136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4850 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_4850  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
363 aa  717    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.191997  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0083  aminoglycoside phosphotransferase  43.09 
 
 
365 aa  243  3.9999999999999997e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.972168 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0086  hypothetical protein  40.45 
 
 
509 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.522913  normal  0.567075 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1606  protein of unknown function UPF0079  40.11 
 
 
529 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0383764  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0493  aminoglycoside phosphotransferase  40.17 
 
 
514 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00248724 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0046  hypothetical protein  36.62 
 
 
507 aa  199  7.999999999999999e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.810658  normal  0.280558 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2954  aminoglycoside phosphotransferase  43.4 
 
 
342 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.290607  normal  0.0281748 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0383  hypothetical protein  37.98 
 
 
506 aa  195  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0054  hypothetical protein  35.59 
 
 
507 aa  194  2e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.885213  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0081  protein of unknown function UPF0079  38.2 
 
 
506 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.428182  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0666  protein of unknown function UPF0079  37.29 
 
 
523 aa  192  6e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.469867 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4941  protein of unknown function UPF0079  38.76 
 
 
540 aa  192  1e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.267606 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3437  aminoglycoside phosphotransferase  38.8 
 
 
360 aa  186  4e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.17769  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0625  hypothetical protein  37.12 
 
 
505 aa  186  4e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00759808  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4542  hypothetical protein  39.23 
 
 
529 aa  186  7e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4895  protein of unknown function UPF0079  37.89 
 
 
542 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.582734  normal  0.663902 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0206  hypothetical protein  37.99 
 
 
505 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0259343  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0135  aminoglycoside phosphotransferase  38.77 
 
 
362 aa  184  2.0000000000000003e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4431  hypothetical protein  37.82 
 
 
549 aa  184  3e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.319947 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2843  aminoglycoside phosphotransferase  36.8 
 
 
332 aa  183  5.0000000000000004e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.569064 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0160  aminoglycoside phosphotransferase  38.27 
 
 
323 aa  182  5.0000000000000004e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.549928 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0566  aminoglycoside phosphotransferase  39.18 
 
 
358 aa  183  5.0000000000000004e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0587  hypothetical protein  37.57 
 
 
562 aa  181  2e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.977621 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0175  aminoglycoside phosphotransferase  43.77 
 
 
341 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00583599  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1523  hypothetical protein  42.9 
 
 
341 aa  170  3e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.165776  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2677  aminoglycoside phosphotransferase  37.92 
 
 
328 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2000  aminoglycoside phosphotransferase  35.69 
 
 
327 aa  166  5e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00692225  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3297  hypothetical protein  34.79 
 
 
523 aa  166  9e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.480432 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3578  hypothetical protein  33.91 
 
 
498 aa  162  9e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.303943  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3245  hypothetical protein  32.37 
 
 
504 aa  159  5e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.479121  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0051  hypothetical protein  34.46 
 
 
502 aa  155  7e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4289  protein of unknown function UPF0079  32.87 
 
 
505 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0623599  normal  0.680884 
 
 
-
 
NC_004310  BR2100  hypothetical protein  33.99 
 
 
513 aa  149  8e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2017  hypothetical protein  33.71 
 
 
513 aa  145  7.0000000000000006e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1355  P-loop hydrolase/phosphotransferase  29.23 
 
 
497 aa  144  2e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3962  protein of unknown function UPF0079  30.68 
 
 
503 aa  142  7e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2299  aminoglycoside phosphotransferase  33.94 
 
 
328 aa  140  4.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.45511  normal  0.057046 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4063  aminoglycoside phosphotransferase  35.9 
 
 
308 aa  138  2e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.106064 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2797  hypothetical protein  36.94 
 
 
472 aa  137  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0820  hypothetical protein  31.84 
 
 
509 aa  135  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3435  aminoglycoside phosphotransferase  34.88 
 
 
332 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3705  aminoglycoside phosphotransferase  30.72 
 
 
348 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3845  aminoglycoside phosphotransferase  31.01 
 
 
348 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3762  aminoglycoside phosphotransferase  30.55 
 
 
348 aa  97.1  4e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0962  aminoglycoside phosphotransferase  30.17 
 
 
340 aa  89.7  8e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.135258  hitchhiker  0.0017288 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1019  aminoglycoside phosphotransferase  31.58 
 
 
341 aa  88.6  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0555  hypothetical protein  30.03 
 
 
341 aa  85.9  9e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07780  hypothetical protein  28.19 
 
 
338 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0103434 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0740  hypothetical protein  28.19 
 
 
338 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.565611  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0296  aminoglycoside phosphotransferase  26.82 
 
 
338 aa  84.3  0.000000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.000010357  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0201  hypothetical protein  31.96 
 
 
350 aa  83.6  0.000000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.59437 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4623  aminoglycoside phosphotransferase  28.57 
 
