34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_20520 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_20520  DNA binding protein, XRE family  100 
 
 		 76 aa  151  2.9999999999999998e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5258  XRE family transcriptional regulator  58.11 
 
 		 83 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.787301 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15700  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  33.33 
 
 		 507 aa  46.2  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.645755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1180  XRE family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 81 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.133666  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3182  transcriptional regulator, XRE family  42.42 
 
 		 513 aa  45.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0470208  hitchhiker  0.000000000985397 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03640  predicted transcriptional regulator  43.33 
 
 		 98 aa  45.8  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.634668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2898  transcriptional regulator, XRE family  29.85 
 
 		 83 aa  45.1  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4552  XRE family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 76 aa  45.1  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1416  transcriptional regulator, XRE family  45.45 
 
 		 77 aa  44.7  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.239445  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3687  transcriptional regulator, XRE family  36.11 
 
 		 79 aa  44.3  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0814  XRE family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 112 aa  44.3  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5011  XRE family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 126 aa  43.9  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.86875 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2672  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  36.11 
 
 		 508 aa  43.9  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1419  transcriptional regulator, XRE family  38.6 
 
 		 64 aa  43.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.138146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0017  transcriptional regulator, XRE family  41.94 
 
 		 134 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0625  XRE family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 108 aa  42.4  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000512612 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1565  XRE family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 142 aa  42  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.533985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0058  transcriptional regulator, XRE family  32.2 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0711688  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0273  XRE family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 176 aa  41.6  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000144131  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31160  hypothetical protein  37.29 
 
 		 107 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000126154  unclonable  8.75499e-23 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4570  XRE family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 99 aa  41.6  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.27714 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1890  XRE family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 120 aa  41.6  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00515298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01120  hypothetical protein  29.33 
 
 		 84 aa  41.2  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2442  XRE family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 86 aa  41.2  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0461  XRE family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 97 aa  40.8  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.171408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2575  XRE family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 230 aa  40.8  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.556687 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1481  XRE family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 97 aa  40.8  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.817787 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2370  transcriptional regulator, XRE family  30.36 
 
 		 72 aa  40.8  0.007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.209758  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0731  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  35.62 
 
 		 315 aa  40.8  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4969  transcriptional regulator, XRE family  33.93 
 
 		 86 aa  40.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17690  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  30.56 
 
 		 517 aa  40.4  0.009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.356525  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8282  putative transcriptional regulator, XRE family  41.07 
 
 		 92 aa  40.4  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145655  normal  0.802866 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0943  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 182 aa  40  0.01  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4024  putative transcriptional regulator  37.14 
 
 		 195 aa  40  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.181748  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>