More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_0022 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_0022  recombination protein RecR  100 
 
 
198 aa  407  1e-113  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0025  recombination protein RecR  100 
 
 
198 aa  407  1e-113  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0026  recombination protein RecR  100 
 
 
198 aa  407  1e-113  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000213644  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0021  recombination protein RecR  100 
 
 
198 aa  407  1e-113  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0021  recombination protein RecR  100 
 
 
198 aa  407  1e-113  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00242068  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5292  recombination protein RecR  100 
 
 
198 aa  407  1e-113  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000931615  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0028  recombination protein RecR  100 
 
 
198 aa  407  1e-113  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  2.12912e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0023  recombination protein RecR  99.49 
 
 
198 aa  404  1e-112  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0021  recombination protein RecR  99.49 
 
 
198 aa  404  1e-112  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.134692  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0020  recombination protein RecR  98.48 
 
 
198 aa  402  1e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00591739  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0020  recombination protein RecR  96.97 
 
 
198 aa  396  1e-109  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.153698  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0021  recombination protein RecR  85.35 
 
 
198 aa  355  3e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  7.3919e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0018  recombination protein RecR  82.83 
 
 
198 aa  345  3e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0116  recombination protein RecR  76.77 
 
 
198 aa  325  3e-88  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0501  recombination protein RecR  76.77 
 
 
198 aa  324  4e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00457535  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0514  recombination protein RecR  76.77 
 
 
198 aa  324  4e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0108  recombination protein RecR  68.56 
 
 
199 aa  286  1e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2142  recombination protein RecR  65.31 
 
 
199 aa  277  6e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  2.88624e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0386  recombination protein RecR  62.12 
 
 
198 aa  273  9e-73  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.147094  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0277  recombination protein RecR  62.69 
 
 
213 aa  271  4e-72  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0766  recombination protein RecR  64.65 
 
 
198 aa  271  6e-72  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.290455  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0663  recombination protein RecR  63.13 
 
 
198 aa  270  1e-71  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0143934  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0244  recombination protein RecR  61.42 
 
 
199 aa  268  5e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  7.16421e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0035  recombination protein RecR  62.44 
 
 
199 aa  267  6e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  3.23966e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20770  recombination protein RecR  61.42 
 
 
198 aa  263  1e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  2.21986e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0328  recombination protein RecR  61.31 
 
 
200 aa  262  2e-69  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0029  DNA replication and repair protein RecR  58.08 
 
 
199 aa  259  2e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.157728  hitchhiker  9.15246e-06 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0094  recombination protein RecR  59.09 
 
 
199 aa  258  6e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.427132  hitchhiker  3.95528e-06 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0044  recombination protein RecR  60.41 
 
 
200 aa  256  1e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0424851  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0370  recombination protein RecR  57.79 
 
 
199 aa  255  4e-67  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  1.33419e-05 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0057  recombination protein RecR  61.14 
 
 
198 aa  251  5e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0054  recombination protein RecR  61.14 
 
 
198 aa  251  5e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0052  recombination protein RecR  56.57 
 
 
198 aa  248  3e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.1836e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0017  DNA replication and repair protein RecR  53.81 
 
 
199 aa  244  5e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1144  recombination protein RecR  58.85 
 
 
201 aa  243  2e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0987935  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2015  recombination protein RecR  57.14 
 
 
199 aa  241  6e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.38119  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1288  recombination protein RecR  54.82 
 
 
200 aa  240  9e-63  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4814  recombination protein RecR  55.61 
 
 
199 aa  240  1e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0044  recombination protein RecR  56.7 
 
 
199 aa  239  2e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.118922  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3530  recombination protein RecR  57.22 
 
 
199 aa  238  6e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.188089  normal  0.594809 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3924  recombination protein RecR  55.9 
 
 
204 aa  237  7e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00096202  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1409  recombination protein RecR  54.23 
 
 
201 aa  236  1e-61  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.468928  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0127  recombination protein RecR  55.61 
 
 
202 aa  236  1e-61  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2128  recombination protein RecR  52.53 
 
 
198 aa  236  2e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.505322  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4871  recombination protein RecR  57.22 
 
 
199 aa  234  4e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02640  DNA replication and repair protein RecR  56.19 
 
 
199 aa  234  4e-61  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.437188  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0033  recombination protein RecR  51.01 
 
 
198 aa  233  9e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00162242  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1973  recombination protein RecR  53.57 
 
 
199 aa  231  4e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.181253  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0554  recombination protein RecR  53.09 
 
 
199 aa  231  4e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.407032  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0415  recombination protein RecR  53.09 
 
 
199 aa  230  9e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.594093  normal  0.973959 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0465  recombination protein RecR  54.59 
 
