More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_0768 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009074  BURPS668_0768  cytochrome c family protein  100 
 
 
482 aa  944  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00254  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0943  cytochrome c family protein  96.68 
 
 
650 aa  834  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0780  cytochrome c family protein  96.68 
 
 
476 aa  835  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00190536  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1294  cytochrome c, class I  69.84 
 
 
527 aa  558  1e-158  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0963416  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6289  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  72.77 
 
 
530 aa  558  1e-158  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.550632  normal  0.0291984 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6536  cytochrome c, class I  69.84 
 
 
527 aa  558  1e-158  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.403161  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5499  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  72.75 
 
 
537 aa  558  1e-157  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00943544 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6575  cytochrome c, class I  72.59 
 
 
554 aa  557  1e-157  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0822253  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6144  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  68.59 
 
 
527 aa  551  1e-156  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.548869 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0083  putative alcohol dehydrogenase cytochrome c subunit  57.91 
 
 
473 aa  452  1e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0300779 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2187  putative alcohol dehydrogenase cytochrome c subunit precursor, cytochrome c553  57.42 
 
 
476 aa  449  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0196419 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2030  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  56.52 
 
 
433 aa  448  1e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  3.05388e-05 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5487  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  55.37 
 
 
451 aa  444  1e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0456  cytochrome c, class I  52.01 
 
 
463 aa  423  1e-117  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4796  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  51.93 
 
 
440 aa  410  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.160851 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0171  putative cytochrome c, class I  51.03 
 
 
469 aa  409  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5084  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  49.5 
 
 
432 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5949  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  48.76 
 
 
434 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.275687  normal  0.160447 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5193  cytochrome c, class I  49.5 
 
 
432 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00931011 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3175  cytochrome c, class I  49.5 
 
 
432 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1601  cytochrome c, class I  50.75 
 
 
432 aa  380  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.023048  normal  0.40449 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4297  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  49.26 
 
 
441 aa  378  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3959  cytochrome c, class I  49.01 
 
 
434 aa  378  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3829  cytochrome c, class I  49.5 
 
 
439 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0398501  normal  0.201929 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4408  cytochrome c, class I  49.01 
 
 
434 aa  378  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4216  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  49.75 
 
 
434 aa  375  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.659443  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2110  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  48.51 
 
 
447 aa  368  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.701093  normal  0.375253 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4961  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  46.77 
 
 
426 aa  365  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.360414  normal  0.0488597 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2294  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  49.37 
 
 
453 aa  368  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2471  cytochrome c, class I  48.1 
 
 
450 aa  367  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6799  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  48.74 
 
 
454 aa  365  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.131117  normal  0.655046 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3250  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  47.13 
 
 
422 aa  364  2e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.27905  normal  0.409121 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3623  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  48.25 
 
 
447 aa  363  4e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2835  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  47.47 
 
 
448 aa  358  1e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0245579  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2014  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  46.73 
 
 
426 aa  358  1e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.684291  normal  0.0791101 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1689  cytochrome c, class I  45.69 
 
 
430 aa  355  7e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0300798  normal  0.396396 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2504  putative cytochrome c  47.58 
 
 
434 aa  353  5e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.347672 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6211  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  46.39 
 
 
448 aa  343  3e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.783844  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2502  cytochrome c, class I  45.89 
 
 
450 aa  337  3e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0817  cytochrome c, class I  40.4 
 
 
669 aa  337  4e-91  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.04472  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0084  cytochrome c, class I  45.98 
 
 
433 aa  335  1e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1497  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  46.21 
 
 
448 aa  335  1e-90  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0777111  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2155  cytochrome c, class I  42.23 
 
 
728 aa  332  1e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4096  putative cytochrome c  46.77 
 
 
447 aa  332  1e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.687974  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3640  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  43.29 
 
 
395 aa  330  4e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1453  cytochrome c, class I  44.36 
 
 
432 aa  329  6e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5211  putative cytochrome c  45.16 
 
 
675 aa  328  1e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.0072933  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2974  putative cytochrome c precursor  46.12 
 
 
439 aa  327  4e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.34008  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2566  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  45.34 
 
 
415 aa  327  4e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.79853  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1792  cytochrome c, class I  45.71 
 
 
470 aa  323  5e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.346602 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1415  cytochrome c, class I  42.89 
 
