa  108  8e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0702  hypothetical protein  34.12 
 
 
205 aa  107  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  2.82132e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0687  hypothetical protein  34.12 
 
 
205 aa  107  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00131316  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2877  protein of unknown function DUF47  31.43 
 
 
206 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0461875  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>