 
199 aa  229  1e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.286719  normal  0.22081 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9313  recombination protein RecR  55.67 
 
 
199 aa  229  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.430471  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0693  recombination protein RecR  53.61 
 
 
199 aa  229  1e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9027  recombination protein RecR  54.59 
 
 
199 aa  230  1e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0272  recombination protein RecR  54.08 
 
 
202 aa  229  2e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0593  recombination protein RecR  54.08 
 
 
199 aa  228  4e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04720  DNA replication and repair protein RecR  53.06 
 
 
199 aa  228  5e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.41163  normal  0.431257 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25940  DNA replication and repair protein RecR  54.59 
 
 
204 aa  227  7e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3124  recombination protein RecR  54.08 
 
 
199 aa  226  2e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0192329  hitchhiker  1.15295e-05 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4182  recombination protein RecR  53.5 
 
 
205 aa  226  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.406178  normal  0.562882 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1513  recombination protein RecR  56.06 
 
 
222 aa  226  2e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0279848  normal  0.919824 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3635  recombination protein RecR  52.02 
 
 
198 aa  224  7e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0682949  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0605  recombination protein RecR  52.04 
 
 
198 aa  224  7e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.813504 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0048  recombination protein RecR  55.15 
 
 
198 aa  222  2e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0319  recombination protein RecR  54.12 
 
 
199 aa  222  2e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.697787  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0549  recombination protein RecR  51.53 
 
 
199 aa  222  2e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.650198 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0297  recombination protein RecR  53.09 
 
 
199 aa  222  3e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3693  recombination protein RecR  51.52 
 
 
198 aa  222  3e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3776  recombination protein RecR  51.52 
 
 
198 aa  222  4e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0326868  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02350  DNA replication and repair protein RecR  48.98 
 
 
198 aa  221  4e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  2.24797e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0376  recombination protein RecR  48.99 
 
 
199 aa  221  6e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.59909e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0557  recombination protein RecR  52.63 
 
 
204 aa  221  7e-57  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1180  recombination protein RecR  53.06 
 
 
197 aa  221  7e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0259  recombination protein RecR  52.08 
 
 
200 aa  220  9e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0583  recombination protein RecR  53.16 
 
 
204 aa  220  9e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.395417  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1207  recombination protein RecR  53.06 
 
 
197 aa  220  9e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.262054  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0117  recombination protein RecR  52.08 
 
 
203 aa  220  1e-56  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  4.71102e-06  normal  0.0497522 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0673  recombination protein RecR  53.81 
 
 
202 aa  220  1e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0479  recombination protein RecR  50.51 
 
 
199 aa  219  2e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.0004265  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_522  recombination protein  52.11 
 
 
204 aa  218  3e-56  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0417916  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01600  DNA replication and repair protein RecR  50.51 
 
 
198 aa  218  3e-56  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  5.3602e-05 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0215  recombination protein RecR  53.06 
 
 
197 aa  218  5e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6148  recombination protein RecR  50 
 
 
199 aa  218  5e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.625631  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0268  recombination protein RecR  52.55 
 
 
199 aa  217  7e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1284  recombination protein RecR  52.45 
 
 
204 aa  217  9e-56  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.722454  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0883  recombination protein RecR  54.12 
 
 
204 aa  216  1e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  2.54341e-08  normal  0.0456333 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0876  recombination protein RecR  54.04 
 
 
205 aa  215  3e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.236208  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2253  recombination protein RecR  54.59 
 
 
185 aa  215  3e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00314078  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2610  recombination protein RecR  48.58 
 
 
215 aa  215  3e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28430  DNA replication and repair protein RecR  51.53 
 
 
197 aa  215  4e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0254  recombination protein RecR  51.53 
 
 
197 aa  214  5e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.136191  hitchhiker  0.0016505 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3680  recombination protein RecR  53.44 
 
 
189 aa  214  8e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2291  recombination protein RecR  52.31 
 
 
205 aa  213  1e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.967474  normal  0.0406195 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3201  recombination protein RecR  52.85 
 
 
205 aa  213  2e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  1.36854e-07  normal  0.489368 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11881  recombination protein RecR  49.22 
 
 
199 aa  212  3e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1369  recombination protein RecR  53.06 
 
 
211 aa  212  3e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12031  recombination protein RecR  48.48 
 
 
199 aa  212  3e-54  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6566  recombination protein RecR  50.51 
 
 
199 aa  212  3e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00960042  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1108  recombination protein RecR  48.99 
 
 
199 aa  211  4e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.425444  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14831  RecR protein  53.85 
 
 
182 aa  211  5e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.409588 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>