193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4629 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_4629  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 
187 aa  374  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00782953  normal  0.030329 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2652  MerR family transcriptional regulator  51.09 
 
 
227 aa  206  1e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  hitchhiker  0.00282985  normal  0.0609514 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2688  regulatory protein, MerR  82.88 
 
 
229 aa  198  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.539161  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1588  MerR family transcriptional regulator  57.36 
 
 
195 aa  197  9e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3022  transcriptional regulator, MerR family  81.58 
 
 
250 aa  196  2e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.165787  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1409  MerR family transcriptional regulator  56.5 
 
 
206 aa  193  9e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.783915  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2678  MerR family transcriptional regulator  89.13 
 
 
252 aa  177  8e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00961924  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0650  transcriptional regulator, MerR family  47.59 
 
 
172 aa  169  2e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00809015 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0831  MerR family transcriptional regulator  50.54 
 
 
177 aa  160  8e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.087298  normal  0.0939438 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1633  hypothetical protein  46.11 
 
 
181 aa  159  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1199  transcriptional regulator, MerR family  48.69 
 
 
179 aa  156  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1288  transcriptional regulator, MerR family  46.77 
 
 
179 aa  152  3e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.287887  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7073  transcriptional regulator, MerR family  75.86 
 
 
172 aa  150  7e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.323694  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2516  MerR family transcriptional regulator  46.35 
 
 
179 aa  148  4e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0640  MerR family transcriptional regulator  46.99 
 
 
168 aa  148  5e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1148  MerR family transcriptional regulator  47.54 
 
 
169 aa  147  1e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0772  hypothetical protein  73.33 
 
 
193 aa  146  2e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.640197  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6232  MerR family transcriptional regulator  44.74 
 
 
166 aa  146  2e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4387  MerR family transcriptional regulator  75.58 
 
 
757 aa  145  5e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0779  hypothetical protein  72.22 
 
 
180 aa  144  7e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2925  MerR family transcriptional regulator  68.42 
 
 
155 aa  144  8e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00455933  hitchhiker  0.00151967 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2056  regulatory protein MerR  65.59 
 
 
165 aa  139  2e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.880106  normal  0.300945 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2331  transcriptional regulator, MerR family  43.58 
 
 
160 aa  139  2e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.461102 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2017  transcriptional regulator, MerR family  43.58 
 
 
165 aa  139  3e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3966  MerR family transcriptional regulator  44.75 
 
 
167 aa  139  3e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.200799  normal  0.0248998 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3031  MerR family transcriptional regulator  54.62 
 
 
142 aa  135  4e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.532106 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2610  MerR family transcriptional regulator  60.71 
 
 
281 aa  135  4e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1268  MerR family transcriptional regulator  60.71 
 
 
272 aa  135  4e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.194356 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1914  MerR family transcriptional regulator  62.24 
 
 
282 aa  134  1e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.346124  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0912  MerR family transcriptional regulator  62.5 
 
 
840 aa  131  5e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3295  transcriptional regulator, MerR family  65.59 
 
 
231 aa  131  6e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.987974  normal  0.206317 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1669  MerR family transcriptional regulator  70.73 
 
 
241 aa  131  6e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1722  hypothetical protein  52.8 
 
 
245 aa  130  1e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.22489 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3377  MerR family transcriptional regulator  40.87 
 
 
208 aa  129  3e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.680996  normal  0.153202 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1521  MerR family transcriptional regulator  61.11 
 
 
150 aa  125  3e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0401274  normal  0.779885 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0267  MerR family transcriptional regulator  71.79 
 
 
196 aa  121  5e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1782  MerR family transcriptional regulator  55.68 
 
 
266 aa  113  2e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.139972 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2364  MerR family transcriptional regulator  45.16 
 
 
151 aa  104  8e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3558  MerR family transcriptional regulator  57.14 
 
 
136 aa  103  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.994671 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1864  MerR family transcriptional regulator  51.32 
 
 
201 aa  93.2  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0288491  normal  0.532094 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1416  MerR family transcriptional regulator  46.84 
 
 
130 aa  85.1  5e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0849625  normal  0.242004 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0108  MerR family transcriptional regulator  44.66 
 
 
124 aa  83.6  1e-15  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0163  MerR family transcriptional regulator  54.79 
 
 
126 aa  83.6  2e-15  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3096  MerR family transcriptional regulator  45.16 
 
 
140 aa  81.3  8e-15  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0714876 
 
 
-
 
NC_002978  WD0058  hypothetical protein  56.72 
 
 
108 aa  80.5  1e-14  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1471  transcriptional regulator domain-containing protein  47.56 
 
 
126 aa  79.3  3e-14  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.22835  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1408  transcriptional regulator, MerR family  47.56 
 
 
126 aa  79.3  3e-14  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00332069  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2847  MerR family transcriptional regulator  49.3 
 
 
162 aa  79.3  3e-14  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.786709  hitchhiker  0.005225 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01390  transcription regulator protein  43.75 
 
 
118 aa  79.3  3e-14  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.249906  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4609  MerR family transcriptional regulator  49.3 
 
 
136 aa  78.6  5e-14  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.401376  normal  0.0601167 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3018  transcriptional regulator, MerR family  46.67 
 
 
126 aa  78.6  5e-14  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.438934  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1996  MerR family transcriptional regulator  43.14 
 
