More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1545 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0766  leucyl aminopeptidase  70.88 
 
 		 497 aa  682    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.133463 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1070  leucyl aminopeptidase  72.43 
 
 		 496 aa  736    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.32941  decreased coverage  0.00000385423 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1214  leucyl aminopeptidase  72.64 
 
 		 496 aa  730    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0455494  decreased coverage  0.00000170751 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1545  leucyl aminopeptidase  100 
 
 		 497 aa  991    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.87214  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1756  leucyl aminopeptidase  65.12 
 
 		 495 aa  630  1e-179  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.09073  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0689  leucyl aminopeptidase  60.24 
 
 		 497 aa  596  1e-169  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.167828  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0680  leucyl aminopeptidase  60.92 
 
 		 497 aa  597  1e-169  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2600  leucyl aminopeptidase  65.82 
 
 		 498 aa  586  1e-166  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.080884  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3832  leucyl aminopeptidase  60.76 
 
 		 499 aa  582  1.0000000000000001e-165  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.454822 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3470  leucyl aminopeptidase  61.2 
 
 		 500 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.987898  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2339  leucyl aminopeptidase  63.76 
 
 		 500 aa  570  1e-161  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1462  leucyl aminopeptidase  59.96 
 
 		 498 aa  569  1e-161  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.428409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1676  leucyl aminopeptidase  59.52 
 
 		 500 aa  565  1e-160  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.933774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2481  leucyl aminopeptidase  60.64 
 
 		 500 aa  562  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2314  leucyl aminopeptidase  64.22 
 
 		 499 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.916882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3337  leucyl aminopeptidase  56.83 
 
 		 497 aa  538  9.999999999999999e-153  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.39658 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2965  leucyl aminopeptidase  61.16 
 
 		 500 aa  538  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.434941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0650  leucyl aminopeptidase  58.59 
 
 		 542 aa  525  1e-148  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0557  leucyl aminopeptidase  59.83 
 
 		 503 aa  527  1e-148  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0287473 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2221  Leucyl aminopeptidase  59.92 
 
 		 539 aa  523  1e-147  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.258541 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5835  peptidase M17 leucyl aminopeptidase domain protein  58.33 
 
 		 500 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.829477  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3937  Leucyl aminopeptidase  56.18 
 
 		 497 aa  511  1e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0971426 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3944  Leucyl aminopeptidase  55.38 
 
 		 497 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.253806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3651  leucyl aminopeptidase  55.58 
 
 		 497 aa  504  1e-141  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5097  leucyl aminopeptidase  59.65 
 
 		 500 aa  490  1e-137  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803796  normal  0.160134 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0454  leucyl aminopeptidase  53.8 
 
 		 500 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2531  leucyl aminopeptidase  55.97 
 
 		 493 aa  457  1e-127  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.353426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1191  leucyl aminopeptidase  51.75 
 
 		 488 aa  436  1e-121  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.239585  normal  0.359971 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3051  Leucyl aminopeptidase  50.4 
 
 		 487 aa  432  1e-120  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00163591  normal  0.235432 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1227  leucyl aminopeptidase  49.16 
 
 		 494 aa  434  1e-120  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.11793  normal  0.494822 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1204  leucyl aminopeptidase  50.77 
 
 		 514 aa  427  1e-118  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.453819  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0054  leucyl aminopeptidase  51.37 
 
 		 500 aa  412  1e-114  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1815  leucyl aminopeptidase  51.27 
 
 		 488 aa  412  1e-114  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.453666 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1122  leucyl aminopeptidase  50.66 
 
 		 489 aa  409  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.289699 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1761  leucyl aminopeptidase  50.56 
 
 		 481 aa  411  1e-113  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.297998 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0412  leucyl aminopeptidase  51.89 
 
 		 489 aa  403  1e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0249677 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0642  leucyl aminopeptidase  50.23 
 
 		 500 aa  392  1e-108  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0369  leucyl aminopeptidase  50.69 
 
 		 500 aa  393  1e-108  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0890  leucyl aminopeptidase  58.78 
 
 		 485 aa  388  1e-106  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.119935  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1543  leucyl aminopeptidase  56.15 
 
 		 489 aa  382  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2899  leucyl aminopeptidase  56.15 
 
 		 489 aa  382  1e-104  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.886783  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0903  leucyl aminopeptidase  46.04 
 
 		 533 aa  366  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0577205 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0200  aminopeptidase A/I  45.02 
 
 		 497 aa  355  1e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000277663  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0950  leucyl aminopeptidase  53.13 
 
 		 491 aa  354  2e-96  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.111685  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1516  leucyl aminopeptidase  43.83 
 
 		 491 aa  350  4e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0890319 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11650  leucyl aminopeptidase  42.63 
 
 		 496 aa  347  2e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1271  cytosol aminopeptidase  42.05 
 
 		 496 aa  341  2e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1091  leucyl aminopeptidase  42.69 
 
 		 496 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0475  cytosol aminopeptidase  44.97 
 
