108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2034 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_2034  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  100 
 
 
241 aa  480  1e-135  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0321774  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3032  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  47.89 
 
 
225 aa  151  7e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0343994  normal  0.0106587 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4709  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  36.08 
 
 
240 aa  119  4e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.618001 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5184  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  41.03 
 
 
232 aa  118  7e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.184935 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3210  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  41.1 
 
 
237 aa  115  5e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.924727  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1572  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  40.41 
 
 
241 aa  114  1e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.615405  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4318  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  37.45 
 
 
225 aa  114  2e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.531167  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4922  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  37.32 
 
 
295 aa  113  3e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.102122  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13140  hypothetical protein  44.52 
 
 
262 aa  112  5e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10374  oxidoreductase  36.59 
 
 
200 aa  110  2e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00057735  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4601  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  36.36 
 
 
240 aa  109  4e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4689  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  36.36 
 
 
240 aa  109  4e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.969168 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4984  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  36.36 
 
 
240 aa  109  4e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.990283 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0505  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  38.01 
 
 
222 aa  109  5e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.746959  normal  0.248334 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0483  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  38.01 
 
 
222 aa  109  5e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.237703  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0494  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  38.01 
 
 
222 aa  109  5e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.462994  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1217  hypothetical protein  32.46 
 
 
289 aa  108  7e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0793988 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0119  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  37.5 
 
 
147 aa  107  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.128418  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0232  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  39.16 
 
 
198 aa  107  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1865  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  32.28 
 
 
254 aa  103  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4237  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  33.33 
 
 
469 aa  102  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0120  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  36.05 
 
 
212 aa  101  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.391115  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3967  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  35.22 
 
 
246 aa  100  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4106  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  36.11 
 
 
208 aa  100  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.875742  normal  0.142553 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1563  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  37.27 
 
 
234 aa  100  3e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0593  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  36.05 
 
 
244 aa  98.6  8e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1636  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  31.03 
 
 
237 aa  94  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2147  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxG subunit  30.28 
 
 
208 aa  92  7e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.295033  normal  0.334057 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0032  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxG subunit  29.77 
 
 
206 aa  91.3  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.262475 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2767  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  33.12 
 
 
185 aa  90.5  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0642  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  31.76 
 
 
251 aa  90.9  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4562  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  34.03 
 
 
306 aa  87.4  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5312  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  31.76 
 
 
232 aa  82  7e-15  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1564  carbon monoxide dehydrogenase, large subunit apoprotein  25.15 
 
 
1027 aa  79.7  4e-14  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.151361  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3032  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.74 
 
 
182 aa  70.9  2e-11  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.128419  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3140  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.74 
 
 
182 aa  70.5  2e-11  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0169757  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2253  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.33 
 
 
243 aa  68.9  6e-11  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0481685 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2945  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.56 
 
 
182 aa  65.5  8e-10  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0435616  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1056  hypothetical protein  26 
 
 
241 aa  62.8  5e-09  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.184946  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4285  (2Fe-2S)-binding domain protein  30.14 
 
 
405 aa  62.4  6e-09  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5319  putative carbon monoxide dehydrogenase, coxG accessory protein  27.78 
 
 
148 aa  62  7e-09  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.500561 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4327  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.47 
 
 
154 aa  61.6  1e-08  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.510988  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4415  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  30.43 
 
 
150 aa  60.1  3e-08  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1464  hypothetical protein  26.79 
 
 
213 aa  60.1  3e-08  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.273128 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3792  ferredoxin:(2Fe-2S)-binding:carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.47 
 
 
390 aa  60.5  3e-08  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.100636  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3597  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.49 
 
 
254 aa  60.1  3e-08  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0237636  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0339  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  24.44 
 
 
241 aa  60.1  3e-08  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.30715 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2963  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.03 
 
 
216 aa  59.7  4e-08  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.748718  normal  0.0394978 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2531  hypothetical protein  30.94 
 
 
161 aa  59.3  5e-08  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0528604 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1630  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.21 
 
 
155 aa  58.5  9e-08  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.442595  normal  0.5824 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20930  hypothetical protein  25.91 
 
 
221 aa  58.2  1e-07  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.451934  normal  0.0186523 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3679  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.08 
 
