More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR2100 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR2100  hypothetical protein  100 
 
 
513 aa  1034    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0820  hypothetical protein  82.54 
 
 
509 aa  843    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2017  hypothetical protein  99.81 
 
 
513 aa  1031    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3245  hypothetical protein  51.9 
 
 
504 aa  493  9.999999999999999e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.479121  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3962  protein of unknown function UPF0079  52.33 
 
 
503 aa  479  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4289  protein of unknown function UPF0079  51.52 
 
 
505 aa  476  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0623599  normal  0.680884 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1355  P-loop hydrolase/phosphotransferase  46.87 
 
 
497 aa  461  9.999999999999999e-129  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3578  hypothetical protein  51.11 
 
 
498 aa  436  1e-121  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.303943  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0051  hypothetical protein  50.8 
 
 
502 aa  431  1e-119  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0625  hypothetical protein  49.08 
 
 
505 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00759808  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0206  hypothetical protein  48.07 
 
 
505 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0259343  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0081  protein of unknown function UPF0079  46.28 
 
 
506 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.428182  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0493  aminoglycoside phosphotransferase  48.19 
 
 
514 aa  409  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00248724 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1606  protein of unknown function UPF0079  47.39 
 
 
529 aa  402  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0383764  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4941  protein of unknown function UPF0079  46.67 
 
 
540 aa  405  1e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.267606 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0383  hypothetical protein  45.44 
 
 
506 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4431  hypothetical protein  46.45 
 
 
549 aa  402  9.999999999999999e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.319947 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0046  hypothetical protein  44.73 
 
 
507 aa  392  1e-108  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.810658  normal  0.280558 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0054  hypothetical protein  45.02 
 
 
507 aa  389  1e-107  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.885213  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4895  protein of unknown function UPF0079  46.56 
 
 
542 aa  385  1e-106  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.582734  normal  0.663902 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0086  hypothetical protein  44.8 
 
 
509 aa  377  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.522913  normal  0.567075 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3297  hypothetical protein  43.98 
 
 
523 aa  376  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.480432 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4542  hypothetical protein  45.62 
 
 
529 aa  370  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0666  protein of unknown function UPF0079  40.93 
 
 
523 aa  354  2e-96  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.469867 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0587  hypothetical protein  43 
 
 
562 aa  352  7e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.977621 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2797  hypothetical protein  35.51 
 
 
472 aa  210  5e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0135  aminoglycoside phosphotransferase  37.54 
 
 
362 aa  209  1e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2299  aminoglycoside phosphotransferase  38.23 
 
 
328 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.45511  normal  0.057046 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3437  aminoglycoside phosphotransferase  35.22 
 
 
360 aa  174  5e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.17769  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0566  aminoglycoside phosphotransferase  36.86 
 
 
358 aa  169  7e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0083  aminoglycoside phosphotransferase  35.38 
 
 
365 aa  161  3e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.972168 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2000  aminoglycoside phosphotransferase  36.28 
 
 
327 aa  159  1e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00692225  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0160  aminoglycoside phosphotransferase  33.72 
 
 
323 aa  157  3e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.549928 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2677  aminoglycoside phosphotransferase  37.83 
 
 
328 aa  154  4e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4850  aminoglycoside phosphotransferase  33.99 
 
 
363 aa  149  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.191997  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0962  aminoglycoside phosphotransferase  34.24 
 
 
340 aa  138  2e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.135258  hitchhiker  0.0017288 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2843  aminoglycoside phosphotransferase  29.74 
 
 
332 aa  138  2e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.569064 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2954  aminoglycoside phosphotransferase  33.64 
 
 
342 aa  137  5e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.290607  normal  0.0281748 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0514  hypothetical protein  32.81 
 
 
352 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0621374 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0405  aminoglycoside phosphotransferase  31.79 
 
 
357 aa  130  7.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0390  aminoglycoside phosphotransferase  31.48 
 
 
357 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0883  aminoglycoside phosphotransferase  26.57 
 
 
345 aa  126  8.000000000000001e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000858674  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0587  aminoglycoside phosphotransferase  31.16 
 
 
348 aa  126  9e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2336  hypothetical protein  30.97 
 
 
330 aa  125  1e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.53813 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4813  aminoglycoside phosphotransferase  30.38 
 
 
333 aa  126  1e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0654401 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1523  hypothetical protein  34.73 
 
 
341 aa  125  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.165776  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0175  aminoglycoside phosphotransferase  34.73 
 
 
341 aa  125  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00583599  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1575  aminoglycoside phosphotransferase  30.24 
 
 
333 aa  125  3e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.775412  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0134  hypothetical protein  54.26 
 
