52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0403 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_0403  hypothetical protein  100 
 
 
143 aa  288  2e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2246  protein of unknown function DUF107  60.43 
 
 
143 aa  177  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0353999 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0479  protein of unknown function DUF107  56.62 
 
 
147 aa  161  3e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0465  protein of unknown function DUF107  56.62 
 
 
147 aa  161  3e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1951  hypothetical protein  55.8 
 
 
154 aa  159  1e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.370736  normal  0.0226545 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0532  protein of unknown function DUF107  52.21 
 
 
167 aa  135  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.710342 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0062  hypothetical protein  30.66 
 
 
140 aa  62  0.000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0560345  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0062  hypothetical protein  29.93 
 
 
140 aa  60.8  0.000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.351134  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1505  hypothetical protein  30.5 
 
 
147 aa  60.1  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.121654  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2311  protein of unknown function DUF107  32.65 
 
 
143 aa  56.6  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00380708  hitchhiker  0.000930423 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06891  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity  35.33 
 
 
147 aa  53.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0728  hypothetical protein  25 
 
 
152 aa  52.4  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2365  hypothetical protein  30.07 
 
 
157 aa  52.8  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3005  protein of unknown function DUF107  32.12 
 
 
144 aa  51.2  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3072  hypothetical protein  29.17 
 
 
159 aa  48.9  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0660116  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0493  protein of unknown function DUF107  33.11 
 
 
156 aa  49.7  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000358021  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4507  hypothetical protein  29.73 
 
 
153 aa  48.5  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0857402  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1335  hypothetical protein  29.71 
 
 
154 aa  48.1  0.00004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3850  hypothetical protein  32.19 
 
 
156 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0149984  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0545  hypothetical protein  31.51 
 
 
156 aa  47.4  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000254909  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4625  hypothetical protein  30.77 
 
 
145 aa  47  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.165584 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3388  hypothetical protein  30.56 
 
 
153 aa  47  0.00008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000297052  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2226  putative integral membrane protein  29.66 
 
 
146 aa  47  0.00009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2309  hypothetical protein  27.54 
 
 
149 aa  46.2  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2128  hypothetical protein  26.9 
 
 
165 aa  46.6  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.639111 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0490  hypothetical protein  31.51 
 
 
156 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0469  hypothetical protein  31.51 
 
 
156 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000206621  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4130  hypothetical protein  30.72 
 
 
154 aa  45.8  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4711  hypothetical protein  32.87 
 
 
145 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.396133 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4844  hypothetical protein  31.16 
 
 
147 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0414  hypothetical protein  29.86 
 
 
155 aa  44.7  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0427482  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4833  SURF1 domain-containing protein  33.58 
 
 
143 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.474537  normal  0.511856 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0462  hypothetical protein  29.17 
 
 
159 aa  44.7  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3678  hypothetical protein  29.33 
 
 
156 aa  44.3  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000205665  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0609  protein of unknown function DUF107  28.77 
 
 
154 aa  44.3  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02751  hypothetical protein  37.7 
 
 
157 aa  44.7  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.465338 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0449  hypothetical protein  29.33 
 
 
156 aa  44.3  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00108597  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3503  hypothetical protein  29.33 
 
 
156 aa  44.3  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000560855  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1881  hypothetical protein  28.47 
 
 
150 aa  43.9  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0471447  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3263  hypothetical protein  31.21 
 
 
143 aa  43.5  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.154765  normal  0.527503 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4889  hypothetical protein  31.47 
 
 
145 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0908212  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1704  nucleolar GTP-binding 1  30.41 
 
 
154 aa  42.7  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2577  hypothetical protein  29.29 
 
 
153 aa  42  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.869725  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18360  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity  33.09 
 
 
141 aa  41.6  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.54278  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0138  protein of unknown function DUF107  30.99 
 
 
151 aa  41.2  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0361  hypothetical protein  27.74 
 
 
141 aa  41.2  0.005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.213386 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3440  protein of unknown function DUF107  30.07 
 
 
146 aa  40.8  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.782019  normal  0.877312 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3436  hypothetical protein  32.94 
 
 
152 aa  40.8  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0488184  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0463  hypothetical protein  27.33 
 
 
157 aa  40.4  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000652394  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2413  protein of unknown function DUF107  29.79 
 
 
141 aa  40.4  0.009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000357  nfed family protein  30.56 
 
 
458 aa  40.4  0.009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3654  hypothetical protein  28.87 
 
 
144 aa  40  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.642811  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>