52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5279 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_5279  hypothetical protein  100 
 
 		 233 aa  457  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5803  hypothetical protein  68.78 
 
 		 236 aa  275  6e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000107973  hitchhiker  0.000892453 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4001  hypothetical protein  48.42 
 
 		 250 aa  167  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2126  putative lipoprotein  47.57 
 
 		 233 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0863972  normal  0.08915 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0710  protein of unknown function DUF330  49.11 
 
 		 248 aa  160  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3798  hypothetical protein  48.78 
 
 		 240 aa  155  7e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.860154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0625  hypothetical protein  46.89 
 
 		 240 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2536  hypothetical protein  44.39 
 
 		 233 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0677  hypothetical protein  47.56 
 
 		 239 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0204159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0710  hypothetical protein  47.56 
 
 		 238 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0226  hypothetical protein  46.95 
 
 		 238 aa  148  9e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0601  hypothetical protein  45.83 
 
 		 242 aa  142  4e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.391552  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3383  hypothetical protein  48.19 
 
 		 256 aa  142  6e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1153  putative lipoprotein  48.19 
 
 		 256 aa  142  6e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2377  putative lipoprotein  48.19 
 
 		 256 aa  142  6e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0803735  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2560  putative lipoprotein  48.19 
 
 		 252 aa  141  7e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3341  hypothetical protein  48.19 
 
 		 239 aa  141  7e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.376866  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0291  putative lipoprotein  48.19 
 
 		 252 aa  141  7e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3375  putative lipoprotein  48.19 
 
 		 252 aa  141  9e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.203626  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3534  hypothetical protein  39.9 
 
 		 253 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0808039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1267  hypothetical protein  44.97 
 
 		 264 aa  137  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2675  hypothetical protein  48.1 
 
 		 243 aa  135  4e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.681553  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1444  hypothetical protein  38.71 
 
 		 208 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.753012  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3180  lipoprotein, putative  32.98 
 
 		 207 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.131862  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3046  hypothetical protein  32.99 
 
 		 207 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.796041  normal  0.0181531 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0516  protein of unknown function DUF330  28.44 
 
 		 222 aa  84.3  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6815  hypothetical protein  27.75 
 
 		 215 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.655082  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0600  hypothetical protein  33.86 
 
 		 211 aa  82.8  0.000000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0442544  normal  0.826922 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0529  hypothetical protein  29.33 
 
 		 222 aa  81.3  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4087  hypothetical protein  29.19 
 
 		 188 aa  78.2  0.00000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00226644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2579  hypothetical protein  30.37 
 
 		 191 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.621383 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5507  hypothetical protein  33.33 
 
 		 201 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2832  hypothetical protein  29.1 
 
 		 183 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.766034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2680  putative lipoprotein  32.12 
 
 		 207 aa  74.3  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.208689  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44160  hypothetical protein  32.99 
 
 		 192 aa  68.6  0.00000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.266274  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2578  hypothetical protein  32.47 
 
 		 176 aa  68.6  0.00000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.130696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3138  hypothetical protein  32.95 
 
 		 176 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2892  protein of unknown function DUF330  29.38 
 
 		 210 aa  64.3  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.529816  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0652  hypothetical protein  33.33 
 
 		 196 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.049729  normal  0.69496 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0578  hypothetical protein  29.01 
 
 		 195 aa  62  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.410916  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2220  protein of unknown function DUF330  29.83 
 
 		 197 aa  62  0.000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000082506 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2634  hypothetical protein  27.75 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6349  hypothetical protein  27.33 
 
 		 225 aa  57  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.238642  normal  0.295075 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3287  hypothetical protein  30.51 
 
 		 178 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.762664 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3241  protein of unknown function DUF330  30.32 
 
 		 199 aa  56.2  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2001  protein of unknown function DUF330  28.32 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.142199  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2448  hypothetical protein  28.64 
 
 		 201 aa  52.8  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.136482  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2417  hypothetical protein  26.37 
 
 		 204 aa  52  0.000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0242841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1231  protein of unknown function DUF330  29.11 
 
 		 202 aa  50.1  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.228197  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0364  putative lipoprotein  25.76 
 
 		 201 aa  48.5  0.00009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.14709  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1569  hypothetical protein  25.58 
 
 		 209 aa  45.4  0.0007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.849012  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2723  hypothetical protein  23.08 
 
 		 211 aa  42.4  0.007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>