More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7421 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_3679  heavy metal translocating P-type ATPase  49.87 
 
 
709 aa  666  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.170843  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3978  heavy metal translocating P-type ATPase  68.1 
 
 
759 aa  900  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.39503  normal  0.602002 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1151  heavy metal translocating P-type ATPase  52.93 
 
 
904 aa  732  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0071597  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5561  P type cation (metal) transporter ATPase component  62.07 
 
 
757 aa  842  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.85793  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4129  heavy metal translocating P-type ATPase  63.49 
 
 
955 aa  879  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.594841  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3134  heavy metal translocating P-type ATPase  50.6 
 
 
712 aa  682  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1096  heavy metal translocating P-type ATPase  53.02 
 
 
731 aa  670  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2581  heavy metal translocating P-type ATPase  52.2 
 
 
793 aa  706  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3501  heavy metal translocating P-type ATPase  76.71 
 
 
758 aa  897  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.968413 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1791  heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase  52.2 
 
 
740 aa  680  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1505  heavy metal translocating P-type ATPase  68.83 
 
 
716 aa  964  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.724781  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4071  heavy metal translocating P-type ATPase  62.55 
 
 
712 aa  835  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.515155 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1347  heavy metal translocating P-type ATPase  48.5 
 
 
738 aa  689  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.174649 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1027  (Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase  56.18 
 
 
777 aa  689  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3727  heavy metal translocating P-type ATPase  50.07 
 
 
711 aa  660  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2849  heavy metal translocating P-type ATPase  60.61 
 
 
734 aa  840  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4117  heavy metal translocating P-type ATPase  53.09 
 
 
731 aa  672  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.194383  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3643  heavy metal translocating P-type ATPase  68.97 
 
 
726 aa  973  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.545825 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3338  heavy metal translocating P-type ATPase  68.15 
 
 
759 aa  900  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.837764  normal  0.51996 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4535  heavy metal translocating P-type ATPase  66.67 
 
 
734 aa  938  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1627  heavy metal translocating P-type ATPase  52.09 
 
 
718 aa  683  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1942  cadmium-translocating P-type ATPase  72.2 
 
 
704 aa  841  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7421  lead, cadmium, zinc and mercury-transporting ATPase  100 
 
 
764 aa  1514  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.396456 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3411  hypothetical protein  51.66 
 
 
803 aa  655  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7259  lead, cadmium, zinc and mercury-transporting ATPase  74.81 
 
 
678 aa  934  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.482594 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3336  heavy metal translocating P-type ATPase  68.52 
 
 
744 aa  956  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.812406 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0921  heavy metal translocating P-type ATPase  66.31 
 
 
844 aa  914  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0438  heavy metal translocating P-type ATPase  52.34 
 
 
740 aa  686  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2018  cadmium-translocating P-type ATPase  72.68 
 
 
814 aa  851  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3208  heavy metal translocating P-type ATPase  50.6 
 
 
720 aa  692  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3796  heavy metal translocating P-type ATPase  69.57 
 
 
756 aa  961  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.304079  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0212  heavy metal translocating P-type ATPase  50.59 
 
 
758 aa  676  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2344  heavy metal translocating P-type ATPase  51.57 
 
 
732 aa  632  1e-180  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.442895  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0269  heavy metal translocating P-type ATPase  48.54 
 
 
713 aa  635  1e-180  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3467  heavy metal translocating P-type ATPase  54.96 
 
 
634 aa  629  1e-179  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2752  heavy metal translocating P-type ATPase  50.8 
 
 
722 aa  624  1e-177  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004007  copper-translocating P-type ATPase  42.86 
 
 
768 aa  578  1e-163  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2067  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  43.09 
 
 
773 aa  572  1e-161  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0551  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  44.33 
 
 
768 aa  555  1e-156  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1611  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  44.07 
 
 
803 aa  554  1e-156  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.730441  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01515  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  48.28 
 
 
689 aa  553  1e-156  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0093  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  50.34 
 
 
787 aa  534  1e-150  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0088  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  49.23 
 
 
784 aa  530  1e-149  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.473574  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0209  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  48.84 
 
 
771 aa  524  1e-147  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0277781 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3873  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  50.86 
 
 
728 aa  516  1e-145  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0472181  normal  0.24383 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03318  zinc, cobalt and lead efflux system  43.95 
 
 
732 aa  510  1e-143  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03271  hypothetical protein  43.95 
 
 
732 aa  510  1e-143  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3948  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  44.46 
 
 
732 aa  508  1e-142  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3951  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  43.68 
 
 
732 aa  506  1e-142  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3888  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  44.25 
 
 
732 aa  508  1e-142  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4789  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  43.68 
 
 
732 aa  506  1e-142  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3778  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  44.12 
 
 
732 aa  506  1e-142  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0247  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  43.68 
 
 
732 aa  508  1e-142  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3845  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  44.79 
 