 
141 aa  78.6  5e-14  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  1.81748e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1551  MerR family transcriptional regulator  43.53 
 
 
132 aa  78.2  6e-14  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.724017  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2852  MerR family transcriptional regulator  45.63 
 
 
130 aa  78.2  6e-14  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.164617  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3922  MerR family transcriptional regulator  47.83 
 
 
144 aa  78.2  7e-14  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.856583  normal  0.167239 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1881  putative transcriptional regulator  48 
 
 
157 aa  77.8  9e-14  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.027165 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1640  transcriptional regulator, MerR family  40.18 
 
 
143 aa  77.4  1e-13  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.402978  normal  0.373133 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2670  regulatory protein, MerR  45.12 
 
 
125 aa  77  1e-13  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.988026 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1147  MerR family transcriptional regulator  49.28 
 
 
118 aa  77.4  1e-13  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0571667  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1455  transcriptional regulator, MerR family  38.58 
 
 
142 aa  77.4  1e-13  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2393  MerR family transcriptional regulator  38.58 
 
 
142 aa  77.4  1e-13  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.161279  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2092  MerR family transcriptional regulator  48.68 
 
 
118 aa  76.6  2e-13  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.681298  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1378  MerR family transcriptional regulator  46.58 
 
 
137 aa  76.6  2e-13  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0815083  normal  0.541754 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1167  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
144 aa  77  2e-13  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.354578  normal  0.670626 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2607  transcriptional regulator, MerR family  46.91 
 
 
150 aa  75.9  3e-13  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1425  transcriptional regulator  44.16 
 
 
116 aa  75.9  3e-13  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.04332e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1014  MerR family transcriptional regulator  42.7 
 
 
121 aa  76.3  3e-13  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00986669 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2236  transcriptional regulator, MerR family  46.91 
 
 
150 aa  75.9  3e-13  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.039823 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1313  transcriptional regulator, MerR family  47.83 
 
 
173 aa  75.9  3e-13  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2013  MerR family transcriptional regulator  53.03 
 
 
120 aa  75.9  3e-13  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.065719  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1752  MerR family transcriptional regulator  42.68 
 
 
161 aa  75.9  3e-13  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0206721 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1970  transcriptional regulator, MerR family  38.39 
 
 
143 aa  75.9  3e-13  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.858434  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0761  MerR family transcriptional regulator  48 
 
 
118 aa  75.5  4e-13  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0874748  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1877  transcriptional regulator, MerR family  33.71 
 
 
159 aa  75.5  4e-13  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1282  MerR family transcriptional regulator  42.39 
 
 
143 aa  75.5  4e-13  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0919  transcriptional regulator, MerR family  50.72 
 
 
118 aa  75.1  5e-13  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2109  MerR family transcriptional regulator  46.48 
 
 
159 aa  75.1  6e-13  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.208629  normal  0.127157 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2054  MerR family transcriptional regulator  48 
 
 
121 aa  75.1  6e-13  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1406  MerR family transcriptional regulator  41.84 
 
 
137 aa  74.7  7e-13  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0434  MerR family transcriptional regulator  50.72 
 
 
120 aa  74.7  8e-13  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2798  transcriptional regulator, MerR family  50 
 
 
118 aa  73.6  1e-12  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0978  transcriptional regulator, MerR family  43.37 
 
 
254 aa  73.9  1e-12  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.114884 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1482  MerR family transcriptional regulator  45.21 
 
 
137 aa  73.2  2e-12  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.858746  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1366  MerR family transcriptional regulator  40.82 
 
 
137 aa  73.2  2e-12  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1584  putative transcription regulator protein  48 
 
 
146 aa  73.2  2e-12  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1772  MerR family transcriptional regulator  45.21 
 
 
136 aa  73.2  2e-12  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.328935  normal  0.318397 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0836  MerR family transcriptional regulator  49.3 
 
 
116 aa  73.2  2e-12  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1000  MerR family transcriptional regulator  45.21 
 
 
137 aa  73.2  2e-12  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.861508  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1584  MerR family transcriptional regulator  39.18 
 
 
118 aa  73.2  2e-12  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1343  MerR family transcriptional regulator  45.07 
 
 
149 aa  73.6  2e-12  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0494  MerR family transcriptional regulator  42.35 
 
 
121 aa  73.2  2e-12  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0739492  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1459  MerR family transcriptional regulator  45.21 
 
 
137 aa  73.2  2e-12  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.323541  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1719  MerR family transcriptional regulator  45.21 
 
 
134 aa  72.8  3e-12  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1532  MerR family transcriptional regulator  46.38 
 
 
134 aa  72.4  4e-12  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.591284  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1089  MerR family transcriptional regulator  46.38 
 
 
134 aa  72.4  4e-12  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1742  MerR family transcriptional regulator  46.38 
 
 
134 aa  72.4  4e-12  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.405254  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1898  MerR family regulatory protein  46.38 
 
 
134 aa  72.4  4e-12  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0196  MerR family transcriptional regulator  46.38 
 
 
134 aa  72.4  4e-12  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.196176  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2588  MerR family transcriptional regulator  46.38 
 
 
134 aa  72.4  4e-12  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4622  MerR family transcriptional regulator  46.38 
 
 
137 aa  72  5e-12  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.206932  normal  0.899334 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>