 
340 aa  82.8  0.000000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111315  normal  0.973044 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5131  aminoglycoside phosphotransferase  26.71 
 
 
339 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.552611  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3847  aminoglycoside phosphotransferase  28.2 
 
 
347 aa  81.3  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.899944  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0435  aminoglycoside phosphotransferase  28 
 
 
348 aa  79  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.625762  normal  0.267382 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0496  aminoglycoside phosphotransferase  28.4 
 
 
344 aa  77.8  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0550103  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1753  aminoglycoside phosphotransferase  25.51 
 
 
384 aa  77.8  0.0000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000733825 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0099  aminoglycoside phosphotransferase  29.66 
 
 
362 aa  75.5  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2072  aminoglycoside phosphotransferase  23.78 
 
 
312 aa  75.1  0.000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0916  aminoglycoside phosphotransferase  27.45 
 
 
344 aa  74.7  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.318568  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2355  aminoglycoside phosphotransferase  25.95 
 
 
358 aa  73.9  0.000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3033  phosphotransferase, putative  27.75 
 
 
342 aa  73.2  0.000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.394035  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2642  aminoglycoside phosphotransferase  27.75 
 
 
342 aa  73.2  0.000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.365504  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46790  phosphotransferase  26.96 
 
 
340 aa  72.8  0.000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1518  hypothetical protein  26.36 
 
 
379 aa  72.4  0.00000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.422445 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1453  aminoglycoside phosphotransferase  27.36 
 
 
346 aa  72  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.355309  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2075  7.5 kDa chlorosome protein  26.3 
 
 
365 aa  72.4  0.00000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.978302  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0107  phosphotransferase enzyme family protein  26.3 
 
 
329 aa  72.4  0.00000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0251717  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1871  aminoglycoside phosphotransferase  27.05 
 
 
333 aa  72  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0741  hypothetical protein  25.34 
 
 
356 aa  70.9  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2148  aminoglycoside phosphotransferase  26.99 
 
 
331 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4797  aminoglycoside phosphotransferase  26.88 
 
 
339 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.318668  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3635  phosphotransferase  26.36 
 
 
351 aa  70.1  0.00000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1697  aminoglycoside phosphotransferase  27.71 
 
 
379 aa  69.7  0.00000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.579927  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0405  aminoglycoside phosphotransferase  27.33 
 
 
339 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2432  aminoglycoside phosphotransferase  29.39 
 
 
323 aa  68.9  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3511  aminoglycoside phosphotransferase  28.93 
 
 
346 aa  69.3  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4077  aminoglycoside phosphotransferase  29.85 
 
 
360 aa  69.3  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.349729  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0883  aminoglycoside phosphotransferase  26.33 
 
 
345 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000858674  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0439  aminoglycoside phosphotransferase  27.33 
 
 
339 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1575  aminoglycoside phosphotransferase  27.35 
 
 
333 aa  67.8  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.775412  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0968  aminoglycoside phosphotransferase  24.57 
 
 
334 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0389824  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4864  aminoglycoside phosphotransferase  28.06 
 
 
388 aa  67.4  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.430535 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0600  hypothetical protein  26.88 
 
 
341 aa  67  0.0000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2336  hypothetical protein  27.04 
 
 
330 aa  67  0.0000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.53813 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0436  aminoglycoside phosphotransferase  27.73 
 
 
339 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.196256  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0198  aminoglycoside phosphotransferase  27.24 
 
 
336 aa  66.6  0.0000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.159421  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4009  aminoglycoside phosphotransferase  26.87 
 
 
341 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1018  aminoglycoside phosphotransferase  25.07 
 
 
334 aa  65.9  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.264433  normal  0.0137892 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0514  hypothetical protein  29.27 
 
 
352 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0621374 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0909  aminoglycoside phosphotransferase  26.29 
 
 
363 aa  64.7  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00179002  normal  0.193933 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1083  aminoglycoside phosphotransferase  25.91 
 
 
361 aa  64.7  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0965455  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1653  aminoglycoside phosphotransferase  25.86 
 
 
340 aa  63.9  0.000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0126  aminoglycoside phosphotransferase  25.5 
 
 
344 aa  63.9  0.000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3910  aminoglycoside phosphotransferase  27.5 
 
 
393 aa  63.2  0.000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0235  aminoglycoside phosphotransferase  21.6 
 
 
333 aa  62.8  0.000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0993  aminoglycoside phosphotransferase  25.3 
 
 
359 aa  62.8  0.000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1645  aminoglycoside phosphotransferase  28.57 
 
 
368 aa  62.4  0.00000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.260839  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4813  aminoglycoside phosphotransferase  29.24 
 
 
333 aa  62.4  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0654401 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0532  aminoglycoside phosphotransferase  24 
 
 
360 aa  60.8  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.824059  normal  0.703155 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>