 
732 aa  508  1e-142  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1718  heavy metal translocating P-type ATPase  42.97 
 
 
712 aa  503  1e-141  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3768  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  43.62 
 
 
732 aa  504  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3668  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  43.55 
 
 
732 aa  504  1e-141  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1138  heavy metal translocating P-type ATPase  42.97 
 
 
712 aa  502  1e-141  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0549  heavy metal translocating P-type ATPase  43.29 
 
 
712 aa  502  1e-140  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3853  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  43.42 
 
 
732 aa  502  1e-140  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3752  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  49.04 
 
 
732 aa  494  1e-138  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0246  heavy metal translocating P-type ATPase  48.33 
 
 
732 aa  490  1e-137  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1690  heavy metal translocating P-type ATPase  38.72 
 
 
767 aa  492  1e-137  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1257  cation transporter E1-E2 family ATPase  42.58 
 
 
709 aa  490  1e-137  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0571  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  49.4 
 
 
782 aa  488  1e-136  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3985  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  49.57 
 
 
782 aa  489  1e-136  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1548  heavy metal translocating P-type ATPase  46.54 
 
 
707 aa  485  1e-135  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1527  heavy metal translocating P-type ATPase  38.39 
 
 
783 aa  484  1e-135  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00585098  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2147  cadmium-translocating P-type ATPase  39.31 
 
 
713 aa  481  1e-134  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0233  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  49.07 
 
 
788 aa  481  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4451  heavy metal translocating P-type ATPase  44.1 
 
 
673 aa  469  1e-131  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1643  heavy metal translocating P-type ATPase  36.73 
 
 
800 aa  456  1e-127  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.960315  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1815  heavy metal translocating P-type ATPase  37.68 
 
 
800 aa  457  1e-127  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.451181 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4212  heavy metal translocating P-type ATPase  39.87 
 
 
1022 aa  456  1e-127  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5352  heavy metal translocating P-type ATPase  37.61 
 
 
799 aa  457  1e-127  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448816  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5284  heavy metal translocating P-type ATPase  36.73 
 
 
800 aa  456  1e-127  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.225774  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3773  heavy metal translocating P-type ATPase  40.16 
 
 
737 aa  454  1e-126  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.364819  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2450  heavy metal translocating P-type ATPase  40.2 
 
 
738 aa  453  1e-126  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0805426  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2698  heavy metal translocating P-type ATPase  44.3 
 
 
734 aa  455  1e-126  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.810739 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5012  heavy metal translocating P-type ATPase  38.03 
 
 
750 aa  451  1e-125  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.530784  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2204  heavy metal translocating P-type ATPase  36.98 
 
 
833 aa  452  1e-125  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.149675  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5192  heavy metal translocating P-type ATPase  38.29 
 
 
750 aa  450  1e-125  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3390  heavy metal translocating P-type ATPase  44.72 
 
 
984 aa  447  1e-124  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0773629 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2303  heavy metal translocating P-type ATPase  44.72 
 
 
984 aa  447  1e-124  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0230591  hitchhiker  0.00032078 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5139  heavy metal translocating P-type ATPase  37.89 
 
 
750 aa  448  1e-124  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.921896  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1448  cadmium-translocating P-type ATPase  38.79 
 
 
748 aa  447  1e-124  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2242  heavy metal translocating P-type ATPase  43.19 
 
 
750 aa  442  1e-123  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00781921 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0854  heavy metal translocating P-type ATPase  44.88 
 
 
812 aa  443  1e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0026  heavy metal translocating P-type ATPase  44.97 
 
 
701 aa  440  1e-122  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.260901  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3683  heavy metal translocating P-type ATPase  36.3 
 
 
791 aa  440  1e-122  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00270096  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1677  heavy metal translocating P-type ATPase  37.02 
 
 
726 aa  437  1e-121  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16660  putative metal-transporting P-type ATPase  37.99 
 
 
742 aa  437  1e-121  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2103  heavy metal translocating P-type ATPase  44.11 
 
 
800 aa  435  1e-120  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1465  heavy metal translocating P-type ATPase  36.37 
 
 
825 aa  433  1e-120  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.338501  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0326  heavy metal translocating P-type ATPase  43.23 
 
 
750 aa  433  1e-120  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.451186  normal  0.576346 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2390  heavy metal translocating P-type ATPase  44.11 
 
 
800 aa  435  1e-120  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0451824  normal  0.128679 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0479  heavy metal translocating P-type ATPase  43.65 
 
 
939 aa  429  1e-119  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1125  Cd/Co/Hg/Pb/Zn-translocating P-type ATPase  36.93 
 
 
751 aa  429  1e-119  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.228678  normal  0.104561 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18520  heavy metal translocating P-type ATPase  44.78 
 
 
712 aa  429  1e-119  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2691  heavy metal translocating P-type ATPase  39.4 
 
 
677 aa  432  1e-119  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000392572  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>