 		 506 aa  340  4e-92  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00320613  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0989  leucyl aminopeptidase  42.12 
 
 		 496 aa  339  5e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3082  leucyl aminopeptidase  43.13 
 
 		 498 aa  338  9e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0737217 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0222  leucyl aminopeptidase  43.64 
 
 		 496 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0191998  normal  0.929203 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2725  leucyl aminopeptidase  41.5 
 
 		 492 aa  336  5.999999999999999e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00941459  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0699  leucyl aminopeptidase  44.06 
 
 		 487 aa  335  1e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0267193  normal  0.882342 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0746  leucyl aminopeptidase  41.63 
 
 		 518 aa  334  3e-90  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.483343  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0616  leucyl aminopeptidase  43.42 
 
 		 508 aa  333  4e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.294283 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1725  Leucyl aminopeptidase  46.5 
 
 		 496 aa  332  8e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0978  Leucyl aminopeptidase  45.48 
 
 		 506 aa  332  9e-90  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1921  PepA aminopeptidase  45.79 
 
 		 496 aa  329  8e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.428802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3514  leucyl aminopeptidase  40.9 
 
 		 510 aa  329  8e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2389  leucyl aminopeptidase  44.15 
 
 		 556 aa  329  9e-89  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0738051 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4237  leucyl aminopeptidase  44.62 
 
 		 497 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0897  leucyl aminopeptidase  40.32 
 
 		 518 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0289  leucyl aminopeptidase  41.81 
 
 		 501 aa  327  2.0000000000000001e-88  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.823293  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3443  Leucyl aminopeptidase  40.9 
 
 		 510 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3637  leucyl aminopeptidase  40.9 
 
 		 510 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1748  leucyl aminopeptidase  41.65 
 
 		 493 aa  327  3e-88  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0850  leucyl aminopeptidase  40.67 
 
 		 510 aa  327  4.0000000000000003e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4252  leucyl aminopeptidase  44.27 
 
 		 495 aa  326  5e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0961  leucyl aminopeptidase  43.58 
 
 		 500 aa  324  2e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2787  leucyl aminopeptidase  48.97 
 
 		 499 aa  324  3e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.151843  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1282  leucyl aminopeptidase  40.71 
 
 		 495 aa  323  3e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3527  leucyl aminopeptidase  42.43 
 
 		 512 aa  323  4e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00117428  normal  0.357164 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14470  leucyl aminopeptidase  40.71 
 
 		 495 aa  322  9.000000000000001e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3361  leucyl aminopeptidase  42.92 
 
 		 496 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000650646  hitchhiker  0.00562163 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0802  leucyl aminopeptidase  40.22 
 
 		 511 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.515855 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3221  leucyl aminopeptidase  40.22 
 
 		 511 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0980  leucyl aminopeptidase  42.92 
 
 		 497 aa  320  3e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0986  leucyl aminopeptidase  43.25 
 
 		 497 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.481713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3324  peptidase M17, leucyl aminopeptidase domain-containing protein  40.22 
 
 		 511 aa  319  7e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2099  aminopeptidase A/I  42.7 
 
 		 497 aa  318  1e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.41187  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2140  Leucyl aminopeptidase  42.12 
 
 		 496 aa  318  1e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.727293  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1233  Leucyl aminopeptidase  52.43 
 
 		 536 aa  318  1e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2996  leucyl aminopeptidase  40.54 
 
 		 515 aa  318  2e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.143119 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2102  leucyl aminopeptidase  39.79 
 
 		 512 aa  318  2e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1018  leucyl aminopeptidase  42.79 
 
 		 497 aa  317  3e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4007  leucyl aminopeptidase  40.65 
 
 		 486 aa  317  3e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.502988 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0623  leucyl aminopeptidase  48.18 
 
 		 536 aa  317  3e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000022147  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0984  leucyl aminopeptidase  41.19 
 
 		 508 aa  316  5e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0959  cytosol aminopeptidase  40.54 
 
 		 511 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3638  leucyl aminopeptidase  41.37 
 
 		 508 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0558  PepA aminopeptidase  46.3 
 
 		 497 aa  315  9.999999999999999e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.548083  hitchhiker  0.0000733214 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0295  leucyl aminopeptidase  43.42 
 
 		 488 aa  314  1.9999999999999998e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0332  leucyl aminopeptidase  44.52 
 
 		 496 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00199325  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0516  leucyl aminopeptidase  37.25 
 
 		 495 aa  313  2.9999999999999996e-84  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.204663  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1372  PepA aminopeptidase  43.5 
 
 		 500 aa  313  4.999999999999999e-84  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00219967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0828  leucyl aminopeptidase  40.52 
 
 		 503 aa  313  6.999999999999999e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.871802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2947  leucyl aminopeptidase  40.79 
 
 		 503 aa  311  2e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.76246  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2679  leucyl aminopeptidase  40.86 
 
 		 502 aa  311  2e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.273234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1016  leucyl aminopeptidase  40.76 
 
 		 482 aa  311  2e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>