223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7583 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011981  Avi_7583  flavin-containing monooxygenase  100 
 
 
423 aa  875    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0063  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  57.21 
 
 
422 aa  491  9.999999999999999e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.191395 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1414  hypothetical protein  56.51 
 
 
429 aa  489  1e-137  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2709  FAD dependent oxidoreductase  56.27 
 
 
429 aa  488  1e-137  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5399  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  57.21 
 
 
422 aa  491  1e-137  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0727587  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4567  FAD dependent oxidoreductase  56.45 
 
 
430 aa  484  1e-135  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.516365  normal  0.469601 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0250  FAD dependent oxidoreductase  56.07 
 
 
422 aa  479  1e-134  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.698807 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2098  FAD dependent oxidoreductase  56.16 
 
 
430 aa  471  1.0000000000000001e-131  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.963187  normal  0.59787 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3472  putative potassium transport flavoprotein  54.01 
 
 
428 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.47986  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1998  putative potassium transport flavoprotein  55.05 
 
 
434 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0556  FAD dependent oxidoreductase  55.88 
 
 
443 aa  462  1e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.881432  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2056  FAD dependent oxidoreductase  52.21 
 
 
445 aa  442  1e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0841  putative potassium transport flavoprotein  50.74 
 
 
446 aa  432  1e-120  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0741556 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4746  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  50 
 
 
428 aa  425  1e-118  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.137781  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2625  hypothetical protein  50.25 
 
 
415 aa  415  9.999999999999999e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.623222  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13111  hypothetical protein  49.12 
 
 
433 aa  411  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4691  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  49.04 
 
 
435 aa  410  1e-113  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1222  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  49.51 
 
 
427 aa  397  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.214163 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1106  potassium transport flavoprotein  49.14 
 
 
433 aa  394  1e-108  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.251507 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1063  FAD dependent oxidoreductase  37.32 
 
 
419 aa  294  2e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4240  putative flavoprotein  38.37 
 
 
412 aa  274  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3266  flavin-containing monooxygenase FMO  36.17 
 
 
435 aa  264  2e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.130445  normal  0.0359587 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5675  flavin-containing monooxygenase FMO  37.84 
 
 
470 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.217019 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6424  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.59 
 
 
448 aa  261  2e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2368  FAD dependent oxidoreductase  35.21 
 
 
449 aa  261  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.620514  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0442  flavin-containing monooxygenase FMO  35.78 
 
 
419 aa  259  8e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6179  hypothetical protein  36.65 
 
 
450 aa  259  9e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3457  FAD dependent oxidoreductase  36.34 
 
 
423 aa  259  9e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.439481  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6042  FAD dependent oxidoreductase  35.31 
 
 
459 aa  256  8e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.058628  hitchhiker  0.000730698 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7004  Flavin-containing monooxygenase  35.7 
 
 
417 aa  254  1.0000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.732454  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71210  hypothetical protein  37.87 
 
 
450 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2048  hypothetical protein  35.96 
 
 
419 aa  254  2.0000000000000002e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2255  putative flavoprotein  39.25 
 
 
419 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.435784  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2389  flavin-containing monooxygenase FMO  36.08 
 
 
448 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.481814  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6991  flavin-containing monooxygenase FMO  36.61 
 
 
446 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.771544  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5404  FAD dependent oxidoreductase  36.54 
 
 
441 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0828166 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2960  PNDR family (class II) oxidoreductase  36.41 
 
 
439 aa  252  1e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.184613  normal  0.426235 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6240  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.52 
 
 
399 aa  248  1e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00083188  normal  0.623853 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0375  flavin-containing monooxygenase FMO  35.35 
 
 
436 aa  248  1e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1664  FAD dependent oxidoreductase  36.25 
 
 
425 aa  246  8e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.896547  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7079  FAD dependent oxidoreductase  36.12 
 
 
440 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0768743 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2348  FAD dependent oxidoreductase  35.68 
 
 
439 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.932043 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3573  monooxygenase, putative  35.89 
 
 
439 aa  243  3e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2201  flavoprotein involved in K+ transport-like protein  35.89 
 
 
439 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.524602  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3030  hypothetical protein  36.65 
 
