More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A2116 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_5014  oxidoreductase FAD-binding subunit  86.95 
 
 		 382 aa  694    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240099  normal  0.858048 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3295  oxidoreductase FAD-binding subunit  82.6 
 
 		 385 aa  665    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.27905  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02038  ferredoxin oxidoreductase protein  84.29 
 
 		 382 aa  667    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.365456 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0702  putative ferredoxin, 2Fe-2S  99.47 
 
 		 380 aa  785    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.54952  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0998  putative ferredoxin, 2Fe-2S  99.47 
 
 		 380 aa  785    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0388253  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0836  putative ferredoxin, 2Fe-2S  99.47 
 
 		 380 aa  784    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0479  putative ferredoxin, 2Fe-2S  99.48 
 
 		 381 aa  786    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4814  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  83.64 
 
 		 386 aa  678    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.501777  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2116  iron-sulfur cluster-binding protein  100 
 
 		 381 aa  790    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.994866  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0579  ferredoxin/oxidoreductase  87.01 
 
 		 382 aa  701    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0748  putative ferredoxin, 2Fe-2S  100 
 
 		 380 aa  788    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1860  iron-sulfur cluster-binding protein  93.7 
 
 		 379 aa  726    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3291  oxidoreductase FAD-binding region  86.72 
 
 		 382 aa  698    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4489  oxidoreductase FAD-binding subunit  86.95 
 
 		 382 aa  694    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.320814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1971  putative ferredoxin, 2Fe-2S  99.47 
 
 		 380 aa  785    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.851205  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3554  oxidoreductase FAD-binding subunit  87.27 
 
 		 382 aa  702    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5077  oxidoreductase FAD-binding subunit  86.72 
 
 		 382 aa  698    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5208  oxidoreductase FAD-binding subunit  87.21 
 
 		 382 aa  700    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5071  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  72.97 
 
 		 414 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407916  hitchhiker  0.00354835 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1577  putative ferredoxin oxidoreductase protein  71.56 
 
 		 418 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3397  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  56.74 
 
 		 375 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4002  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  55.18 
 
 		 381 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.924171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3747  oxidoreductase FAD-binding subunit  55.15 
 
 		 375 aa  412  1e-114  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.225631 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2855  ferredoxin  56.12 
 
 		 394 aa  412  1e-114  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4042  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  52.6 
 
 		 375 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.186376 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2477  ferredoxin  54.34 
 
 		 379 aa  403  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.949989 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4058  oxidoreductase FAD-binding subunit  53.26 
 
 		 383 aa  392  1e-108  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0362952  normal  0.241879 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1002  oxidoreductase FAD-binding subunit  55.65 
 
 		 363 aa  383  1e-105  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0859657  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6856  ferredoxin  53 
 
 		 381 aa  376  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4844  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  47.53 
 
 		 356 aa  350  3e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0431343 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5288  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  48.02 
 
 		 363 aa  345  8e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.632487  normal  0.142716 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2665  oxidoreductase FAD-binding subunit  48.43 
 
 		 396 aa  337  9.999999999999999e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.202569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6200  putative ferredoxin  48.86 
 
 		 366 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71420  putative ferredoxin  48.86 
 
 		 366 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4136  oxidoreductase FAD-binding subunit  46.45 
 
 		 367 aa  333  2e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4775  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  48.41 
 
 		 366 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.05576 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1005  oxidoreductase FAD-binding protein  46.54 
 
 		 368 aa  325  8.000000000000001e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4891  oxidoreductase FAD-binding subunit  44.18 
 
 		 390 aa  323  4e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0931607  normal  0.322747 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5215  oxidoreductase FAD-binding region  46.31 
 
 		 366 aa  322  5e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.11132  hitchhiker  0.00973319 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0339  oxidoreductase FAD-binding subunit  47.4 
 
 		 366 aa  322  5e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0495555  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0316  oxidoreductase FAD-binding domain protein  47.4 
 
 		 368 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.482566  decreased coverage  0.00002417 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0402  iron-sulfur cluster-binding protein  48.98 
 
 		 366 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.501485  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0337  oxidoreductase FAD-binding subunit  47.67 
 
 		 366 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00256748  normal  0.662502 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4030  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  46.24 
 
 		 365 aa  317  2e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0982  ferredoxin I  45.17 
 
 		 362 aa  312  4.999999999999999e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0484  ferredoxin  43.66 
 
 		 364 aa  312  4.999999999999999e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2831  ferredoxin  45.35 
 
 		 358 aa  310  2e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0794308  normal  0.972856 
 
 
-
 
NC_004310  BR1462  NADH oxidoreductase, putative  43.85 
 
 		 372 aa  310  4e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.345138  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1188  ferredoxin  42.78 
 