 
164 aa  125  3e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0395  aminoglycoside phosphotransferase  32.36 
 
 
348 aa  124  4e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410154  normal  0.0724183 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0488  protein of unknown function UPF0079  44.44 
 
 
160 aa  124  5e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000100685  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2712  aminoglycoside phosphotransferase  31.65 
 
 
349 aa  124  6e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2100  aminoglycoside phosphotransferase  31.65 
 
 
349 aa  124  6e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4797  aminoglycoside phosphotransferase  32.1 
 
 
339 aa  123  7e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.318668  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2764  aminoglycoside phosphotransferase  30.58 
 
 
349 aa  123  8e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2739  aminoglycoside phosphotransferase  31.65 
 
 
349 aa  123  8e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.868376  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1453  aminoglycoside phosphotransferase  31.43 
 
 
346 aa  122  9.999999999999999e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.355309  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4849  hypothetical protein  49.63 
 
 
150 aa  122  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.366742  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0555  hypothetical protein  30.03 
 
 
341 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6039  aminoglycoside phosphotransferase  30.3 
 
 
349 aa  121  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0436  aminoglycoside phosphotransferase  32.62 
 
 
339 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.196256  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0107  phosphotransferase enzyme family protein  29.64 
 
 
329 aa  120  4.9999999999999996e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0251717  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1753  aminoglycoside phosphotransferase  28.61 
 
 
384 aa  120  4.9999999999999996e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000733825 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4623  aminoglycoside phosphotransferase  30.4 
 
 
340 aa  120  6e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111315  normal  0.973044 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2075  7.5 kDa chlorosome protein  29.64 
 
 
365 aa  120  6e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.978302  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0405  aminoglycoside phosphotransferase  32.62 
 
 
339 aa  120  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0968  aminoglycoside phosphotransferase  26.5 
 
 
334 aa  120  7.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0389824  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0439  aminoglycoside phosphotransferase  32.62 
 
 
339 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0496  aminoglycoside phosphotransferase  30.91 
 
 
344 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0550103  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2630  aminoglycoside phosphotransferase  29.97 
 
 
349 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.280943  normal  0.909879 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0198  aminoglycoside phosphotransferase  31.58 
 
 
336 aa  119  9.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.159421  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0741  hypothetical protein  28.73 
 
 
356 aa  118  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3435  aminoglycoside phosphotransferase  31.92 
 
 
332 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0574  hypothetical protein  32.2 
 
 
401 aa  118  3e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.389503  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0435  aminoglycoside phosphotransferase  29.81 
 
 
348 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.625762  normal  0.267382 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0201  hypothetical protein  31.08 
 
 
350 aa  117  6e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.59437 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0870  phosphotransferase domain-containing protein  32.85 
 
 
401 aa  117  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3660  aminoglycoside phosphotransferase  31.8 
 
 
341 aa  116  7.999999999999999e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0207  hypothetical protein  32.85 
 
 
344 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.585984  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0691  phosphotransferase family protein  32.48 
 
 
344 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0705  phosphotransferase family protein  32.85 
 
 
344 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4025  hypothetical protein  31.48 
 
 
363 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2340  phosphotransferase family protein  32.85 
 
 
344 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.322839  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2738  phosphotransferase family protein  32.85 
 
 
344 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.918677  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2420  phosphotransferase family protein  32.85 
 
 
344 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1871  aminoglycoside phosphotransferase  29.22 
 
 
333 aa  116  1.0000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2781  hypothetical protein  42.75 
 
 
154 aa  115  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3803  putative ATPase  41.56 
 
 
156 aa  114  5e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000296648  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3657  putative ATPase  41.56 
 
 
156 aa  114  5e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000030083  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0703  putative ATPase  41.56 
 
 
156 aa  114  5e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000204367  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3910  aminoglycoside phosphotransferase  29.81 
 
 
393 aa  112  1.0000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4009  aminoglycoside phosphotransferase  29.67 
 
 
341 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2955  hypothetical protein  45.64 
 
 
161 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.263755  normal  0.0249448 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4063  aminoglycoside phosphotransferase  30.7 
 
 
308 aa  111  3e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.106064 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46790  phosphotransferase  31.73 
 
 
340 aa  110  5e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0674  aminoglycoside phosphotransferase  31 
 
 
363 aa  110  6e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3635  phosphotransferase  27.19 
 
 
351 aa  110  7.000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0349  hypothetical protein  28.76 
 
 
325 aa  110  8.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6036  aminoglycoside phosphotransferase  29.65 
 
 
427 aa  109  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4765  aminoglycoside phosphotransferase  29.79 
 
 
372 aa  109  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.476513  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>