 
708 aa  322  1e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.526567  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2499  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  42.36 
 
 
726 aa  321  2e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.345014  normal  0.965839 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2484  cytochrome c family protein  44.04 
 
 
721 aa  321  2e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0635463  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2377  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  44.33 
 
 
417 aa  319  5e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105053  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3977  cytochrome c, class I  42.52 
 
 
425 aa  319  6e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.386742  normal  0.0120271 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3647  cytochrome c, class I  44.8 
 
 
477 aa  319  7e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.946427  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60490  putative cytochrome c  43.53 
 
 
675 aa  319  7e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00637068  normal  0.0584653 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2563  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  44.39 
 
 
415 aa  319  8e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.151427 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4441  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  42.28 
 
 
425 aa  319  9e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3292  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  45 
 
 
475 aa  318  1e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.618986 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4141  cytochrome c, class I  45 
 
 
475 aa  318  1e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.5261  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4225  cytochrome c, class I  45 
 
 
475 aa  318  1e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.138651  normal  0.183785 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5752  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  41.81 
 
 
425 aa  318  2e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.95358  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3816  cytochrome c, class I  41.81 
 
 
425 aa  318  2e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4552  cytochrome c, class I  41.81 
 
 
425 aa  318  2e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.859169 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35270  putative cytochrome c precursor  45.57 
 
 
439 aa  317  3e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.534785 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0226  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  45.08 
 
 
467 aa  316  5e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4380  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  45.96 
 
 
469 aa  316  5e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4121  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  45.36 
 
 
477 aa  316  6e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0652  cytochrome c family protein  44.12 
 
 
509 aa  316  6e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.422125  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2138  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  42.79 
 
 
439 aa  316  7e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.622417  normal  0.750578 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0804  cytochrome c family protein  43.81 
 
 
721 aa  315  8e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0263  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  44.72 
 
 
470 aa  315  1e-84  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.473095  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2348  cytochrome c family protein  44.58 
 
 
694 aa  314  2e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.903737  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4638  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  44.29 
 
 
451 aa  313  3e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.683371 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1599  cytochrome c, class I  41.96 
 
 
438 aa  313  4e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.050865  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3382  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  43.83 
 
 
417 aa  313  6e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.545776 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1071  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  44.03 
 
 
699 aa  311  1e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5989  Cytochrome c  41.26 
 
 
773 aa  311  2e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.278439 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00910  gluconate dehydrogenase cytochrome c subunit  43.86 
 
 
439 aa  311  2e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.367446  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1294  cytochrome c, class I  41.57 
 
 
425 aa  311  2e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.618448  normal  0.723346 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0689  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  42.11 
 
 
447 aa  308  2e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6548  cytochrome c, class I  41.09 
 
 
425 aa  308  2e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2214  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  42.89 
 
 
689 aa  307  2e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.143053  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2072  cytochrome c, class I  43.6 
 
 
712 aa  308  2e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.901126 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1435  glucose dehydrogenase, beta subunit  43.18 
 
 
452 aa  307  3e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1350  glucose dehydrogenase, beta subunit  43.18 
 
 
452 aa  307  3e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0106089  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2590  cytochrome c family protein  43.18 
 
 
497 aa  305  1e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0215  cytochrome c family protein  42.93 
 
 
452 aa  303  4e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1084  cytochrome c family protein  42.93 
 
 
452 aa  303  4e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.508293  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1244  cytochrome c family protein  42.93 
 
 
452 aa  303  4e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.148627  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0488  cytochrome c family protein  42.93 
 
 
452 aa  303  4e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.155198  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1414  cytochrome c family protein  42.18 
 
 
492 aa  303  6e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.186397  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2335  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  39.29 
 
 
426 aa  303  7e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  1.30755e-08  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2492  cytochrome c, class I  41.95 
 
 
698 aa  301  2e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00140351  normal  0.928162 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4095  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  41.09 
 
 
425 aa  301  2e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.290618  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1163  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  43.53 
 
 
448 aa  299  9e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3370  cytochrome c, class I  44.53 
 
 
691 aa  296  6e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.384758  normal  0.0138407 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0790  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  41.56 
 
 
427 aa  294  2e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.310202  normal  0.354457 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0720  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  41.56 
 
 
427 aa  293  5e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.690125 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>