 		 355 aa  308  6.999999999999999e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3979  ferredoxin  46.39 
 
 		 353 aa  296  3e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1711  ferredoxin  42.46 
 
 		 372 aa  294  2e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3218  ferredoxin  42.25 
 
 		 355 aa  290  2e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.33819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5978  ferredoxin  42.94 
 
 		 364 aa  288  1e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.430172  normal  0.458682 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1056  oxidoreductase FAD-binding subunit  42.7 
 
 		 374 aa  277  3e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1070  oxidoreductase FAD-binding subunit  41.05 
 
 		 361 aa  270  2e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2913  oxidoreductase FAD-binding subunit  41.26 
 
 		 380 aa  269  5e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2831  oxidoreductase FAD-binding subunit  40.97 
 
 		 376 aa  266  4e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.926186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3010  oxidoreductase FAD-binding subunit  40.69 
 
 		 380 aa  266  5.999999999999999e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1217  oxidoreductase FAD-binding subunit  40.11 
 
 		 406 aa  260  3e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.640214  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3096  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  40.11 
 
 		 387 aa  260  3e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.592741  normal  0.0476829 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1175  oxidoreductase FAD-binding subunit  40.86 
 
 		 371 aa  258  9e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1294  oxidoreductase FAD-binding subunit  40.69 
 
 		 388 aa  258  1e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4292  FHA domain containing protein  38.7 
 
 		 606 aa  256  5e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.168951  normal  0.224479 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4230  FHA domain containing protein  38.7 
 
 		 606 aa  256  5e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1166  oxidoreductase FAD-binding subunit  38.59 
 
 		 367 aa  251  2e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1261  ferredoxin  38.75 
 
 		 365 aa  248  1e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.48547  hitchhiker  0.000283754 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1261  oxidoreductase FAD-binding subunit  39.67 
 
 		 407 aa  245  8e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0896  iron-sulfur cluster-binding protein  39.61 
 
 		 356 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.844973 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3608  oxidoreductase FAD-binding subunit  38.61 
 
 		 403 aa  243  5e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1364  iron-sulfur cluster-binding protein  38.97 
 
 		 325 aa  240  2e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0404  oxidoreductase, NAD/FAD/2Fe-2S iron-sulfur cluster binding protein  34.17 
 
 		 373 aa  218  1e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363299  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0315  hypothetical protein  34.97 
 
 		 662 aa  212  7e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00340  putative NADH oxidoreductase; putative nitric oxide dioxygenase  34.67 
 
 		 585 aa  207  3e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3770  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  32.91 
 
 		 585 aa  204  2e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.708524  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001340  ferredoxin-NADPH reductase  33.05 
 
 		 605 aa  197  2.0000000000000003e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4896  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  35.07 
 
 		 342 aa  195  9e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.699955 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003800  NADH oxidoreductase Hcr  34.34 
 
 		 351 aa  193  4e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2337  hypothetical protein  32.31 
 
 		 627 aa  192  1e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05229  ferredoxin/oxidoreductase  33.04 
 
 		 605 aa  191  2.9999999999999997e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2468  oxidoreductase FAD-binding region  34.17 
 
 		 625 aa  190  4e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.82591  normal  0.524788 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0195  oxidoreductase  31.3 
 
 		 597 aa  188  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6652  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  33.05 
 
 		 688 aa  188  1e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.640624  normal  0.369043 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1085  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  32.18 
 
 		 702 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0093  putative NADH oxidoreductase; putative nitric oxide dioxygenase  32.52 
 
 		 670 aa  184  3e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.303734 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3715  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.35 
 
 		 467 aa  180  4e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.437326  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2334  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.69 
 
 		 669 aa  179  8e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.896317 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5128  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  32.95 
 
 		 351 aa  176  7e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.243235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6898  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  31.1 
 
 		 677 aa  175  9.999999999999999e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1665  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  31.86 
 
 		 334 aa  174  2.9999999999999996e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.212931  normal  0.785012 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5188  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  31.76 
 
 		 356 aa  174  2.9999999999999996e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.726966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3782  ferredoxin  33.24 
 
 		 352 aa  173  3.9999999999999995e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00690243  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3723  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  31.95 
 
 		 358 aa  171  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.571859 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4115  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  31.34 
 
 		 345 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0217  ferredoxin  31.69 
 
 		 357 aa  170  3e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0184042 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3690  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  37.45 
 
 		 468 aa  167  2e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3712  ferredoxin  32.84 
 
 		 339 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.709133  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3785  ferredoxin  32.84 
 
 		 339 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.870039  normal  0.280135 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13259  oxidoreductase  32.65 
 
 		 380 aa  167  4e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.637455 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3725  ferredoxin  32.84 
 
 		 339 aa  167  4e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0900  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  32.67 
 
 		 389 aa  166  5e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>