30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_52020 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_52020  permease protein of ABC transporter  100 
 
 		 407 aa  786    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0465  protein of unknown function DUF214  57.25 
 
 		 410 aa  457  1e-127  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4234  hypothetical protein  58.13 
 
 		 410 aa  457  1e-127  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.496459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2627  hypothetical protein  56.64 
 
 		 407 aa  391  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.124636  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2876  ABC transporter, permease protein, putative  55.89 
 
 		 407 aa  379  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0331107  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1840  hypothetical protein  41.96 
 
 		 408 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2311  hypothetical protein  39.4 
 
 		 397 aa  206  7e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23479  hitchhiker  0.0000274996 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00850  hypothetical protein  40.6 
 
 		 399 aa  195  1e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0095739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0143  hypothetical protein  41.1 
 
 		 399 aa  193  4e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.24235  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1318  protein of unknown function DUF214  33.89 
 
 		 427 aa  181  2e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3149  hypothetical protein  32.6 
 
 		 410 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.750768  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3221  protein of unknown function DUF214  34.56 
 
 		 395 aa  151  2e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.612368  normal  0.761835 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3869  hypothetical protein  33.42 
 
 		 396 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.000457394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4057  hypothetical protein  33.24 
 
 		 399 aa  140  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.058101  normal  0.267304 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3421  ABC transporter related  36.15 
 
 		 396 aa  139  8.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.952582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3132  hypothetical protein  33.85 
 
 		 396 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0592357  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1668  protein of unknown function DUF214  38.16 
 
 		 609 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0902  protein of unknown function DUF214  34.4 
 
 		 399 aa  119  7e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.082954  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1002  protein of unknown function DUF214  27.62 
 
 		 700 aa  73.2  0.000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.95364  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2119  protein of unknown function DUF214  29.27 
 
 		 873 aa  51.2  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.5367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2105  protein of unknown function DUF214  27.51 
 
 		 462 aa  51.2  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00482864  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0067  hypothetical protein  26.39 
 
 		 488 aa  49.3  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003992  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolC  26.42 
 
 		 374 aa  47  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01530  hypothetical protein  24.92 
 
 		 374 aa  46.6  0.0008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2175  hypothetical protein  26.83 
 
 		 414 aa  46.2  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1607  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26.84 
 
 		 415 aa  44.7  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.345047  normal  0.129769 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2054  protein of unknown function DUF214  22.78 
 
 		 386 aa  43.9  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.01978e-17 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1761  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  31.97 
 
 		 414 aa  43.9  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.293206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25450  hypothetical protein  26.13 
 
 		 433 aa  43.9  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1809  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolE  27.1 
 
 		 414 aa  43.1  0.009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>