 
427 aa  237  3e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.101073  normal  0.976263 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3466  hypothetical protein  36.39 
 
 
449 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.653781 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3222  potassium transport flavoprotein  31.05 
 
 
416 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1342  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.47 
 
 
466 aa  194  2e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.883223 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4019  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.33 
 
 
413 aa  190  4e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2581  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.22 
 
 
360 aa  157  4e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.931293  normal  0.367091 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3159  hypothetical protein  26.35 
 
 
344 aa  154  4e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0255917  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1796  CzcD accessory protein  26.83 
 
 
347 aa  150  5e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3452  hypothetical protein  26.72 
 
 
347 aa  149  9e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.749706  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0546  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.88 
 
 
348 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3895  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.78 
 
 
377 aa  138  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3479  hypothetical protein  24.38 
 
 
347 aa  138  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0600523  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3226  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, class II  27.74 
 
 
347 aa  124  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00126129  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3468  hypothetical protein  27.74 
 
 
347 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3163  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, class II  26.91 
 
 
347 aa  124  4e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3253  hypothetical protein  27.96 
 
 
347 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0911616  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3508  hypothetical protein  27.96 
 
 
347 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2590  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.8 
 
 
378 aa  117  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000048825 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3388  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  30.52 
 
 
352 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3741  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  29.82 
 
 
361 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2189  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.19 
 
 
349 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02550  potassium transporter (Trk family)  32.26 
 
 
343 aa  107  3e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2883  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.81 
 
 
372 aa  98.2  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3387  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.49 
 
 
348 aa  98.6  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.557083  normal  0.85465 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5381  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  26.09 
 
 
362 aa  97.4  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2822  putative flavin-binding monooxygenase involved in arsenic resistance  26.33 
 
 
364 aa  93.2  8e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0300735  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3161  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.25 
 
 
358 aa  92.4  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5666  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.96 
 
 
369 aa  91.3  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0188847  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4111  Trk family potassium transport protein  23.71 
 
 
352 aa  88.6  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5581  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.17 
 
 
381 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0864105  normal  0.634678 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5201  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.17 
 
 
381 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3468  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.36 
 
 
381 aa  85.1  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5289  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.17 
 
 
381 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.655733  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3424  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  28.64 
 
 
362 aa  85.5  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.319709  normal  0.250706 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1983  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.86 
 
 
361 aa  84.7  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.264331  normal  0.635094 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26460  predicted flavoprotein involved in K+ transport  33.66 
 
 
396 aa  83.6  0.000000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.319268 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1925  monooxygenase, putative  27.93 
 
 
360 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000362928 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1512  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.27 
 
 
356 aa  78.2  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0481425  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2949  FAD dependent oxidoreductase  29.1 
 
 
382 aa  77.8  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.831286  normal  0.472558 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0413  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.22 
 
 
358 aa  76.3  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.453898  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2934  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 
382 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.217233  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2978  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 
382 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1997  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.03 
 
 
367 aa  76.3  0.000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0299073 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1278  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.62 
 
 
374 aa  75.1  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3146  flavin-containing monooxygenase FMO  28.25 
 
 
371 aa  73.9  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.591176 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28157  putative flavin-containing monooxygenase  25.24 
 
 
640 aa  71.6  0.00000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1566  putative oxidoreductase  30.85 
 
 
363 aa  70.9  0.00000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000646977  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4968  putative flavoprotein  27.03 
 
 
357 aa  71.2  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0923  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.8 
 
 
399 aa  69.3  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2578  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.21 
 
 
427 aa  66.6  0.0000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.720925  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1908  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  30.51 
 
 
357 aa  65.9  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.710657 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18210  Predicted flavoprotein involved in K+ transport  31.85 
 
 
401 aa  65.9  0.000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.304203  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2127  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.65 
 
 
375 aa  64.7  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.83243  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0541  hypothetical protein  26.84 
 
 
558 aa  63.5  0.000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.9586 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1246  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.15 
 
 
385 aa  63.2  0.000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0314824  normal  0.095353 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3826  dimethylaniline monooxygenase (N-oxide forming)  26.21 
 
 
638 aa  62  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>