More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2966 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_2966  SSU ribosomal protein S17P  100 
 
 		 102 aa  203  6e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0649614  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2678  ribosomal protein S17  84.31 
 
 		 101 aa  175  2e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0636  ribosomal protein S17  83.53 
 
 		 98 aa  150  5.9999999999999996e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.757439  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3134  ribosomal protein S17  76.34 
 
 		 99 aa  148  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0596  ribosomal protein S17  85.54 
 
 		 90 aa  148  3e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.729409  normal  0.989269 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2650  30S ribosomal protein S17  71.57 
 
 		 96 aa  147  6e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0697  ribosomal protein S17  75.56 
 
 		 94 aa  144  4.0000000000000006e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.409644 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29650  SSU ribosomal protein S17P  70.48 
 
 		 100 aa  144  6e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.370615 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1132  ribosomal protein S17  70.09 
 
 		 107 aa  139  9e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4498  30S ribosomal protein S17  69.61 
 
 		 99 aa  137  4.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23720  SSU ribosomal protein S17P  75.86 
 
 		 108 aa  135  2e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0423022  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6040  30S ribosomal protein S17  63.73 
 
 		 102 aa  135  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.216935  normal  0.12601 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3896  SSU ribosomal protein S17P  75.86 
 
 		 93 aa  135  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4306  30S ribosomal protein S17  75.29 
 
 		 91 aa  134  3.0000000000000003e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.174188  normal  0.0110143 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1095  30S ribosomal protein S17  67.65 
 
 		 93 aa  135  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0840523 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20780  SSU ribosomal protein S17P  67.33 
 
 		 102 aa  134  6.0000000000000005e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.977341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0940  ribosomal protein S17  77.38 
 
 		 93 aa  134  6.0000000000000005e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.138584  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5133  30S ribosomal protein S17  75.61 
 
 		 90 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.768581 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3914  30S ribosomal protein S17  72.94 
 
 		 91 aa  130  3.9999999999999996e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.513406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0591  30S ribosomal protein S17  64 
 
 		 102 aa  130  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0315  SSU ribosomal protein S17P  66.67 
 
 		 96 aa  131  3.9999999999999996e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000814875 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2637  30S ribosomal protein S17  74.12 
 
 		 91 aa  130  5e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.107035  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17070  SSU ribosomal protein S17P  69.32 
 
 		 93 aa  130  6e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000664642  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3426  30S ribosomal protein S17  63.73 
 
 		 94 aa  129  2.0000000000000002e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.684223  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10724  30S ribosomal protein S17  75.61 
 
 		 135 aa  128  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.706337  normal  0.247465 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04070  SSU ribosomal protein S17P  75.61 
 
 		 93 aa  127  4.0000000000000003e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0571  30S ribosomal protein S17  74.39 
 
 		 96 aa  127  7.000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6605  ribosomal protein S17  65.69 
 
 		 93 aa  126  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5040  ribosomal protein S17  72.62 
 
 		 98 aa  124  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0780546  normal  0.167049 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3749  30S ribosomal protein S17  63.73 
 
 		 94 aa  122  1e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1049  SSU ribosomal protein S17P  63.64 
 
 		 99 aa  120  5e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.672161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1022  SSU ribosomal protein S17P  63.64 
 
 		 99 aa  120  5e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0401706  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1039  SSU ribosomal protein S17P  63.64 
 
 		 99 aa  120  5e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0891213  normal  0.306486 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1716  30S ribosomal protein S17  65.88 
 
 		 86 aa  120  8e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1314  ribosomal protein S17  71.95 
 
 		 98 aa  120  8e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.959285  normal  0.220236 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4312  ribosomal protein S17  68.89 
 
 		 94 aa  119  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.572719  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1194  30S ribosomal protein S17  74.68 
 
 		 88 aa  119  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.073144 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0224  30S ribosomal protein S17  65.43 
 
 		 88 aa  114  6.9999999999999995e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443276  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0876  30S ribosomal protein S17  64.63 
 
 		 84 aa  113  8.999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.014165  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0611  ribosomal protein S17  63.86 
 
 		 84 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.758418 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2702  30S ribosomal protein S17  66.27 
 
 		 89 aa  111  3e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3658  ribosomal protein S17  67.47 
 
 		 85 aa  111  3e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000233058  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2705  30S ribosomal protein S17  67.47 
 
 		 84 aa  111  3e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2390  30S ribosomal protein S17  66.27 
 
 		 84 aa  110  6e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2451  30S ribosomal protein S17  63.86 
 
 		 84 aa  109  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.20438 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0767  ribosomal protein S17  63.86 
 
 		 85 aa  109  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000021976  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1736  30S ribosomal protein S17  63.86 
 
 		 86 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000020777  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0851  ribosomal protein S17  63.86 
 
 		 101 aa  104  3e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1515  30S ribosomal protein S17  57.83 
 
 		 99 aa  103  1e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.585165  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00739  30S ribosomal protein S17  59.49 
 
 		 84 aa  103  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2414  30S ribosomal protein S17  52.04 
 
 		 101 aa  102  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000854587  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2912  30S ribosomal protein S17  57.83 
 