 
151 aa  57.4  2e-07  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0168  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.57 
 
 
220 aa  57  3e-07  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0844  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  23.7 
 
 
249 aa  57  3e-07  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.777561  hitchhiker  0.00161698 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5438  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.37 
 
 
154 aa  56.2  4e-07  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.304437 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2608  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.35 
 
 
148 aa  56.6  4e-07  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3719  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  29.29 
 
 
983 aa  56.2  5e-07  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0365  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  23.74 
 
 
198 aa  55.5  7e-07  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3377  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.5 
 
 
155 aa  55.5  7e-07  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.370754  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1525  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  24.11 
 
 
176 aa  55.8  7e-07  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.187738  normal  0.0565449 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0646  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  27.85 
 
 
405 aa  55.5  8e-07  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2661  putative carbon monoxide dehydrogenase  25.32 
 
 
176 aa  55.5  8e-07  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.283506  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1874  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.51 
 
 
223 aa  55.1  9e-07  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1781  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.39 
 
 
153 aa  54.7  1e-06  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.378744 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4550  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  23.2 
 
 
227 aa  54.7  1e-06  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.735777  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2879  hypothetical protein  24.11 
 
 
176 aa  55.1  1e-06  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.434233  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0090  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  23.74 
 
 
193 aa  55.1  1e-06  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0573  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.8 
 
 
197 aa  54.3  2e-06  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3553  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  31.97 
 
 
157 aa  54.3  2e-06  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.530671  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1141  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.01 
 
 
178 aa  53.1  3e-06  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.654627  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2206  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.17 
 
 
148 aa  53.1  4e-06  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0292084  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1748  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.49 
 
 
154 aa  53.1  4e-06  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4356  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxG subunit  25.2 
 
 
232 aa  52.4  6e-06  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5697  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  22.82 
 
 
400 aa  52.4  7e-06  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00407946 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0072  putative carbon monoxide dehydrogenase subunit G  24.12 
 
 
246 aa  51.6  1e-05  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.766775  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2052  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  27.2 
 
 
1011 aa  50.4  2e-05  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.806962 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1744  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  27.2 
 
 
1011 aa  50.4  2e-05  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.919932 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0470  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  24.32 
 
 
213 aa  51.2  2e-05  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0848  carbon-monoxide dehydrogenase  26.53 
 
 
997 aa  50.4  2e-05  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.682595 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4723  carbon-monoxide dehydrogenase (acceptor)  28.03 
 
 
991 aa  50.1  3e-05  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.102833  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3913  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  24.16 
 
 
221 aa  50.1  3e-05  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0164888  normal  0.240658 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3097  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.5 
 
 
147 aa  50.1  3e-05  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.889249  normal  0.544468 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2227  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25 
 
 
229 aa  50.1  3e-05  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.237222 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0006  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  24.66 
 
 
156 aa  50.4  3e-05  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.35222  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0360  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.34 
 
 
187 aa  49.7  4e-05  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0056  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  24.09 
 
 
151 aa  49.3  5e-05  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.752516  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6656  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  24.82 
 
 
222 aa  49.3  6e-05  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0040  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  24.09 
 
 
151 aa  48.9  6e-05  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.269242 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0298  hypothetical protein  23.13 
 
 
150 aa  48.9  8e-05  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.936429  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4535  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  23.53 
 
 
202 aa  48.5  9e-05  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1814  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.04 
 
 
208 aa  48.1  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.96745  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0284  hypothetical protein  23.13 
 
 
150 aa  48.5  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.364944  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0420  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.5 
 
 
182 aa  47.8  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.110218  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0971  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  24.62 
 
 
269 aa  47  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00301105  normal  0.374469 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1231  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  19.55 
 
 
150 aa  47.4  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.99571  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3296  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  25.35 
 
 
987 aa  47  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0204451  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1349  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  24.36 
 
 
224 aa  46.2  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.224808  normal  0.101404 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2526  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.17 
 
 
181 aa  46.6  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1413  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  24.36 
 
 
224 aa  46.2  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.271744  normal  0.135915 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2090  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.33 
 
 
151 aa  45.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.679244  normal  0.391598 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>