 		 85 aa  100  7e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001733  SSU ribosomal protein S17p (S11e)  58.23 
 
 		 84 aa  100  7e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000075143  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1624  ribosomal protein S17  56.63 
 
 		 85 aa  100  9e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5778  30S ribosomal protein S17  56.63 
 
 		 120 aa  100  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.274363  normal  0.420923 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0234  ribosomal protein S17  57.83 
 
 		 85 aa  99.4  1e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0120  30S ribosomal protein S17  63.41 
 
 		 87 aa  99.8  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.326224  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3153  30S ribosomal protein S17  60.98 
 
 		 87 aa  99.8  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.609062 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0329  30S ribosomal protein S17  60.26 
 
 		 84 aa  99.4  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00017601  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0431  30S ribosomal protein S17  62.2 
 
 		 86 aa  100  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000081271  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2165  30S ribosomal protein S17  60.26 
 
 		 84 aa  98.6  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000168  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0710  30S ribosomal protein S17  60 
 
 		 88 aa  98.6  3e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000605454  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0635  30S ribosomal protein S17  58.02 
 
 		 85 aa  98.2  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000424203  hitchhiker  0.0000000101363 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0113  30S ribosomal protein S17  60.98 
 
 		 87 aa  97.8  4e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000389804  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0150  30S ribosomal protein S17  60.98 
 
 		 87 aa  97.4  5e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000108118  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3992  30S ribosomal protein S17  61.04 
 
 		 84 aa  97.4  5e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000847939  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0119  30S ribosomal protein S17  60.98 
 
 		 87 aa  97.4  5e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000418138  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0119  30S ribosomal protein S17  60.98 
 
 		 87 aa  97.4  5e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000013779  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0115  30S ribosomal protein S17  60.98 
 
 		 87 aa  97.4  5e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.46917e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0113  30S ribosomal protein S17  60.98 
 
 		 87 aa  97.4  5e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000152828  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0114  30S ribosomal protein S17  60.98 
 
 		 87 aa  97.4  5e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000376744  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0119  30S ribosomal protein S17  60.98 
 
 		 87 aa  97.4  5e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000491132  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0131  30S ribosomal protein S17  60.98 
 
 		 87 aa  97.4  5e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.17978e-62 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1175  ribosomal protein S17  60.24 
 
 		 94 aa  97.8  5e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00103981  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0140  30S ribosomal protein S17  60.98 
 
 		 87 aa  97.4  5e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000717207  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5186  30S ribosomal protein S17  60.98 
 
 		 87 aa  97.4  5e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000132516  unclonable  9.769680000000001e-26 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0942  30S ribosomal protein S17  60 
 
 		 85 aa  97.1  7e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00308602  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0116  30S ribosomal protein S17  59.76 
 
 		 87 aa  97.4  7e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0295  ribosomal protein S17  57.14 
 
 		 87 aa  97.1  8e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00205057  normal  0.0615063 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0188  30S ribosomal protein S17  58.54 
 
 		 86 aa  96.7  9e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.27191 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0402  ribosomal protein S17  59.74 
 
 		 84 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000755989  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3794  30S ribosomal protein S17  59.74 
 
 		 84 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000413516  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3627  30S ribosomal protein S17  59.74 
 
 		 84 aa  96.3  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000562694  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0067  30S ribosomal protein S17  62.2 
 
 		 86 aa  96.3  1e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.1837  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3813  30S ribosomal protein S17  59.74 
 
 		 84 aa  95.9  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000352623  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2055  30S ribosomal protein S17  54.26 
 
 		 99 aa  96.7  1e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000336499  normal  0.395653 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1920  30S ribosomal protein S17  58.54 
 
 		 85 aa  96.3  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.826822 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3606  30S ribosomal protein S17  59.74 
 
 		 84 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000146035  normal  0.0220451 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3700  30S ribosomal protein S17  59.74 
 
 		 84 aa  96.3  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000665408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3735  30S ribosomal protein S17  59.74 
 
 		 84 aa  96.3  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000974473  normal  0.0213342 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3627  30S ribosomal protein S17  59.74 
 
 		 84 aa  96.3  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00167821  normal  0.881176 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3742  30S ribosomal protein S17  59.74 
 
 		 84 aa  96.3  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000425306  hitchhiker  0.00355064 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3696  30S ribosomal protein S17  59.74 
 
 		 84 aa  96.3  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000629724  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0402  30S ribosomal protein S17  59.74 
 
 		 84 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000858813  hitchhiker  0.0000630078 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1075  30S ribosomal protein S17  55.56 
 
 		 102 aa  96.7  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000193929  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3505  30S ribosomal protein S17  59.74 
 
 		 84 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000141629  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4634  30S ribosomal protein S17  59.74 
 
 		 84 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000429697  normal  0.304682 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03113  hypothetical protein  59.74 
 
 		 84 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00156817  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0292  30S ribosomal protein S17  59.74 
 
 		 84 aa  96.3  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000607542  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0728  30S ribosomal protein S17  59.74 
 
 		 88 aa  95.9  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00313213  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>